Luận án Tiến sĩ: Nghiên cứu đặc điểm di truyền và tính kháng thuốc của Vibrio cholerae phân lập tại tỉnh Trà Vinh

Luận án xác định tỉ lệ nhiễm và type huyết thanh học của các chủng V.cholerae phân lập được; xác định đặc tính kháng sinh của các chủng V.cholerae; xác định các kiểu đột biến gene gây kháng thuốc của các chủng Vibrio cholerae và đánh giá tính đáp ứng miễn dịch với V.cholerae ở thỏ đã được chủng vaccine đang lưu hành trên thị trường; định danh các chủng vi khuẩn phân lập và đánh giá quan hệ di truyền giữa các chủng phân lập với các chủng đã công bố.
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Luận án Tiến sĩ: Nghiên cứu đặc điểm di truyền và tính kháng thuốc của Vibrio cholerae phân lập tại tỉnh Trà Vinh BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƯỜNG ĐẠI HỌC CẦN THƠ NGUYỄN THỊ ĐẤUNGHIÊN CỨU ĐẶC ĐIỂM DI TRUYỀN VÀ TÍNH KHÁNG THUỐC CỦA VIBRIO CHOLERAE PHÂN LẬP TẠI TỈNH TRÀ VINH LUẬN ÁN TIẾN SĨ Chuyên ngành: VI SINH VẬT HỌC 2015 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƯỜNG ĐẠI HỌC CẦN THƠ NGUYỄN THỊ ĐẤUNGHIÊN CỨU ĐẶC ĐIỂM DI TRUYỀN VÀ TÍNH KHÁNG THUỐC CỦA VIBRIO CHOLERAE PHÂN LẬP TẠI TỈNH TRÀ VINH LUẬN ÁN TIẾN SĨ Chuyên ngành: VI SINH VẬT HỌC Mã ngành: 6242 0107 Hướng dẫn khoa học PGS.TS. HỒ THỊ VIỆT THU 2015 LỜI CẢM ƠN Xin chân thành cảm ơn Ban Giám hiệu Trường Đại học Cần Thơ,Ban Giám hiệu Trường Đại học Trà Vinh, Ban Lãnh đạo Viện Nghiên cứuvà Phát triển Công nghệ Sinh học, Phòng Đào tạo, Phòng Quản lý Khoahọc, Phòng Quản lý Sau Đại học thuộc Trường và Viện đã tạo điều kiệntốt thực hiện nghiên cứu khoa học và các học phần của nghiên cứu sinh. Xin chân thành cảm ơn PGS.TS Hồ Thị Việt Thu, PGS.TS. TrầnNhân Dũng đã tạo mọi điều kiện, giúp đỡ tôi có thể hoàn thành luận án.Do mới nhận hướng dẫn trong thời gian 2 năm sau của luận án nênPGS.TS Hồ Thị Việt Thu đã gặp nhiều khó khăn, và cũng trong thời giannày tôi cũng chưa định hướng đúng đắn cho nghiên cứu, nhưng PGS.TSHồ Thị Việt Thu rất tận tình giúp đỡ, tìm hướng đi cho phù hợp vớinghiên cứu trong thực tế để tôi có thể hoàn thành luận án này. Chân thành cảm ơn Ban lãnh đạo Chi cục Thú y tỉnh Trà Vinh đãtạo điều kiện cho chúng tôi tham gia lấy mẫu tại các cơ sở giết mổ trongđịa bàn Tỉnh. Chân thành cảm ơn các anh chị em Bộ môn Vi sinh Khoa Nôngnghiệp & Sinh học Ứng dụng, Trường Đại học Cần Thơ; Trường Đại họcY Dược Cần Thơ; Khoa xét nghiệm bệnh viện Đa khoa Trung ương CầnThơ; Khoa Nông nghiệp Thuỷ sản Trường Đại học Trà Vinh đã tạo điềukiện, giúp đỡ tôi hoàn thành nghiên cứu đề tài này. Chân thành cảm ơn gia đình và đồng nghiệp đã tạo