Tóm tắt Luận án Tiến sĩ Sinh học: Nghiên cứu đặc điểm kháng kháng sinh và gen liên quan ở các chủng Salmonella đa kháng

Mục tiêu nghiên cứu của Luận án nhằm phân lập và định danh các chủng Salmonella từ thịt lợn, thịt bò, và thịt gà tại các chợ bán lẻ ở khu vực Hà Nội. Xác định đặc điểm kháng kháng sinh của các chủng Salmonella phân lập được. Phân tích các nhóm gen ở các chủng Salmonella đa kháng kháng sinh. Mời các bạn cùng tham khảo!
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Tóm tắt Luận án Tiến sĩ Sinh học: Nghiên cứu đặc điểm kháng kháng sinh và gen liên quan ở các chủng Salmonella đa kháng VIỆN HÀN LÂM KHOA HỌCBỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM HỌC VIỆN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ ……..….***………… NGUYỄN THANH VIỆT NGHIÊN CỨU ĐẶC ĐIỂM KHÁNG KHÁNG SINH VÀ GEN LIÊN QUAN Ở CÁC CHỦNG Salmonella ĐA KHÁNG Chuyên ngành: Vi sinh vật Mã số: 9420107 TÓM TẮT LUẬN ÁN TIẾN SĨ SINH HỌC Hà Nội - 2020Công trình được hoàn thành tại: Học viện Khoa học và Công nghệ - Viện Hàn lâm Khoa học và Công nghệ Việt Nam.Người hướng dẫn khoa học 1: GS.TS. Nghiêm Ngọc MinhNgười hướng dẫn khoa học 2: PGS.TS. Võ Thị Bích ThủyPhản biện 1: …Phản biện 2: …Phản biện 3: ….Luận án sẽ được bảo vệ trước Hội đồng đánh giá luận án tiến sĩ cấp Họcviện, họp tại Học viện Khoa học và Công nghệ - Viện Hàn lâm Khoa họcvà Công nghệ Việt Nam vào hồi … giờ’, ngày … tháng … năm 2019.Có thể tìm hiểu luận án tại:- Thư viện Học viện Khoa học và Công nghệ- Thư viện Quốc gia Việt Nam MỞ ĐẦU1. Tính cấp thiết của luận án Theo tổ chức Y tế Thế giới (WHO), gánh nặng của các bệnhtừ thực phẩm là rất lớn. Theo đó, mỗi năm cứ khoảng 10 người thì có1 người bị bệnh. Bệnh từ thực phẩm có thể tiến triển nghiêm trọng,đặc biệt là đối với trẻ nhỏ, người già và người suy giảm miễn dịch.Trong số các bệnh do thực phẩm gây ra thì tiêu chảy là phổ biến nhấtdo sử dụng thực phẩm không an toàn, 550 triệu người bị bệnh này mỗinăm, trong đó có 220 triệu trẻ em dưới 5 tuổi. Salmonella là một trong4 nguyên nhân chính gây ra bệnh tiêu chảy trên toàn cầu. Khả năng kháng kháng sinh của Salmonella đang tăng lênnhanh chóng và trở thành mối đe dọa lớn tới sức khỏe loài người.Salmonella kháng kháng sinh gây khó khăn cho việc kiểm soát nhiễmkhuẩn, dự phòng và điều trị bệnh. Do vậy, việc phân lập và xác địnhđặc điểm kháng kháng sinh của Salmonella từ thực phẩm là việc làmcần thiết. Việc nghiên cứu đặc điểm kháng kháng sinh của Salmonellasẽ cung cấp thông tin quan trọng cho việc dự phòng, kiểm soát bệnhtật cũng như kiểm soát ô nhiễm thực phẩm và quy định sử dụng khángsinh trong điều trị và chăn nuôi nhằm hạn chế khả năng kháng khángsinh của vi khuẩn này. Ở Việt Nam hiện nay, chưa có nghiên cứu nào về phân tíchcác nhóm gen ở vi khuẩn Salmonella đa kháng kháng sinh phân lậpđược từ thực phẩm bằng công nghệ giải trình tự thế hệ mới. Nghiêncứu các nhóm gen này giúp hiểu biết sâu về dịch tễ học phân tử cácgen kháng kháng sinh. Quan trọng hơn là có thể phát hiện