Luận văn Thạc sĩ Khoa học: Xác định và phân tích trình tự hệ gen ty thể hoàn chỉnh của giống lợn Ỉ tại Việt Nam

Kết cấu nội dung của luận văn gồm có phần mở đầu, nội dung, phần kết luận và danh mục tài liệu tham khảo. Luận văn gồm 3 chương. Chương 1: Tổng quan. Chương 2: Đối tượng và phương pháp. Chương 3: Kết quả và thảo luận.
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Luận văn Thạc sĩ Khoa học: Xác định và phân tích trình tự hệ gen ty thể hoàn chỉnh của giống lợn Ỉ tại Việt NamĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘITRƢỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN---------------------Nguyễn Đức HiếuXÁC ĐỊNH VÀ PHÂN TÍCH TRÌNH TỰHỆ GENE TY THỂ HOÀN CHỈNH CỦAGIỐNG LỢN Ỉ TẠI VIỆT NAMLUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA HỌCHà Nội –2016ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘITRƢỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN---------------------Nguyễn Đức HiếuXÁC ĐỊNH VÀ PHÂN TÍCH TRÌNH TỰHỆ GENE TY THỂ HOÀN CHỈNH CỦAGIỐNG LỢN Ỉ TẠI VIỆT NAMChuyên ngành: Sinh học thực nghiệmMã số: 60420114LUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA HỌCNGƢỜI HƢỚNG DẪN KHOA HỌC:TS. Võ Thị Bích ThủyTS. Hoàng Thị Mỹ HạnhHà Nội –2016Lời cảm ơnTrước tiên, tôi xin dành lời cảm ơn sâu sắc tới TS. Võ Thị Bích Thủy và TS.Hoàng Thị Mỹ Hạnh những người đã tận tình hướng dẫn tôi trong suốt quá trìnhnghiên cứu, thực hiện luận văn thạc sĩ này.Tôi xin gửi lời cảm ơn chân thành tới PGS. TS. Nghiêm Ngọc Minh, người đãluôn tạo điều kiện nghiên cứu tốt nhất cho tôi, cũng như luôn quan tâm, giúp đỡ vàtrao đổi những kinh nghiệm quý báu trong suốt quá trình nghiên cứu.Tôi cũng xin gửi lời cảm ơn đến PGS. TS. Nguyễn Lai Thành, người đã giúpđỡ, định hướng ban đầu cho tôi trong thời gian tôi học tập tại trường Đại học Khoahọc Tự nhiên, Đại học Quốc gia Hà Nội.Cuối cùng, tôi xin được gửi lời cảm ơn đến gia đình, và bạn bè tôi vì đã luônbên tôi trong công việc cũng như ngoài cuộc sống.Hà Nội, ngàythángnăm 2017Học viên cao họcNguyễn Đức Hiếu.MỤC LỤCDANH MỤC BẢNG ...................................................................................................... iiiDANH MỤC HÌNH ........................................................................................................ivDANH MỤC TỪ VIẾT TẮT ........................................................................................... vMỞ ĐẦU .......................................................................................................................... 1CHƢƠNG 1. TỔNG QUAN ............................................................................................ 21.1.Giới thiệu về giống lợn Ỉ..................................................................................... 21.1.1. Nguồn gốc giống vật nuôi ............................................................................... 21.1.2. Giống lợn nhà (Sus scrofa) ............................................................................. 21.1.3. Giống lợn Ỉ ...................................................................................................... 31.2. Tầm quan trọng của các nghiên cứu về lợn tại Việt Nam ..................................... 61.3. Marker trong nghiên cứu đa dạng di truyền .......................................................... 71.3.1. Cấu trúc hệ gen ty thể...................................................................................... 91.3.2. Ty thể trong nghiên cứu đa dạng di truyền ................................................... 101.4. Phương pháp giải trình tự Sanger ........................................................................ 121.5. Phương pháp phân tích sự chủng loại phát sinh .................................................. 171.5.1. Cây chủng loại phát sinh ............................................................................... 171.5.2. Phương pháp Bayesian.................................................................................. 19CHƢƠNG 2. ĐỐI TƢỢNG VÀ PHƢƠNG PHÁP ....................................................... 212.1. Đối tượng ............................................................................................................. 212.2. Vật liệu và trang thiết bị ...................................................................................... 212.3. Phương pháp ........................................................................................................ 212.3.1. Thu mẫu ......................................................................................................... 212.3.2. Tách chiết mẫu DNA tổng số (với nguồn mẫu là máu). ................................ 212.3.3. Thiết kế mồi ................................................................................................... 222.3.4. Khuếch đại trình tự hệ gen ty thể bằng kỹ thuật PCR ................................... 232.3.5. Giải trình tự trên máy ABI 3500 ................................................................... 242.3.6. Xử lí kết quả giải trình tự .............................................................................. 252.3.7. Phân tích trình tự .......................................................................................... 262.3.8. Phân tích sự chủng loại phát sinh ................................................................. 26CHƢƠNG 3. KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN ................................................................. 273.1. Thu thập và giả ...