Tóm tắt Luận văn Thạc sĩ Khoa học: Đánh giá đa dạng sinh học vi sinh vật liên kết với hải miên tại vùng biển Đà Nẵng Việt Nam thông qua nghiên cứu metagenomics bằng kỹ thuật 16s rRNA Miseq Sequencing

Luận văn có kết cấu nội dung gồm phần mở đầu, phần nội dung, phần kết luận và danh mục tài liệu tham khảo. Phần nội dung gồm 3 chương. Chương 1: Tổng quan. Chương 2: Vật liệu và phương pháp nghiên cứu. Chương 3: Kết quả và thảo luận.
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Tóm tắt Luận văn Thạc sĩ Khoa học: Đánh giá đa dạng sinh học vi sinh vật liên kết với hải miên tại vùng biển Đà Nẵng Việt Nam thông qua nghiên cứu metagenomics bằng kỹ thuật 16s rRNA Miseq SequencingĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘITRƢỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN---------------------NGUYỄN MẠNH HÙNGĐÁNH GIÁ ĐA DẠNG SINH HỌC VI SINH VẬT LIÊN KẾT VỚI HẢI MIÊN TẠIVÙNG BIỂN ĐÀ NẴNG VIỆT NAM THÔNG QUA NGHIÊN CỨU METAGENOMICSBẰNG KỸ THUẬT 16S rRNA MISEQ SEQUENCING.LUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA HỌCHà Nội – Năm 2016ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘITRƢỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN---------------------NGUYỄN MẠNH HÙNGĐÁNH GIÁ ĐA DẠNG SINH HỌC VI SINH VẬT LIÊN KẾT VỚI HẢI MIÊN TẠIVÙNG BIỂN ĐÀ NẴNG VIỆT NAM THÔNG QUA NGHIÊN CỨU METAGENOMICSBẰNG KỸ THUẬT 16S rRNA MISEQ SEQUENCING.Chuyên ngành: Vi sinh vật họcMã số: 60420107LUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA HỌCNGƢỜI HƢỚNG DẪN KHOA HỌC:PGS.TS. NGUYỄN THỊ KIM CÚCTS. PHẠM ĐỨC NGỌCHà Nội – Năm 2016Lời cam đoan.Tôi xin cam đoan kết quả thể hiện trong bản luận văn này là công trình nghiên cứu thựctế. Toàn bộ số liệu, kết quả nghiên cứu trong luận văn là hoàn toàn trung thực, kháchquan, chưa được công bố công khai bởi một ai khác.Lời cảm ơn.Đề tài này là kết quả của một quá trình học tập và nghiên cứu khoa học của bản thân,cùng với sự giúp sức của rất nhiều cá nhân và tập thể.Để có được thành công này, tôi xin bày tỏ lòng kính trọng và biết ơn sâu sắc đếnPGS.TS. Nguyễn Thị Kim Cúc, người đã giúp tôi rất nhiều bằng chính sự tâm huyết vàđam mê với lĩnh vực nghiên cứu khoa học.Tôi cũng xin được tỏ lòng cảm ơn chân thành tới các cán bộ thuộc phòng Công nghệsinh học, viện Hoá sinh biển; Viện nghiên cứu khoa học Miền Trung, Viện Hàn lâmkhoa học Việt Nam đã có những hỗ trợ, đóng góp, tư vấn rất nhiệt tình giúp tôi hoànthiện đề tài.Tôi thật sự rất biết ơn người thân, bạn bè và đồng nghiệp đã giành tình cảm, đặt niềmtin, hỗ trợ, động viên; đồng thời cũng là nguồn động lực to lớn góp phần giúp tôi hoànthiện đề tài này. Với sự hỗ trợ về kiến thức; các nguồn dữ liệu bổ sung; các công trìnhnghiên cứu khoa học có liên quan ở trong nước và trên thế giới-Tập thể các Thầy côthuộc khoa sinh học; Bộ môn Vi sinh vật học và đặc biệt TS Phạm Đức Ngọc đã giúptôi làm nên sự thành công của đề tài này.Tôi xin chân thành cảm ơn!Hà Nội, ngày 27 tháng 12 năm 2016.Nguyễn Mạnh HùngMỤC LỤCMỞ ĐẦU .......................................................................................................................... 8CHƢƠNG 1: TỔNG QUAN ............................................................................................ 91.1.Sơ lược về hải miên ............................................................................................ 91.2.Vai trò và tầm quan trọng của vi sinh vật liên kết với hải miên....................... 121.3.Đa dạng sinh học vi sinh vật liên kết với hải miên........................................... 181.4.Sơ lược về gen 16S rRNA ................................................................................ 231.5.Sơ lược về MiSeq Sequencing.......................................................................... 24CHƢƠNG 2: VẬT LIỆU VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨUError! Bookmark notdefined.2.1 VẬT LIỆU ............................................................ Error! Bookmark not defined.2.2. PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU ....................... Error! Bookmark not defined.2.2.1 Tách DNA ...................................................... Error! Bookmark not defined.2.2.2 Thiết kế thư viện 16S rRNA cho MiSeq ........ Error! Bookmark not defined.2.2.3 Phân tích thư viện 16S rRNA ......................... Error! Bookmark not defined.CHƢƠNG 3: KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN ................ Error! Bookmark not defined.3.1 KẾT QUẢ ............................................................. Error! Bookmark not defined.3.1.1. Tách DNA metagenome của vi sinh vật liên kết hải miênError! Bookmarknot defined.3.1.2. Khuếch đại vùng siêu biến V4 của gen 16S rRNA và gắn barcodes .... Error!Bookmark not defined.3.1.3. Đa dạng các cộng đồng vi sinh vật liên kết hải miên biển Đà Nẵng..... Error!Bookmark not defined.3.2 THẢO LUẬN ....................................................... Error! Bookmark not defined. ...