Đặc điểm phân tử virus hợp bào hô hấp ở trẻ mắc nhiễm khuẩn hô hấp dưới nặng cộng đồng và bệnh viện tại Thành phố Hồ Chí Minh Việt Nam, 2010

Đề tài này được tiến hành để khảo sát đặc điểm phân tử của virus hợp bào hô hấp (Respiratory syncytial virus: RSV) gây nhiễm trùng hô hấp dưới nặng (cộng đồng và bệnh viện) ở trẻ nhập viện tại khoa hô hấp, bệnh viện Nhi Đồng 1. Nghiên cứu mô tả có phân tích, tiền cứu thực hiện ở trẻ nhập phòng cấp cứu khoa hô hấp - bệnh viện Nhi Đồng 1.
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Đặc điểm phân tử virus hợp bào hô hấp ở trẻ mắc nhiễm khuẩn hô hấp dưới nặng cộng đồng và bệnh viện tại Thành phố Hồ Chí Minh Việt Nam, 2010Y Học TP. Hồ Chí Minh * Tập 18 * Phụ bản của Số 4 * 2014Nghiên cứu Y họcĐẶC ĐIỂM PHÂN TỬ VIRUS HỢP BÀO HÔ HẤPỞ TRẺ MẮC NHIỄM KHUẨN HÔ HẤP DƯỚI NẶNG CỘNG ĐỒNGVÀ BỆNH VIỆN TẠI TP. HỒ CHÍ MINH, VIỆT NAM, 2010.Trần Anh Tuấn*, H Rogier Van Doorn*, Đỗ Liên Anh Hà*, Trần Tấn Thanh*TÓM TẮTMục tiêu: Khảo sát đặc điểm phân tử của virus hợp bào hô hấp (Respiratory syncytial virus: RSV) gâynhiễm trùng hô hấp dưới nặng (cộng đồng và bệnh viện) ở trẻ nhập viện tại khoa hô hấp, bệnh viện Nhi Đồng 1.Phương pháp nghiên cứu: Nghiên cứu mô tả có phân tích, tiền cứu thực hiện ở trẻ nhập phòng cấp cứuKhoa Hô hấp – bệnh viện Nhi Đồng 1. Thực hiện phết mũi hầu (bằng flocked nasopharyngeal swabs) để tầm soátnhiễm khuẩn RSV (cộng đồng và bệnh viện) bằng real-time RT-PCR sau đó phân tích trình tự gen.Kết quả: Trong thời gian 1 năm (2010), có 1,439 trẻ nhập phòng cấp cứu khoa hô hấp – bệnh viện Nhi Đồng1 được tầm soát nhiễm khuẩn RSV. RSV được phát hiện trong vòng 72 giờ đầu sau khi nhập viện ở 26% bệnh nhi(376/1439; RSV A: n=320; RSV B: n=54; RSV A và B: n=2). Trong số trẻ có RSV âm tính trong vòng 72 giờ saunhập viện, 6,6% trẻ (25/377) nhiễm khuẩn bệnh viện do RSV (RSV A: n=22; and RSV B: n=3).Phân tích trình tự gen từ 78,8% (316/341) mẫu bệnh phẩm dương tính cho thấy có sự lưu hành đồng thờicủa nhiều genotypes RSV khác nhau, trong đó NA1 chiếm ưu thế ((NA1: n=275; GA5: n=5; BA3: n=3; BA9:n=26; BA10: n=7). GA5 và BA3 là 2 genotypes chưa được báo cáo ở Việt Nam trước đây.Kết luận: RSV là tác nhân quan trọng gây nhiễm khuẩn hô hấp dưới ở trẻ em, cả ở cộng đồng lẫn bệnh viện.Nghiên cứu này góp phần tăng cường hiểu biết về tính đa dạng về mặt di truyền của RSV lưu hành ở Việt Nam.Từ khóa: Virus hợp bào hô hấp, đặc điểm phân tử, nhiễm khuẩn hô hấp dưới, nhiễm khuẩn bệnh viện doRSV.ABSTRACTMOLECULAR CHARACTERISTICS OF HUMAN RESPIRATORY SYNCYTIAL VIRUSCAUSING SEVERE NOSOCOMIAL AND COMMUNITY ACQUIRED LOWER RESPIRATORYINFECTIONS IN CHILDREN IN HO CHI MINH CITY, VIETNAM, 2010Tran Anh Tuan, H Rogier Van Doorn, Do Lien Anh Ha, Tran Tan Thanh* Y Hoc TP. Ho Chi Minh * Vol. 18 - Supplement of No 4- 2014: 109 - 115Objective: Study on molecular characteristics of human respiratory syncytial virus in children admittedwith nosocomial and community-acquired lower respiratory infections in emergency unit of respiratory ward,Children’s Hospital 1.Methods: This descriptive prospective study was conducted in children admitted in emergency unit ofrespiratory ward, Children’s Hospital 1. The screening of community and hospital-acquired RSV infections wasperformed by flocked nasopharyngeal swabs. The real-time RT-PCR and phylogenetic analysis of partial G genesequences were used in detection and analysis of molecular characteristics of RSV.Results: During a one year surveillance study (2010) we took serial samples from 1,439 children admitted tothe Emergency Unit of the Respiratory Ward of Children’s Hospital 1 in Ho Chi Minh City, Vietnam. RSV wasdetected within 72h of admission to the ward in 26 % (376/1439; RSV A: n=320; RSV B: n=54, and RSV A and* Bệnh viện Nhi ĐồngTác giả liên lạc: ThS.BS Trần Anh TuấnChuyên Đề Nhi khoa** Đơn vị nghiên cứu lâm sàng Đại học OxfordĐT: 0903996869Email: drtat@hotmail.com109Nghiên cứu Y họcY Học TP. Hồ Chí Minh * Tập 18 * Phụ bản của Số 4 * 2014B: n=2). Among those negative within 72h after admission to the ward, 6.6% (25/377) acquired nosocomial RSVinfection during hospitalization (RSV A: n=22; and RSV B: n=3). Phylogenetic analysis of partial G genesequences obtained from 78.8% (316/341) positive specimens revealed the co-circulation of multiple genotypeswith NA1 being predominant (NA1: n=275; GA5: n=5; BA3: n=3; BA9: n=26; and BA10: n=7). GA5 and BA3are genotypes that have not been reported from Vietnam previously.Conclusions: Besides confirming the predominance of RSV as a respiratory pathogen among hospitalizedchildren, data from this study extend our knowledge on the genetic diversity of RSV circulating in Vietnam.Keywords: respiratory syncytial virus (RSV), Molecular characteristics, lower respiratory infections,nosocomial RSV infections.ĐẶT VẤN ĐỀRSV là tác nhân gây bệnh quan trọng củanhiễm khuẩn hô hấp cấp tính ở trẻ em các nướcđã và đang phát triển(6).Nhiễm RSV đưa đến nhiều biểu hiện lâmsàng khác nhau: viêm tiểu phế quản, viêm phổi,viêm thanh khí phế quản và viêm hô hấp trên.Trong đó, viêm tiểu phế quản là nguyên nhânnhập viện hàng đầu ở trẻ em(3).RSV còn được xem là nguyên nhân gâynhiễm khuẩn bệnh viện (NKBV) quan trọng ởcác nước đã phát triển. Hall CB và cộng sự (1977)nhận xét thấy rằng trong thời gian xảy ra dịchRSV, khoảng một phần ba số trẻ nhập viện vìbệnh lý không liên quan đến RSV lại bị nhiễmkhuẩn bệnh viện do RSV (NKBV–RSV)(3).TheoMadhi SA và c ...