Luận văn Thạc sĩ Khoa học: Nghiên cứu một số gen liên quan đến khả năng kháng carbapenem của các chủng Acinetobacter baumannnii phân lập tại Bệnh viện Phổi Trung ương

Luận văn được thực hiện với mục tiêu nhằm Thống kê tần suất có mặt của các gen kháng kháng sinh của A. baumannii tại Bệnh viện Phổi Trung ương. Phân tích mức độ kháng kháng sinh của các mẫu A. baumannii thu được. Nghiên cứu mối liên quan giữa khả năng kháng carbapenem với sự có mặt bốn gen đích mã hóa carbapenemase. So sánh kết quả về sự có mặt của các gen và khả năng kháng kháng sinh dựa trên kháng sinh đồ... Mời các bạn cùng tham khảo.
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Luận văn Thạc sĩ Khoa học: Nghiên cứu một số gen liên quan đến khả năng kháng carbapenem của các chủng Acinetobacter baumannnii phân lập tại Bệnh viện Phổi Trung ương ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI TRƯỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN --------------------- LƯU THỊ NGỌC HÂN NGHIÊN CỨU MỘT SỐ GEN LIÊN QUAN ĐẾN KHẢ NĂNG KHÁNG CARBAPENEM CỦA CÁC CHỦNG Acinetobacterbaumannii PHÂN LẬP TẠI BỆNH VIỆN PHỔI TRUNG ƯƠNG LUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA HỌC Hà Nội - 2019 ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI TRƯỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN --------------------- LƯU THỊ NGỌC HÂN NGHIÊN CỨU MỘT SỐ GEN LIÊN QUAN ĐẾN KHẢ NĂNG KHÁNG CARBAPENEM CỦA CÁC CHỦNG Acinetobacterbaumannii PHÂN LẬP TẠI BỆNH VIỆN PHỔI TRUNG ƯƠNG Chuyên ngành: Vi sinh vật học Mã số: 8420101.07. LUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA HỌC NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC: TS. PHẠM BẢO YÊN Hà Nội - 2019 LỜI CẢM ƠNĐầu tiên tôi xin gửi lời cảm ơn chân thành và bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc tới Tiến sĩPhạm Bảo Yên, người đã trực tiếp giúp đỡ và hướng dẫn tôi trong suốt quá trình thựchiện luận văn cao học. Xin chân thành cám ơn cô vì đã luôn tận tình hướng dẫn,truyền đạt kiến thức để tôi có thể hoàn thành luận văn tốt nghiệp này.Tôi cũng xin gửi lời cảm ơn đến Trường đại học khoa học tự nhiên, các cán bộ PhòngThí nghiệm Trọng điểm Công nghệ Enzyme và Protein, Khoa Vi sinh Bệnh viện PhổiTrung Ương cùng các thành viên nhóm nghiên cứu của đề tài Q6.17.60 đã tạo điềukiện và môi trường cho tôi thực hiện nghiên cứu. Xin cảm ơn các bạn sinh viên trongPhòng Thí nghiệm Enzyme học và Phân tích hoạt tính sinh học đã giúp đỡ tôi rấtnhiều trong thời gian qua.Tôi xin gửi lời cảm ơn đến các thầy cô Khoa Sinh học, Trường Đại học Khoa học Tựnhiên đã truyền đạt những kiến thức quý báu và hỗ trợ cho tôi hoàn thành chươngtrình đào tạo thạc sĩ.Cuối cùng tôi xin gửi lời cảm ơn đến gia đình, bạn bè và đồng nghiệp tại Trung tâmkiểm nghiệm Thuốc, mỹ phẩm, thực phẩm Hà Nội đã luôn tạo điều kiện, cổ vũ vàđộng viên tôi trong quá trình học tập và thực hiện luận văn.Mặc dù đã cố gắng nỗ lực, nhưng luận văn không tránh khỏi những thiếu sót và hạnchế. Rất mong nhận được những đóng góp từ thầy cô, các nhà khoa học để tôi tiếptục hoàn thiện công trình nghiên cứu.Một lần nữa, tôi xin chân thành cảm ơn. Hà Nội, ngày 09 tháng 12 năm 2019 Học viên Lưu Thị Ngọc Hân DANH MỤC CÁC KÍ HIỆU, CHỮ VIẾT TẮTChữ viết tắt, ký hiệu Viết đầy đủA. baumannii Acinetobacter baumanniiAMEs Aminoglycoside-modifying enzymesCDC Centers for Disease Control and PreventionCTX-M Cefotaxime hydrolyzing capabilitiesDMSO Dimethyl sulfoxideDNA Deoxyribonucleic aciddNTP Deoxynucleotide triphosphateECDC European Centre for Disease Prevention and ControlFw ForwardGES Guiana extended spectrumICU Intensive care unitIMP ImipenemaseKPC Klebsiella pneumoniae carbapenemaseLAMP Loop-mediated isothermal amplificationLPS LipopolysaccharideMATE Multidrug and toxic compound extrusionMDR Multidrug-resistantMFS Major facilitator superfamilyMIC Minimum Inhibitory ConcentrationOXA OxacillinasePBP Penicillin-Binding ProteinPCR Polymerase Chain ReactionPDR Pandrug-resistantRNA Ribonucleic acidRND Resistance-nodulation-divisionRv ReverseSHV Sulfhydryl VariableSIM Seoul ImipenemaseSMR Small multidrug resistanceTEM TemoneiraVAP Ventilator Associated PneumoniaVEB Vietnam extended-spectrum β-lactamaseVIM Verona ImipenemaseWHO World Health OrganizationXDR Extensively drug-resistant DANH MỤC HÌNHHình 1: Các vị trí tác dụng của kháng sinh …………………………………………4Hình 2: Cấu trúc hóa học của carbapenem………………………………………….9Hình 3: Hình ảnh tế bào vi khuẩn A. baumannii …………………………………..12Hình 4: Hình thái khuẩn lạc trên các môi trường thạch……………………………13Hình 5: Các cơ chế kháng kháng sinh của A. baumannii…………………………..19Hình 6: Nguyên tắc của kỹ thuật multiplex PCR…………………………………..25Hình 7: Chu trình nhiệt đã được tối ưu của phản ứng multiplex PCR……………..31Hình 8: Kết quả của phản ứng ...