Nghiên cứu đặc điểm vùng gen 18S rRNA, GEN rbcL và mối quan hệ phát sinh loài của cây bảy lá một hoa (Paris vietnamensis) thu tại Yên Bái

Cây bảy lá một hoa (Paris vietnamensis) là một trong những loại dược liệu quan trọng được sử dụng trong y học truyền thống. Trong nghiên cứu, vùng gen 18S rRNA và rbcL của cây bảy lá một hoa thu tại Yên Bái được phân lập, giải trình tự và phân tích đặc điểm. Hơn nữa, nghiên cứu cũng đánh giá khả năng sử dụng 18S rRNA và rbcL để phân loại, định danh và sự phát sinh loài.
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Nghiên cứu đặc điểm vùng gen 18S rRNA, GEN rbcL và mối quan hệ phát sinh loài của cây bảy lá một hoa (Paris vietnamensis) thu tại Yên Bái TNU Journal of Science and Technology 229(01): 38 - 43RESEARCH ON CHARACTERISTICS OF THE 18S rRNA PARTIAL GENE,THE rbcL GENE AND PHYLOGENETIC RELATIONSHIPOF Paris vietnamensis COLLECTED IN YEN BAICao Ba Cuong1*, Nguyen Van Tru2, La Viet Hong11Hanoi Pedagogical University 2, 2Institute of Biotechnology - VAST ARTICLE INFO ABSTRACT Received: 06/7/2023 The Paris vietnamensis is one of the important medicinal herbs that was used in traditional medicine. In this study, the partial 18S rRNA Revised: 17/10/2023 gene and rbcL gene of the P. vietnamensis collected in Yen Bai were Published: 18/10/2023 isolated, sequenced, and characterized. Moreover, the study also evaluated the potential application of 18S rRNA and rbcL to classify,KEYWORDS identify, and phylogeny of species. The results showed that the length of 18S rRNA and rbcL were 973 bp and 563 bp, respectively; GCParis vietnamensis content of these two gene regions was 50.98 (%) and 44.23 (%).Characteristics Analysis by BLAST program with the published 18S rRNA and rbcL sequences of the Paris genus had shown that the 18S rRNA gene18S rRNA region of this study had high similarity from 99.08 to 99.28% andrbcL gene region contained two conserved sequences that were from 84 to 604 andYen Bai from 606 to 871. The rbcL gene had high similarity (99.82%) to the published rbcL sequences of the Paris genus. The 18S rRNA gene region may be a potential DNA barcode candidate to support classification and identification at the species level, while the rbcL may support classification and identification at the genus level.NGHIÊN CỨU ĐẶC ĐIỂM VÙNG GEN 18S rRNA, GEN rbcLVÀ MỐI QUAN HỆ PHÁT SINH LOÀI CỦA CÂY BẢY LÁ MỘT HOA(Paris vietnamensis) THU TẠI YÊN BÁICao Bá Cường1*, Nguyễn Văn Trữ2*, La Việt Hồng11Trường Đại học Sư phạm Hà Nội 2, 2Viện Công nghệ Sinh học - Viện Hàn lâm Khoa học & Công nghệ Việt Nam THÔNG TIN BÀI BÁO TÓM TẮT Ngày nhận bài: 06/7/2023 Cây bảy lá một hoa (Paris vietnamensis) là một trong những loại dược liệu quan trọng được sử dụng trong y học truyền thống. Trong Ngày hoàn thiện: 17/10/2023 nghiên cứu, vùng gen 18S rRNA và rbcL của cây bảy lá một hoa thu Ngày đăng: 18/10/2023 tại Yên Bái được phân lập, giải trình tự và phân tích đặc điểm. Hơn nữa, nghiên cứu cũng đánh giá khả năng sử dụng 18S rRNA và rbcLTỪ KHÓA để phân loại, định danh và sự phát sinh loài. Kết quả cho thấy kích thước của 18S rRNA và rbcL lần lượt là 973 bp và 563 bp; hàm lượngBảy lá một hoa GC của hai vùng gen này lần lượt là 50,98 (%) và 44,23 (%). PhânĐặc điểm tích bằng chương trình BLAST với các trình tự 18S rRNA và rbcL đã18S rRNA công bố của chi Paris cho thấy vùng gen 18S rRNA của nghiên cứu này có độ tương đồng cao từ 99,08 đến 99,28%, chứa hai trình tự bảoVùng gen rbcL tồn cao đó là từ vị trí 84 đến vị trí 604 và từ vị trí 606 đến vị trí 871.Yên Bái Gen rbcL có độ tương đồng cao (99,82%) so với các trình tự rbcL của một số loài thuộc chi Paris đã công bố. Vùng gene 18S rRNA có thể là ứng viên mã vạch DNA tiềm năng trong hỗ trợ việc phân loại, định danh ở mức độ loài, trong khi gen rbcL có thể hỗ trợ phân loại, định danh ở mức độ chi.DOI: https://doi.org/10.34238/tnu-jst.8289* Corresponding author. Email: caobacuong@hpu2.edu.vn, nvtru@ibt.ac.vnhttp://jst.tnu.edu.vn 38 Email: jst@tnu.edu.vn TNU Journal of Science and Technology 229(01): 38 - 431. Giới thiệu Cây bảy lá mộ ...