Giải mã kháng nguyên H, phân tích đặc điểm phân tử và xác định phả hệ nguồn gốc của canine distember virus gây bệnh Care ở chó tại Hà Nội

Phân tích phả hệ 2 chủng CDVHN6 và CDVHN7 thu nhận tại Hà Nội năm 2019 cho thấy sự gần gũi với chủng CDV/dog/HCM/33/140816 của Việt Nam (số GenBank: LC159587) thuộc genotye Asia-1 cùng với các chủng của châu Á bao gồm Trung Quốc, Thái Lan, Đài Loan. Tuy nhiên, hiện nay mới chỉ có được một hệ gen duy nhất CDV Thành phố Hồ Chí Minh 2014 đã công bố trên Ngân hàng gen, do vậy việc bổ sung thêm thông tin về nguồn dữ liệu gen của virus care là rất cần thiết nhằm góp phần nghiên cứu và sản xuất vaccine tái tổ hợp phòng bệnh cho chó tại Việt Nam.
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Giải mã kháng nguyên H, phân tích đặc điểm phân tử và xác định phả hệ nguồn gốc của canine distember virus gây bệnh Care ở chó tại Hà Nội KHOA HỌC KỸ THUẬT THÚ Y TẬP XXVIII SỐ 9 - 2021 GIAÛI MAÕ GEN KHAÙNG NGUYEÂN H, PHAÂN TÍCH ÑAËC ÑIEÅM PHAÂN TÖÛ VAØ XAÙC ÑÒNH PHAÛ HEÄ NGUOÀN GOÁC CUÛA CANINE DISTEMPER VIRUS GAÂY BEÄNH CARE ÔÛ CHOÙ TAÏI HAØ NOÄI Đặng Thị Mai Lan1*, Đỗ Đức Thành1, Đoàn Thị Thanh Hương *Emal: landangmaiorchiddhtn@gmail.com TÓM TẮT Chúng tôi đã xác định và lựa chọn được 2 chủng CDV virus (CDVHN6 và CDVHN7) thu nhận tạiHà Nội năm 2019 để tách chiết và thu được RNA tổng số. Sản phẩm thu được đem chạy RT-PCR và tinhsạch được 2 đoạn DNA có kích thước 2021 nucleotide, chứa hoàn toàn gen H có kích thước 1824bp. Hệsố tương đồng của 2 chủng là cao so với các chủng CDV thuộc genotype Asia - 1 đã được công bố trênNgân hàng gen có tỷ lệ đồng nhất 97,30% về nucleotide và tỷ lệ tương đồng 97,20% về amino acid. Phântích phả hệ 2 chủng CDVHN6 và CDVHN7 thu nhận tại Hà Nội năm 2019 cho thấy sự gần gũi với chủngCDV/dog/HCM/33/140816 của Việt Nam (số GenBank: LC159587) thuộc genotye Asia-1 cùng với cácchủng của châu Á bao gồm Trung Quốc, Thái Lan, Đài Loan. Tuy nhiên, hiện nay mới chỉ có được mộthệ gen duy nhất CDV Thành phố Hồ Chí Minh 2014 đã công bố trên Ngân hàng gen, do vậy việc bổ sungthêm thông tin về nguồn dữ liệu gen của virus care là rất cần thiết nhằm góp phần nghiên cứu và sản xuấtvaccine tái tổ hợp phòng bệnh cho chó tại Việt Nam. Từ khóa: Care virus, Canine distemper, gen H, genotype Asia-1,….H antigen decode, molecular characteristics analysis and original pedigree determine of canine distemper virus of care disease in dog in hanoi Dang Thi Mai Lan, Do Duc Thanh, Doan Thi Thanh Huong SUMMARY We have identified and selected 2 CDV virus strains (CDVHN6 and CDVHN7) collected in Hanoiin 2019 to extract and obtain total RNA. The obtained product was tested RT-PCR and purified 2DNA fragments with the size of 2021 nucleotides, completely containing the H gene with size 1824bp.The similarity coefficient of the two strains is high compared to the CDV strains of genotype Asia - 1published in the Gene Bank with 97.30% homogeneity rate of nucleotides and 97.20% amino acidsimilarity rate. . Genealogy analysis of the two strains CDVHN6 and CDVHN7 collected in Hanoi in2019 shows the proximity to the Vietnamese strain CDV / dog / HCM / 33/140816 (number GenBank:LC159587) belong to genotye Asia-1 along with the strains of Asia include China, Thailand, andTaiwan. However, at present, there is only one genome, CDV in Ho Chi Minh City, 2014 which hasbeen published in the Gene Bank, so it is very necessary to add more information about the gene datasource of care virus to contribute to research and production of recombinant dog vaccines in Vietnam. Keywords: Virus care, Canine distemper, H gene, genotype Asia-1….1. ĐẶT VẤN ĐỀ gen là RNA sợi đơn âm, có kích thước khoảng 15.7kb, thuộc loài Canine morbillivirus, họ Bệnh Care hay còn được gọi là bệnh sài sốt Paramixoviridae, chi Morbillivirus. Virus có hệở chó là một bệnh truyền nhiễm cấp tính do gen mã hóa cho 8 protein, trong đó, protein H vàvirus Canine Distemper (Canine Distemper protein F là 2 protein kháng nguyên, quyết địnhVirus - CDV) gây ra. Virus gây bệnh Care có hệ tính độc lực của virus. Đây là các gen có nhiều biến đổi nhất giữa các chủng và giữa các genotype nên1. Đại học Nông Lâm Thái Nguyên2. Viện Công nghệ sinh học 81KHOA HỌC KỸ THUẬT THÚ Y TẬP XXVIII SỐ 9 - 2021được chọn là đối tượng chính cho nghiên cứu dịch kết quả dương tính với test thử nhanh One - steptễ phân tử và nguồn gốc phả hệ (Ke và cs.,2015). Canine Distemper Virus Ag test (IMMUNO)). Mẫu được bảo quản lạnh ở -200C đến khi sử dụng. Gen H (mã hóa protein H) là một trong nhữnggen biến đổi nhất được dùng để xác định mối liên 2.2. Phương pháp nghiên cứuhệ di truyền giữa các chủng (Gámiz và cs., 2011). 2.2.1. Phương pháp xác định con vật bệnhGen H có khả năng biến đổi cao, quyết định tínhdinh dưỡng của tế bào và vật chủ bằng cách liên Với những chó nghi mắc bệnh care có các triệukết với ...