LUẬN VĂN:NGHIÊN CỨU SỰ PHÁT TRIỂN CỦA VIRUT CÚM

Tin-sinh học (Bioinformatics) là một lĩnh vực nghiên cứu đang phát triển rất mạnh mẽ. Tin-sinh học áp dụng những phương pháp trong tin học để giải quyết các bài toán trong sinh học phân tử. Với sự phát triển mạnh mẽ của công nghệ sinh học, một khối lượng lớn dữ liệu sinh học phân tử (gene, protein, genome) đã được thu thập, lưu trữ và chia sẻ tại các ngân hàng dữ liệu thế giới như NCBI (National Center for Biotechnology Information). Tin sinh học hiện đang được ứng dụng phổ biến trong sinh học phân tử, y-dược...
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
LUẬN VĂN:NGHIÊN CỨU SỰ PHÁT TRIỂN CỦA VIRUT CÚM ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI TRƯỜNG ĐẠI HỌC CÔNG NGHỆ Nguyễn Văn SáuNGHIÊN CỨU SỰ PHÁT TRIỂN CỦA VIRUT CÚM KHOÁ LUẬN TỐT NGHIỆP ĐẠI HỌC HỆ CHÍNH QUY Ngành: khoa học máy tính HÀ NỘI – 2009 Mục lụcMục lục ..................................................................................................................... 1Lời nói đầu................................................................................................................ 3Chương I. Giới thiệu về sinh học phân tử và tin-sinh học ....................................... 41. Giới thiệu về sinh học phân tử.............................................................................. 42. Giới thiệu về tin-sinh học ..................................................................................... 5 2.1. Sắp hàng đa chuỗi ......................................................................................... 5 2.2. Cây tiến hóa ................................................................................................... 7Chương II. Virut cúm ............................................................................................... 81.Sơ lược về virut cúm ............................................................................................. 82. Các loại virut cúm ................................................................................................ 83. Cấu trúc và tính chất............................................................................................ 94. Một số thống kê và sự lây lan của virut cúm...................................................... 10 4.1. Một số thống kê về dịch cúm ...................................................................... 10 4.2. Sự lây lan của virut cúm ............................................................................. 12Chương III. Ngân hàng gene virut cúm.................................................................. 131. Giới thiệu tổng quan ........................................................................................... 132. Các chức năng đã xây dựng................................................................................ 13 2.1. Quá trình xây dựng ngân hàng gene ............................................................ 14 2.1.1. Quá trình thu thập dữ liệu chi tiết cho Việt Nam .................................. 15 1 Nghiên cứu sự phát triển của virut cúm 2.1.2. Xây dựng cơ sở dữ liệu.......................................................................... 16 2.2. Tìm kiếm các chuỗi...................................................................................... 21 2.3. Tiện ích tải chuỗi.......................................................................................... 23 2.4. Tiện ích sắp hàng đa chuỗi........................................................................... 23 2.5. Tiện ích xây dựng cây tiến hóa .................................................................... 24 2.6. Bản đồ phân bố của virut cúm ..................................................................... 25 2.6. Biểu đồ thống kê về virut cúm ..................................................................... 28Tài liệu tham khảo .................................................................................................. 31Các hình ảnh tham khảo ......................................................................................... 33Các bảng tham khảo ............................................................................................... 35 2 Nghiên cứu sự phát triển của virut cúm Lời nói đầu Tin-sinh học (Bioinformatics) là một lĩnh vực nghiên cứu đang phát triển rấtmạnh mẽ. Tin-sinh học áp dụng những phương pháp trong tin học để giải quyếtcác bài toán trong sinh học phân tử. Với sự phát triển mạnh mẽ của công nghệ sinhhọc, một khối lượng lớn dữ liệu sinh học phân tử (gene, protein, genome) đã đượcthu thập, lưu trữ và chia sẻ tại các ngân hàng dữ liệu thế giới như NCBI (NationalCenter for Biotechnology Information). Tin sinh học hiện đang được ứng dụngphổ biến trong sinh học phân tử, y-dược học, nông nghiệp, công nghệ thực phẩm,môi trường và kiểm soát bệnh. Hiện nay, tin-sinh học đang được ứng dụng rộng trong việc phát hiện vàkiểm soát bệnh. Một trong các ứng dụng cụ thể là kiểm soát bệnh cúm, với cácdịch bệnh đang lây lan như cúm gia cầ m H5N1, cúm H1N1. Để góp phần vào việccung cấp thông tin, cũng như các công cụ phân tích cho việc kiểm soát bệnh cúm ởViệt Nam, đề tài tập trung vào những mục tiêu chính sau: (1) cung cấp dữ liệu vềcúm trên thế giới và Việt Nam, (2) cung cấp các công cụ phân tích cơ bản như tìmkiếm, sắp hàng đa chuỗi, xây dựng cây tiến hóa, (3) cung cấp dữ liệu về virut cúmchi tiết tới từng tỉnh thành của Việt Nam, (4) cung cấp bản đồ phân tán của virutcúm trên thế giới và cho các tỉnh thành ở Việt Nam, (5) cung cấp biểu đồ thống kêvirut cúm cho các vùng của Việt Nam, và trên thế giới”. Đề tài hy vọng sẽ góp phần vào việc nghiên cứu và kiểm soát các dịch bệnhliên quan đến virut cúm ở Việt Nam. 3 Nghiên cứu sự phát triển của virut cúm Chương I. Giới thiệu về sinh học phân tử và tin-sinh học1. Giới thiệu về sinh học phân tửMọi cơ thể sống đều cấu tạo từ các tế bào.Tế bào có cấu tạo gồm vỏ và nhân, trong đónhân tế bào chứa ADN (hoặc ARN). Hình1 mô tả cấu tạo của tế bào. ADN (acid deoxyribo nucleic) mangthông tin di ...