Luận văn Thạc sĩ Khoa học: Phân tích proteomics mô ung thư của bệnh nhân ung thư đại trực tràng

Mục tiêu của luận văn: Phân tách hệ protein tách chiết từ mô đại trực tràng bình thường và mô ung thư đại trực tràng của bệnh nhân ung thư đại trực tràng; phân tích và so sánh sự biểu hiện khác biệt của các protein ở mô ung thư đại trực tràng so với mô đại trực tràng bình thường thông qua biểu hiện của các điểm protein trên bản gel điện di hai chiều; nhận dạng được một số protein biểu hiện khác biệt đặc trưng giữa mô ung thư đại trực tràng và mô đại trực tràng bình thường.
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Luận văn Thạc sĩ Khoa học: Phân tích proteomics mô ung thư của bệnh nhân ung thư đại trực tràng ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI TRƯỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN --------------------- Nguyễn Thị Ngọc HàPHÂN TÍCH PROTEOMICS MÔ UNG THƯ CỦA BỆNH NHÂN UNG THƯ ĐẠI TRỰC TRÀNG LUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA HỌC Hà Nội – Năm 2012 ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI TRƯỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN --------------------- Nguyễn Thị Ngọc HàPHÂN TÍCH PROTEOMICS MÔ UNG THƯ CỦA BỆNH NHÂN UNG THƯ ĐẠI TRỰC TRÀNG Chuyên ngành: Sinh học thực nghiệm Mã số: 60 42 30 LUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA HỌC NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC PGS.TS. Trịnh Hồng Thái Hà Nội – Năm 2012 LỜI CẢM ƠN Tôi xin bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc tới PGS. TS. Trịnh Hồng Thái, người thầyđã tận tình chỉ bảo, hướng dẫn tôi trong suốt thời gian học tập, nghiên cứu khoahọc và thực hiện luận văn này. Tôi cũng xin trân trọng cảm ơn các thầy giáo, cô giáo trong khoa Sinh học,trường Đại học Khoa học Tự nhiên đã tận tình giảng dạy, dìu dắt tôi trong suốt thờigian học tập tại Trường. Tôi xin gửi lời cảm ơn chân thành tới các anh, chị, các bạn sinh viên làmviệc tại Phòng Proteomics và Sinh học Cấu trúc thuộc Phòng thí nghiệm Trọngđiểm Công nghệ Enzyme và Protein đã tận tình giúp đỡ tôi trong suốt quá trình họctập và thực hiện luận văn tại Phòng. Trong quá trình thực hiện luận văn, tôi đã nhận được rất nhiều sự quan tâm,giúp đỡ của các cán bộ nhân viên thuộc khoa Tế bào và Giải phẫu bệnh, Bệnh việnK Tam Hiệp, Hà Nội và khoa Giải phẫu bệnh, Bệnh viện Việt Đức, Hà nội. Tôi xinchân thành cảm ơn. Cuối cùng, tôi vô cùng biết ơn gia đình, bạn bè, đồng nghiệp đã luôn khích lệđộng viên tôi trong suốt thời gian qua. Hà Nội, tháng 12 năm 2012 Học viên Nguyễn Thị Ngọc Hà MỤC LỤCMỞ ĐẦU ................................................................................................................ 1Chương 1 – TỔNG QUAN ...................................................................................... 3 1.1. TỔNG QUAN VỀ UNG THƯ ĐẠI TRỰC TRÀNG ..................................... 3 1.1.1. Ung thư đại trực tràng là gì?.................................................................... 3 1.1.2. Nguyên nhân dẫn đến ung thư đại trực tràng ........................................... 6 1.1.3. Các hệ thống phân loại giai đoạn ung thư đại trực tràng .......................... 8 1.2. NGHIÊN CỨU CHỈ THỊ SINH HỌC ĐỐI VỚI UNG THƯ ....................... 12 1.2.1. Chỉ thị sinh học đối với ung thư ............................................................ 12 1.2.2. Các kỹ thuật sinh học phân tử được ứng dụng để nghiên cứu chỉ thị sinh học ung thư ..................................................................................................... 14 1.3. PROTEOMICS TRONG NGHIÊN CỨU UNG THƯ ĐẠI TRỰC TRÀNG 16 1.3.1. Proteomic là gì? .................................................................................... 16 1.3.2. Công cụ nghiên cứu proteomics ............................................................ 17 1.3.3. Ứng dụng của proteomics trong nghiên cứu ung thư đại trực tràng ........ 19Chương 2 - NGUYÊN LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU ..................... 28 2.1. NGUYÊN LIỆU .......................................................................................... 28 2.1.1. Đối tượng nghiên cứu ............................................................................ 28 2.1.2. Hóa chất ................................................................................................ 28 2.1.3. Thiết bị.................................................................................................. 29 2.2. PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU................................................................ 29 2.2.1. Xử lý mẫu mô đại trực tràng.................................................................. 29 2.2.2. Định lượng protein bằng phương pháp Bradford ................................... 31 2.2.3. Điện di hai chiều ................................................................................... 31 2.2.4. Phân tích hình ảnh bản gel điện di hai chiều .......................................... 33 2.2.5. Cắt và thủy phân spot ............................................................................ 34 2.2.6. Phân tích khối phổ và nhậ ...