Bài giảng Tin sinh học

Bài giảng Tin sinh học với mục tiêu là giới thiệu khái quát cách tìm kiếm nguồn thông tin trên Internet, phục vụ cho việc học tập, nghiên cứu, viết luận văn. Trang bị kiến thức cơ bản và một số công cụ thông dụng của tin sinh học để: Khai thác và xử lý các thông tin sinh học Ứng dụng trong lĩnh vực nghiên cứu, trong phòng thí nghiệm và thực tiễn.
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Bài giảng Tin sinh học 1/6/2019 Mục tiêu của môn học: Tin sinh học (Bioinformatics) Thông tin về học phần Giới thiệu khái quát cách tìm kiếm nguồn thông tin trên Internet, phục vụ cho việc học tập, nghiên cứu, viết luận văn. Mã học phần: SH3036 Số tín chỉ: 3 (2LT + 1TH) Trang bị kiến thức cơ bản và một số công cụ thông dụng của Học phần tiên quyết: tin sinh học để: + Sinh học phân tử I, II (SH2003; SH2004), Khai thác và xử lý các thông tin sinh học + Kỹ thuật di truyền - nguyên lý và ứng dụng Ứng dụng trong lĩnh vực nghiên cứu, trong phòng thí nghiệm và thực tiễn. Nội dung của môn học Tóm tắt nội dung môn học Phần 1. Lý thuyết Phần 2. Giới thiệu một số công cụ phân tích CSDL sinh học Phần 1. Lý thuyết Phần 3. Thực hành trên máy tính 1. Giới thiệu đôi nét về Internet và phương pháp tìm kiếm thông tin cơ bản Nhiệm vụ của sinh viên 2. Nền tảng sinh học của Bioinformatics Dự lớp, thảo luận Thực hành, làm bài tập 3. Sự ra đời và vai trò của Bioinformatics 4. Cơ sở dữ liệu sinh học (CSDL) Hình thức thi: Thi viết và thực hành trên máy tính Thang điểm đánh giá: Thang điểm 10,0 5. So sánh trình tự (sequence alignment) Chuyên cần: dự lớp, thảo luận…: 10% 6. Phân tích gene và promoter Kiểm tra giữa kỳ, báo cáo thực hành/tiểu luận…: 20% Điểm thi cuối kỳ (lý thuyết + thực hành) 70% Tóm tắt nội dung môn học Tóm tắt nội dung môn học Phần 2. Giới thiệu một số công cụ phân tích CSDL sinh họcPhần 1. Lý thuyết 1. Tìm kiếm thông tin về các gene, các bài báo và những thông 7. Nghiên cứu mối quan hệ tiến hóa của sinh vật ở mức độ phân tử tin liên quan (molecular phylogenetics) 2. Tìm kiếm các CSDL tương đồng 8. Tin sinh học trong nghiên cứu cấu trúc phân tử 3. So sánh các trình tự sinh học 9. Nghiên cứu genomics và proteomics 4. Phân tích các trình tự ADN 10. Sinh học hệ thống (Systems Biology): Phân tích chức năng của các 5. Phân tích trình tự protein genome 6. Phân tích gene và promoter 7. Làm quen với cấu trúc 3 chiều của phân tử protein 1 1/6/2019 Tài liệu học tập Tóm tắt nội dung môn học 1. J.Xiong (2006). Essential bioinformatics, Cambridge University Press.Phần 3. Thực hành 2. Hu ...