Luận văn Thạc sĩ Khoa học: Phân tích đa hình di truyền và mức độ biểu hiện của genOsHKT2;4 ở lúa (Oryza sativa)

Kết cấu nội dung luận văn gồm có phần mở đầu, kết luận và danh mục tài liệu tham khảo. Luận văn gồm 3 chương. Chương 1: Tổng quan tài liệu. Chương 2: Đối tượng và phương pháp. Chương 3: Kết quả và thảo luận.
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Luận văn Thạc sĩ Khoa học: Phân tích đa hình di truyền và mức độ biểu hiện của genOsHKT2;4 ở lúa (Oryza sativa)ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘITRƢỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN---------------------------------Nguyễn Tiến ĐạtPHÂN TÍCH ĐA HÌNH DI TRUYỀNVÀ MỨC ĐỘ BIỂU HIỆN CỦA GENOsHKT2;4Ở LÚA (Oryza sativa)LUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA HỌCHà Nội - 2016ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘITRƢỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN------------**------------Nguyễn Tiến ĐạtPHÂN TÍCH ĐA HÌNH DI TRUYỀNVÀ MỨC ĐỘ BIỂU HIỆN CỦA GENOsHKT2;4Ở LÚA (Oryza sativa)Chuyên ngành :Di truyền họcMã số:60420121LUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA HỌCCán bộ hướng dẫn: TS. Đỗ Thị PhúcHà Nội, 2016LỜI CẢM ƠNLời đầu tiên, tôi xin bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc đến TS. ĐỗThị Phúc, người đã hướng dẫn, quan tâm và tận tình chỉ bảo, giúpđỡ tôi trong suốt quá trình học tập và thực hiện đề tài. Cảm ơn cô,người đã luôn truyền cảm hứng và niềm tin cho tôi trong từng thínghiệm, từng công việc.Tôi xin gửi lời cảm ơn chân thành tới các thầy cô công tác tạiBộ môn Di truyền học đã quan tâm và tạo mọi điều kiệnthuận lợi giúp tôi hoàn thành luận văn. Các thầy cô đã chỉ bảo cho tôisự cẩn thận, kiên trì và nghiêm túc trong nghiên cứu khoa học.Tôi cũng xin gửi lời cảm ơn tới CN. Trần Xuân An, CN.Phạm Quỳnh Hoa, CN. Ngô Thị Hạnh đã luôn giúp đỡ tôitrong các thí nghiệm. Các em đã luôn quan tâm và truyền đạt cho tôinhững kinh nghiệm quý báu trong thực nghiệm.Tôi xin chân thành cảm ơn Phòng Thí nghiệm Trọngđiểm Công nghệ Protein và Enzyme; Học viện Nôngnghiệp Việt Nam đã giúp đỡ tôi rất nhiều trong quá trình thựchiện đề tài.Cuối cùng, tôi xin gửi lời cảm ơn sâu sắc tới gia đình, ngườithân, những người đã tận tình giúp đỡ, chỉ bảo và tạo điều kiện tốtnhất để tôi học tập. Cảm ơn mọi người đã luôn động viên, khuyếnkhích tôi trong quá trình học tập và thí nghiệm.Hà Nội, tháng 11 năm 2016Nguyễn Tiến ĐạtMỤC LỤCMỞ ĐẦU ..........................................................................................................1CHƢƠNG 1.TỔNG QUAN TÀI LIỆU ......................................................31.1.Giới thiệu về cây Lúa (Oryza sativa) .............................................. 31.2.Giới thiệu về họ protein vận chuyển ion xuyên màng HKT ởthực vật và ở lúa...................................................................................... 41.2.1.Họ protein HKT ở thực vật ....................................................... 51.2.2.Họ protein HKT ở cây lúa ......................................................... 81.2.3.Gen OsHKT2;4 .......................................................................... 91.2.4.Tình hình nghiên cứu gen OsHKT2;4 ..................................... 101.3.Một số phương pháp nghiên cứu đa hình nucleotide .................... 111.3.1.Phương pháp RFLP-PCR ........................................................ 111.3.2.Phương pháp giải trình tự ........................................................ 141.4.Phương pháp phân tích mức độ biểu hiện của gen ....................... 161.4.1.Lai Northern blot và lai huỳnh quang tại chỗ ......................... 161.4.2.RT-PCR và Real-time PCR ..................................................... 171.4.3.Các phương pháp sử dụng chip ............................................... 19CHƢƠNG 2. ĐỐI TƢỢNG VÀ PHƢƠNG PHÁP .......................................202.1.Đối tượng nghiên cứu, hóa chất và thiết bị ................................... 202.1.1.Đối tượng nghiên cứu .............................................................. 202.1.2.Vật liệu, hóa chất và thiết bị.................................................... 212.2.Phương pháp nghiên cứu .............................................................. 222.2.1.Các phương pháp sử dụng trong nghiên cứu đa hình genOsHKT2;4 ............................................................................................. 222.2.2.Các phương pháp sử dụng trong phân tích biểu hiện gen ....... 26CHƢƠNG 3.3.1.KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN .............................................30Phân tích đa hình gen Oshkt2;4 ở lúa ........................................... 303.1.1.Tách chiết DNA tổng số .......................................................... 303.1.2.Khuếch đại gen OsHKT2;4 bằng PCR .................................... 313.1.3.Giải trình tự gen OsHKT2;4 .................................................... 323.1.4.Phân tích đa hình gen OsHKT2;4............................................ 333.2.Phân tích biểu hiện gen ................................................................. 433.2.1.Kết quả trồng lúa thủy canh và xử lý mặn .............................. 433.2.2.Kết quả tách chiết RNA và tổng hợp cDNA ........................... 433.2.3.Phản ứng Real-time PCR và phân tích mức độ biểu hiệngen OsHKT2;4 ...................................................... ...