protein liên kết hộp TATA

TBP (TATA - Binding Protein) là protein liên kết đặc hiệu DNA với đoạn trình tự của hộp TATA. TBP có chức năng biến tính DNA và bẻ cong phân tử DNA một góc 90°. Điều này cần thiết để khởi động cho cơ chế phiên mã. TBP bám vào rãnh nhỏ của phân tử DNA bằng một cấu trúc nếp gấp beta. Vai trò của TBP Trong quá trình phiên mã ở những tế bào eukaryote, TBP là thành phần bắt buộc của nhân tố phiên mã TFIID để khởi động chính xác quá trình này đối với...
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
protein liên kết hộp TATATBP (TATA - Binding Protein)là protein liên kết đặc hiệu DNAvới đoạn trình tự của hộp TATA.TBP có chức năng biến tínhDNA và bẻ cong phân tử DNAmột góc 90°. Điều này cần thiếtđể khởi động cho cơ chế phiênmã. TBP bám vào rãnh nhỏ củaphân tử DNA bằng một cấutrúc nếp gấp beta.Vai trò của TBPTrong quá trình phiên mã ởnhững tế bào eukaryote, TBP làthành phần bắt buộc của nhân tốphiên mã TFIID để khởi độngchính xác quá trình này đối vớicác gene có hay không có hộpTATA. Để hỗ trợ Pol II, mộtloại RNA polymerase, khi tổnghợp mRNA, TBP thường phảitương tác với một số các proteinhỗ trợ, gọi là TBP-associatedfactors (TAF). Thành phần củanhóm protein TAF có tính đặchiệu đối với từng gene, tếbào, mô và giai đoạn phát triển.Sự nhận biết và liên kết với hộpTATATBP tạo liên kết đặc hiệu với hộpTATA bằng 2 loại tương tác hóahọc. Đầu tiên, chuỗi các aminoacid giàu lysine và arginine (cácamino acid nhóm kiềm) hìnhthành liên kết với gốc phosphatecủa những nucleic base. Đâychính là cách thức cơ bản để cácprotein DBP có thể liên kết vớiphân tử DNA. Tiếp đến,4 phenyalanine tại các vị trí đặctrưng (thường là 99, 116, 190, và207) của TBP sẽ tạo thành cấutrúc kẹp trong không gian nhằmxen cài vào rãnh nhỏ của phân tửDNA. Tương tác này giúp TBPcó thể bẻ gập phân tử DNA mộtcách dễ dàng. Ngoài ra,2 asparagine nằm đối xứng trongkhông gian (vị trí 69 và 159) cókhả năng hình thành các liên kếthydro với những base đặc hiệucủa hộp TATA. Qua đó, TBP cóthể nhận biết và tạo liên kếtchính xác với vùng hộp TATA.Họ protein TBPXem thêm Protein liên kết DNA (DBP) Cấu trúc không gian protein