điều kiện vàđộng viên tôi hoàn thành nghiên cứu này. Xin chân thành cảm ơn! NGUYỄN THỊ ĐẤU i TÓM TẮT Vibrio cholerae là một loại vi khuẩn Gram âm có hình dấu phẩy vớinhững chủng không gây bệnh và gây bệnh. Chủng gây bệnh lây lan mạnh nhấttừ năm 1816 đến năm 1923 thuộc V. cholerae O1 type sinh học cổ điển. Nhữngnăm sau đó, chủng vi khuẩn khác thuộc type sinh học El Tor gây ra những trậnđại dịch kéo dài trong thập niên 1970s, chủng gây bệnh mới nhất được xác địnhvào năm 1992 thuộc type sinh học O139, chủng này cùng với chủng thuộc typesinh học O1 được xem là nguyên nhân của những vụ dịch xảy ra gần đây. Hiệnnay, tuy có nhiều kháng sinh có thể điều trị được bệnh, nhưng hiệu quả khángsinh có phần hạn chế do tình hình đa kháng thuốc gia tăng trong quần thể vikhuẩn này (CDC, 2005). Xuất phát từ những vấn đề trên, đề tài: “Nghiên cứuđặc điểm di truyền và tính kháng thuốc của V. cholerae phân lập tại tỉnh TràVinh” được thực hiện với mục đích cung cấp thông tin cần thiết trong chiếnlược sử dụng kháng sinh phù hợp nhằm làm giảm tỉ lệ tử vong, giảm hiệntượng kháng thuốc và giảm chi phí trong điều trị bệnh. Nghiên cứu được thực hiện qua việc phân lập vi khuẩn Vibrio spp. từ160 mẫu nghêu, 150 mẫu nước (50 mẫu nước biển, 50 mẫu nước sông, 50mẫu nước ao nuôi tôm), 100 mẫu huyết heo và 40 mẫu phân bệnh nhân tiêuchảy thu thập tại bệnh viện đa khoa tỉnh Trà Vinh từ tháng 4 năm 2012 đếntháng 4 năm 2014. Kỹ thuật PCR và các test sinh hoá (theo tiêu chuẩnISO/TS 21872-1:2007) được sử dụng để định danh mức loài của vi khuẩnVibrio, phản ứng ngưng kết được sử dụng để định type huyết thanh V.cholerae. Kết quả nghiên cứu đã phân lập được 25 chủng vi khuẩn thuộcVibrio spp. bao gồm 6 chủng V. cholerae (24%) (3 chủng từ nghêu, 2 chủng từmẫu huyết heo và 1 chủng từ mẫu nước sông), 8 chủng thuộc loài V.paraheamolyticus (32%), 4 chủng thuộc loài V. vulnificus (16%), 5 chủngthuộc loài V. fluvialis (20%) và 2 chủng thuộc loài V. alginolyticus (8%). Kếtquả định type huyết thanh học 6 chủng V. cholerae đều thuộc type O1, với50% (3/6) dương tính với Inaba, 50% (3/6) dương tính Ogawa. Không cóchủng nào thuộc type O139. Kết quả so sánh tỉ lệ tương đồng về trình tự nucleotide của gene 16SrRNA của 6 chủng V. cholerae phân lập được với chủng MS6 (Thái Lan),O395 (Ấn Độ), M66-62 (Indonesia), LMA 3894-4 (Brazil) và N16961 (ẤnĐộ). Kết quả cho thấy 1 chủng trong 6 chủng này 100% tương đồng với 56chủng; 99% tương đồng với 32 chủng và 99% tương đồng với 12 chủng gần.Riêng đối với 2 chủng mang gene kháng kháng sinh trong nghiên cứu này cótrình tự nucleotide tương đồng 97% ...