Ứng dụng công nghệ thông tin để quản lý dữ liệu sinh vật biến đổi gen

Khoảng thơi gian cuối thế kỷ 21 nêǹ khoa hoc̣ kỹ thuâṭ thế giơi đã phat́ triên̉ vươt bâc̣ , đăc̣ biệt là hai lĩnh vưc công nghệ thông tin và công nghệ sinh học. Công nghệ thông tin đã thúc đẩy sư phát triển của hầu hết các lĩnh vưc khoa học kỹ thuật, kể cả công nghệ sinh học và phát sinh chuyên ngành mơi có tên goị là tin sinh hoc̣ . Tin sinh học (bioinformatics) là một lĩnh vưc khoa học sử dụng các công nghệ của các ngành toán học ứng dụng, tin học, thống kê và khoa học máy...
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Ứng dụng công nghệ thông tin để quản lý dữ liệu sinh vật biến đổi gen Ưng dung công nghệ thông tin để quan lý dư liêu sinh vât biên đôi gen ̣ ̉ ̣ ̣ ́ ̉ Nguyên Duy Binha, Đăng Trong Lương b, Hoang Dương Tung c ̃ ̀ ̣ ̣ ̀ ̀ a TS., Việ n Khí tương và Thủy văn, Bộ Môi trương và Tai nguyên. b TS., Viên D i truyên Nông nghiêp, Bộ ̀ ̣ ̀ ̣ Nông nghiêp và Phat triên Nông thôn. c TS., Trung tâm Quan trắc và Dữ liệu Môi trương, Bộ Môi trương và Tai ̣ ́ ̉ ̀ nguyên. An application of informatic technology in management of genetic modified data Abstract In the year 2000, U.S. scientists announced that they had launched what they said was a scientific revolution, that they had opened the book on human life. Three years latter, in April 2003, they delivered a list – chemical by chemical – what the DNA in human genes is made of. And since then, the amount of genomic data revealed by scientists around the world had became such enourmous that without database technology it is impossible to be handled efficiently. The present study is among the first in Vietnam to store and manage GMO data in a database management system (DBMS) with the potentially Web powered access for the Vietnamese scientific community. The system was designed and implemented at the Hanoi Institute of Genomatic Research with the available advanced computer science technologies such as .NET and Web powered database. Our GMO database is opened to be enlarge and its management software is robust and comprises of friendly user interfaces. The paper presents the methods and technologies used to develop the system as well as the primary results of the study. 1 Mơ đâu ̀ Khoang thơi gian cuôi thế kỷ 21 nên khoa hoc kỹ thuât thế giơi đã phat triên vươt bâc, đăc ̉ ́ ̀ ̣ ̣ ́ ̉ ̣ ̣ biêt là hai linh vưc công nghệ thông tin và công nghệ sinh hoc. Công nghệ thông tin đã thuc đây ̣ ̃ ̣ ́ ̉ sư phat triên cua hâu hêt cac linh vưc khoa hoc kỹ thuât, kể cả công nghệ sinh hoc và phat sinh ́ ̉ ̉ ̀ ́ ́ ̃ ̣ ̣ ̣ ́ chuyên nganh mơi có tên goi là tin sinh hoc. Tin sinh học (bioinformatics) là một lĩnh vưc khoa ̀ ̣ ̣ học sử dụng các công nghệ của các ngành toán học ứng dụng, tin học, thống kê và khoa học máy tính để giải quyết các vấn đề sinh học [1] (Bách khoa toàn thư mở Wikipedia). Những lĩnh vưc nghiên cứu chính của nó bao gồm bắt cặp trình tư (sequence alignment), bắt cặp cấu trúc protein (protein structural alignment), dư đoán cấu trúc protein (protein structure prediction), dư đoán biểu hiện gene (gene expression) và tương tác protein - protein (protein-protein interactions), và mô hình hóa quá trình tiến hoá. Những mối quan tâm chính trong các dư án tin sinh học và sinh học tính toán là việc sử dụng các công cụ toán học để trích rút các thông tin hữu ích từ các dữ liệu gen thu nhận đươc từ các kĩ thuật sinh học. Khôi ́ lương dữ liêu gen thu nhân đươc từ cac nghiên cứu sinh hoc gen trên toan thế giơi đã trở nên ̣ ̣ ́ ̣ ̀ vô cung to lơn và đăc biêt tôc độ tăng trưởng dữ liêu trong hai năm qua đã vươt quá moi dư ̀ ̣ ̣ ́ ̣ ̣ đoan trươc đây. Từ những năm 90, Hoa ky, Nhât ban và Châu Âu đã phat triên cac công cụ truy ́ ̀ ̣ ̉ ́ ̉ ́ câp và phân tich dữ liêu gen trên cơ sở ứng dung cac tiên bộ về công nghệ tin hoc như GenBank ̣ ́ ̣ ̣ ́ ́ ̣ cua Trung tâm Quôc gia về Công nghệ Tin Sinh hoc (the National Center for Biotechnology ̉ ́ ̣ Information, NCBI), Hoa ky, EMBL cua Việ n Công nghệ Tin Sinh học Châu Âu (the European ̀ ̉ Bioinformatics Institute, EBI), và DDBJ cua Tổ chức Ngân hàng Dữ liệu Gen Nhật bản (the ̉ DNA Data Bank of Japan, DDBJ). Cac CSDL nay cho phep câp nhâp tư do bât cứ day dữ liêu ...