Bản đồ promoter hoạt động của genome người

Bất kỳ gene mã hóa protein nào trong tế bào eukaryote đều bắt đầu phiên mã của nó bằng cách lắp ghép phức hệ tiền khởi động RNA polymerase II (PIC - preinitiation complex ) vào promoter. Các promoter, cùng với enhancer, silencer và insulator tạo thành tổ hợp mã đặc hiệu trong hầu hết các mô hình biểu hiện gene.
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Bản đồ promoter hoạt động của genome người Bản đồ promoter hoạt động của genome ngườiBất kỳ gene mã hóa proteinnào trong tế bào eukaryote đềubắt đầu phiên mã của nó bằngcách lắp ghép phức hệ tiền khởiđộng RNA polymerase II (PIC - preinitiation complex ) vàopromoter. Các promoter, cùngvới enhancer, silencer vàinsulator tạo thành tổ hợp mãđặc hiệu trong hầu hết các môhình biểu hiện gene.Sốpromotertrùng vớigene trênEnsEMBL(trên) hoặcpromoterđã chúthích trên Tuy nhiên, khả năngDBTSS phân tích logic quá(dưới) trình điều khiển sựmã hóa trong genome người hiệnbị giới hạn do không có thông tinpromoter chính xác của hầu hếtcác gene. Trong nghiên cứunày, Kim và cộng sự đã xác địnhbản đồ promoter hoạt động trênquy mô toàn bộ genome củanguyên bào sợi (fibroblast cell)người.Để đạt được kết quả trên, họchọn cách tiếp cận thực nghiệmđể xác định vị vị trí gắn của PICtrên toàn bộ genome. Bản đồ nàychỉ ra10.567 promoter hoạt độngtương ứng với 6.763 gene đãbiết và ít nhất 1.196 đơn vị phiênmã chưa được chú thích. Từ đócho thấy các cụmpromoter (multi promoter) đượcsử dụng phổ biến khi phiên mãvà tính chất phân tán xuyên suốtbộ gene của các nhóm promoterhoạt động .Ngoài ra, khi xem xét phổ biểuhiện trên quy mô toàn bộ genomehọ cũng tìm ra bốn nhómpromoter phổ quát màchúng quy định tòanbộ transcriptome (phổ phiên mã)của tế bào.Các kết quả này cung cấp mộtcái nhìn tổng thể mối liên hệchức năng giữa bộ máy phiênmã, cấu trúc nhiễm sắc chất vàsự biểu hiện gene của tế bàongười.