Đặc điểm di truyền của virus dịch tả heo châu Phi từ các ổ dịch tại một số tỉnh phía Nam từ 2019 đến 2020

Nghiên cứu phân tích cây sinh dòng dựa trên gen mã hóa p72 cho thấy các chủng duy nhất thuộc genotype II, nằm cùng phân nhánh và tương đồng rất cao với các chủng đã được công bố trước đây ở Phía Bắc nước ta (2019) và Trung Quốc (2018). Sự tương đồng cao khi so sánh giữa chủng thực địa với các chủng ứng viên vắc-xin hiện nay cho thấy sự hứa hẹn về khả năng hiệu quả. Mời các bạn tham khảo!
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Đặc điểm di truyền của virus dịch tả heo châu Phi từ các ổ dịch tại một số tỉnh phía Nam từ 2019 đến 2020 KHOA HỌC KỸ THUẬT THÚ Y TẬP XXVIII SỐ 9 - 2021 ÑAËC ÑIEÅM DI TRUYEÀN CUÛA VIRUS DÒCH TAÛ HEO CHAÂU PHI TÖØ CAÙC OÅ DÒCH TAÏI MOÄT SOÁ TÆNH PHÍA NAM TÖØ 2019 ÑEÁN 2020 Ngô Thị Ngọc Trâm1, Nguyễn Thị Mỹ Duyên1, Nguyễn Quang Hợp1, Nguyễn Minh Nam2, Đỗ Tiến Duy1*, *Email: duy.dotien@hcmuaf.edu.vn TÓM TẮT Dịch tả heo Châu Phi (ASF) là bệnh truyền nhiễm xuyên biên giới trên heo nhà và heo rừng, gây thiệt hạinghiêm trọng nhất đối với ngành chăn nuôi heo, gây ra bởi vi-rút ASF (ASFV), DNA kép lớn với cấu trúc phứctạp. Nghiên cứu này được thực hiện nhằm xác định sự hiện diện và đặc điểm di truyền của ASFV ở 10 tỉnh phíaNam Việt Nam. Tổng số 118/148 (79,2%) ca bệnh nghi ngờ được xét nghiệm dương tính ASFV bởi PCR trongkhảo sát. 10/118 chủng ASFV được giải trình tự và phân tích đoạn gen mã hóa p72. Phân tích cây sinhdòng dựa trên gen mã hóa p72 cho thấy các chủng duy nhất thuộc genotype II, nằm cùng phân nhánh và tươngđồng rất cao với các chủng đã được công bố trước đây ở Phía Bắc nước ta (2019) và Trung Quốc (2018). Sựtương đồng cao khi so sánh giữa chủng thực địa với các chủng ứng viên vắc-xin hiện nay cho thấysự hứa hẹn về khả năng hiệu quả. Từ khóa: ASFV, đặc điểm di truyền, p72, heo The genetic characteristics of African Swine Fever Virus from outbreaks in Southern provinces of Vietnam from 2019 to 2020 Ngo Thi Ngoc Tram, Nguyen Thi My Duyen, Nguyen Quang Hop, Nguyen Minh Nam, Do Tien Duy SUMMARY African swine fever (ASF) is reported as a transboundary infectious disease of domestic andwild pigs, the most severe constraint to the pig industry, caused by ASF virus (ASFV) a largeenveloped DNA virus with a complex structure. There are 24 genotypes of ASFV describedto date; however, in Vietnam, only genotype II had been previously described. This studywas conducted to identify the presense and genetic characteristics of ASFV in the southernprovinces of Vietnam. A total of 148 cases with ASF-suspected clinical signs from outbreaksin 10 provinces. The presence of ASFV was detected by PCR assay. 10/118 strains of ASFVwere sequenced based on p72-encoded gene. The prevalence of ASFV was determined to be79.2%. Analysis of the phylogenetic tree based on the gene encoding p72 showed that onlygenotype II strains, located in the same clade and highly similar to those previously publishedin the North of Vietnam and China. The genetic homology of field strains with current vaccinecandidate isolates shows promise in terms of efficacy. Keywords: African Swine Fever virus (ASFV), genetic characteristics, p72, pigI. ĐẶT VẤN ĐỀ gây thiệt hại lớn về kinh tế cho người chăn nuôi ở nhiều nước trên thế giới (OIE, 2019). Bệnh Bệnh dịch tả heo Châu Phi (African Swine lây lan rộng và làm chết nhiều heo nhiễm bệnh.Fever, ASF) là bệnh truyền nhiễm nguy hiểm, Ngay sau khi xâm nhập vào nước ta, sự lây lan1. Khoa Chăn nuôi Thú y, Trường Đại học Nông Lâm Tp. Hồ Chí Minh2. TT Nghiên cứu Di truyền và Sức khỏe sinh sản, Khoa Y, Đại học Quốc gia Tp. Hồ Chí Minh 67KHOA HỌC KỸ THUẬT THÚ Y TẬP XXVIII SỐ 9 - 2021của ASF diễn ra khá nhanh, phức tạp, chỉ sau protein p72 xác định được 22 kiểu gen3 - 4 tháng dịch bệnh đã đạt đỉnh và trong vòng (genotypes) của ASFV (Boshoff và ctv, 2007)9 tháng sự lây truyền xảy ra hơn 8.200 xã thuộc và gần đây 24 kiểu gen đã được công bố63 tỉnh thành. Theo Cục chăn nuôi Việt Nam (Achenbach và ctv, 2017). Do đó, nghiên cứu(2020), sau 1 năm, thiệt hại do bệnh gây ra xác định đặc trưng kiểu gen của các chủngđược báo cáo chính thức là rất lớn, số heo mắc ASFV tại Việt Nam dựa vào gen mã hóa p72bệnh và tiêu hủy khoảng hơn 6 triệu con (chiếm là cần thiết để xác định chủng lưu hành, nguồn21,5% tổng đàn), tương ứng tổng trọng lượng gốc, và sự đa dạng gen tại các trang trại khảothịt heo thiệt hại 342.091 tấn, chiếm 9% tổng sát. Thực tế, các nghiên cứu về đặc trưng kiểnsản lượng thịt heo được sản xuất trong cả nước. gen của ASFV thu thập từ các ổ dịch ở phía Căn nguyên gây bệnh là một loại vi-rút ...