được cácđột biến mới ở gen kháng kháng sinh gây ra tính kháng kháng sinh ởSalmonella. Ngoài ra còn có thể tìm ra các nhóm gen mới có khả nănggây nên tính kháng kháng sinh ở loài vi khuẩn này 1 Theo tổ chức Nông lương Liên Hiệp Quốc, Việt Nam là quốcgia có lượng tiêu thụ thịt bò, thịt lợn, và thịt gia cầm tăng lên rất nhanhkể từ năm 1993 trở lại đây và được dự báo là sẽ tăng lên đáng kể trongnhững năm tiếp theo. Vì vậy, luận án này đã được thực hiện với mụctiêu và nội dung sau:2. Mục tiêu nghiên cứu của luận án• Phân lập và định danh các chủng Salmonella từ thịt lợn, thịt bò, và thịt gà tại các chợ bán lẻ ở khu vực Hà Nội.• Xác định đặc điểm kháng kháng sinh của các chủng Salmonella phân lập được.• Phân tích các nhóm gen ở các chủng Salmonella đa kháng kháng sinh.3. Các nội dung nghiên cứu chính của luận án• Nuôi cấy phân lập, định danh vi khuẩn từ các mẫu thịt thu thập được ở các chợ trên địa bàn Hà Nội, lựa chọn các mẫu nhiễm vi khuẩn Salmonella.• Tiến hành thử nghiệm kháng sinh đồ, từ đó lựa chọn ra các chủng Salmonella đa kháng kháng sinh.• Giải trình tự gen thế hệ mới một số chủng Salmonella đa kháng kháng sinh để phân tích các nhóm gen liên quan. Xác nhận một số kết quả bằng phương pháp giải trình tự gen Sanger. CHƯƠNG 1. TỔNG QUAN1.1. Đặc điểm sinh học của Salmonella Salmonella là trực khuẩn Gram âm, di động, không có vỏ vàkhông sinh bào tử. Salmonella dễ nuôi, vừa ưa khí vừa kỵ khí, có thểmọc trên một số môi trường có chất ức chế chọn lọc như XLD. Trongmôi trường XLD, khuẩn lạc của Salmonella thường có màu đỏ, ở giữacó màu đen. Salmonella có sức đề kháng cao ở ngoại cảnh, tuy nhiên 2nhạy cảm với nhiệt độ, có thể bị tiêu diệt từ 700C trở lên. Salmonellacó 3 loại kháng nguyên là kháng nguyên thân O, kháng nguyên lôngH, và kháng nguyên Vi. Ngày nay, Salmonella được phân thành hai loài là S. bongorivà S. enterica. Trong đó, S. enterica được chia thành 6 dưới loài là: I(enterica), II (salamae), IIIa (arizonae), IIIb (diarizonae), IV(houtenae) và VI (indica).1.2. Đặc điểm hệ gen của Salmonella1.2.1. Cấu trúc hệ gen Kích thước hệ gen của Salmonella rất khác nhau (3,39-5,59Mb). Số gen trung bình là 4.742. Salmonella có từ 1 đến 2 plasmidkích thước từ 2-200 kb. S. enterica cần khoảng 3.499 gen và S. bongoricần khoảng 3.368 gen để đảm bảo cho quá trình sinh trưởng bìnhthường. Hệ gen của Salmonella có độ tương đồng từ 65% đến 99%,có tính bảo thủ cao và sự biến đổi chỉ tập trung vào một số vùng đặcbiệt. Có khoảng 2.800 họ gen có mặt ở tất cả các Salmonella và tổngsố họ gen của tất cả các serovar là khoảng 10.000.1.2.2. Cơ chế kháng kháng sinh ở Salmonella Salmonella thường đề kháng một số nhóm kháng sinh phổbiến là aminoglycoside, β- lactam, chloramphenicol, quinolone,tetracycline, sulfonamide và trimethoprim. Nhóm Aminoglycoside. Salmonella sử dụng cơ chế biểu hiệncác enzyme để biến đổi aminoglycoside qua trung gian plasmid để đềkháng aminoglycoside. Các enzyme này được phân loại thành banhóm và được đặt tên dựa trên các ...