Báo cáo Sử dụng kỹ thuật Microsatellite để đánh giá tính đa dạng di truyền và cấu trúc di truyền của quần thể bò nuôi ở tỉnh Hà Giang

Mục tiêu của nghiên cứu này nhằm đánh giá tính đa dạng và cấu trúc di truyền của quần thể bò nuôi ở tỉnh Hà Giang. Hai mươi ba (23) locút microsatellite được sử dụng để phân tích kiểu gen trên 530 cá thể bò được thu thập trên 28 xã thuộc 8 huyện ở Hà Giang. Tổng số 205 alen được xác định trong toàn bộ quần thể, trung bình số alen trên một locút là 8,9 ± 2,05, tần số dị hợp tử quan sát và mong đợi theo lý thuyết tương ứng là 0,67 và 0,73. Giá...
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Báo cáo " Sử dụng kỹ thuật Microsatellite để đánh giá tính đa dạng di truyền và cấu trúc di truyền của quần thể bò nuôi ở tỉnh Hà Giang "Tạp chí Khoa học ĐHQGHN, Khoa học Tự nhiên và Công nghệ 24 (2008) 310-317 S d ng k thu t Microsatellite ñ ñánh giá tính ña d ng di truy n và c u trúc di truy n c a qu n th bò nuôi t nh Hà Giang Ph m Doãn Lân1,*, Nguy n Tr ng Bình1, Vũ Chí Cương1, Jean- Charles Maillard2 1 Vi n Chăn nuôi, Th y Phương, T Liêm, Hà N i, Vi t Nam 2 Giám ñ c CIRAD vùng ðông Nam Á,35 ði n Biên Ph , Hà N i, Vi t Nam Nh n ngày 29 tháng 10 năm 2008 Tóm t t. M c tiêu c a nghiên c u này nh m ñ ánh giá tính ña d n g và c u trúc di truy n c a qu n th bò nuôi t nh Hà Giang. Hai mươi ba (23) locút microsatellite ñư c s d ng ñ phân tích ki u gen trên 530 cá th bò ñ ư c thu th p trên 28 xã thu c 8 huy n Hà Giang. T n g s 205 alen ñư c xác ñ nh trong toàn b qu n th , trung bình s alen trên m t locút là 8,9 ± 2,05, t n s d h p t quan sát và mong ñ i theo lý thuy t tương n g là 0,67 và 0,73. Giá tr thông tin ña hình (PIC) c a t ng locút n m trong kho ng t 0,50 ñ n 0,84. Giá tr trung bình sai khác di truy n gi a qu n th bò các huy n là r t nh (FST= 0,013). C u trúc di truy n qu n th ñư c xác ñ nh b ng ph n m m STRUCTURE d a trên s phân tích tương ñ ng các alen c a ñ n g th i trên toàn b các locút cho th y qu n th bò Hà Giang ñư c phân thành 2 nhóm (qu n th ph ) khác nhau v di truy n. Keywords: ða d ng di truy n, qu n th , c u trúc qu n th , microsatellite. k thu t h u hi u và ñư c s d ng r ng rãi ∗1. ð t v n ñ trong các nghiên c u di truy n qu n th ñ c bi t ñ i v i các d án b o t n b i vì vi c xác ñ nh ða d ng di truy n trong b n thân m t l oài tính ña d ng di truy n c a m t q u n th hayv t nuôi nào ñó là s th hi n tr ng thái c u trúc m t gi ng v t nuôi là m t yêu c u trư c tiên vàkhác nhau gi a h gen c a các cá th , h hàng, r t c n thi t ñ ñ ưa ra nh ng quy t ñ nh b ocác dòng và gi ng. Do v y, các k thu t ch th t n. S d ng k thu t microsatellites ñ nghiênphân t ADN (DNA-based markers) là nh ng c u ña d ng di truy n ñ ã ñư c th c hi n trêncông c h u í ch ñ ñánh giá ña d ng di truy n nhi u loài v t nuôi khác nhau như: trâu, bò, dê,và quan h h hàng gi a và trong các qu n th l n gà [1-10].ñ ng v t. Trong nh ng năm g n ñây, nhi u l o ich th ADN ñã ñư c s d ng trong các nghiên Hà Giang là m t t nh mi n núi phía B c vàc u ña d ng di truy n như: RFLP, RAPD, là khu v c có nhi u ñ i núi nh t c a Vi t Nam.minisatellites và microsatellites. Trong ñó, k Hà Giang có t i 24 dân t c cùng sinh s ngthu t micrrosatellite ñã nhanh chóng tr thành trong ñó dân t c H’mông chi m ch y u. Trong s các loài v t nuôi thì bò là m t trong nh ng_______ v t nuôi ch y u và ñóng vai trò quan tr ng ñ i∗ Tác gi liên h . ð T: 84-4-22166147. v i ngư i dân t nh Hà Giang nh m ph c v E-mail: pdlanvn@yahoo.com 310 311 P.D. Lân và nnk. / Tạp chí Khoa học ĐHQGHN, Khoa học Tự Nhiên và Công nghệ 24 (2008) 310-317canh tác nông nghi p và s n xu t th t Hi n t i huỳnh quang theo các nhóm D2, D3 và D4toàn t nh có kho ng 80 nghìn con. Theo Lê Vi t ñ u 5’ dùng cho máy gi i trình t c a hãngL y và c ng s (1999) [11], bò H’mông là m t Beckman Coulter - M . Các c p m i này ñư cgi ng bò ñ c trưng c a t nh Hà Giang ñư c chu n hóa trong 6 multiplex PCR.nuôi gi b i ñ ng bào dân t c H’mông vùng Ph n ng nhân gen PCR ñ i v i m i multiplexcao và ñư c nuôi gi theo phương th c chăn ñư c th c hi n trong t ng th tích 25µl g m có:th t do. Tuy nhiên, chưa có nghiên c u nào ...