Hướng dẫn cài đặt BIKA LIMS Inkosi trên Ubuntu Server

Trước tiên, cần tải và cài đặt Ubuntu Hardy Heron 8.04 từ Ubuntu repository Tại đây chúng ta dùng LIMSERVER là tên của máy tính, giá trị USERNAME và PASSWORD bất cứ lúc nào cần thiết. Lựa chọn openssh và LAMP server tại những giá trị yêu cầu. Thêm vào đó, hãy chắc chắn rằng LIMSERVER có thể truy cập qua giao thức WWW. và không bị chặn bởi tường lửa hay bất cứ ứng dụng nào khác.
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Hướng dẫn cài đặt BIKA LIMS Inkosi trên Ubuntu ServerHư ng d n cài ñ t BIKA LIMS Inkosi trênUbuntu ServerTrong bài vi t này, s gi i thi u v i các b n cách xây d ng gi i pháp BIKA LIMS ñ c l ptrên h th ng Ubuntu server.Trư c tiên, c n t i và cài ñ t Ubuntu Hardy Heron 8.04 t Ubuntu repository T i ñây chúng tadùng LIMSERVER là tên c a máy tính, giá tr USERNAME và PASSWORD b t c lúc nào c nthi t. L a ch n openssh và LAMP server t i nh ng giá tr yêu c u. Thêm vào ñó, hãy ch c ch nr ng LIMSERVER có th truy c p qua giao th c WWW. và không b ch n b i tư ng l a hay b tc ng d ng nào khác.Khi cài ñ t thành công Ubuntu, ñăng nh p vào h th ng và ki m tra ñ a ch IP và các v n ñ kháccó liên quan t i DHCP server t i LIMSERVER b ng l nh sau:ifconfigð a ch LIMSERVER local ip là giá tr s theo dãy ñ a ch ñ u tiên c a inet.Ví d inet addr:192.168.2.8 có nghĩa ñ a ch local ip là 192.168.2.8 (không ph i 127.0.0.1 vì ñólà ñ a ch loopback).Ghi nh l i nh ng thi t l p này và ti p t c làm vi c v i nh ng máy tính khác trông cùng hth ng. Ti n hành t i và cài ñ t ng d ng tty client trên h th ng ñ giao ti p v i LIMS server.Trong bài vi t này chúng ta s d ng putty.Ti p theo, m 1 ssh session (port 22) t i ñ a ch ip local c a LIMSSERVER và ñăng nh p. Kh it o nh ng thư m c phù h p và cài ñ t các gói ph n m m yêu c u:DOWNLOAD_DIR=~/tempBUILDS_DIR=~/builddirsMY_PRODUCTS_DIR=~/productsT o thư m c Plone:SOFTWARE_HOME=~/zope-2.9.9# Plone softwarePLONE_TARBALL_DIR=http://launchpad.net/plone/2.5/2.5.3/+downloadPLONE_TARBALL=Plone-2.5.3-final.tar.gzPLONE_VERSION=Plone-2.5.3-finalPLONE_WGET_ADDRESS=$PLONE_TARBALL_DIR/$PLONE_TARBALL# What do you want your Zope instance to be called?INSTANCE_HOME=$SOFTWARE_HOME/PloneT o thư m c bika:ROOT_LOGIN=adminROOT_PASSWORD=PASSWORDBIKA_TARBALL_DIR=http://downloads.sourceforge.net/project/bika/bika/2.2.1BIKA_TARBALL=bika-2_2_1_bundle.tar.gzBIKA_VERSION=bika-2_2_1_bundleBIKA_WGET_ADDRESS=$BIKA_TARBALL_DIR/$BIKA_TARBALLREPORTLAB_TARBALL_DIR=http://www.reportlab.com/ftp/REPORTLAB_TARBALL=ReportLab_2_4.tar.gzREPORTLAB_VERSION=ReportLab_2_4REPORTLAB_WGET_ADDRESS=$REPORTLAB_TARBALL_DIR/$REPORTLAB_TARBALLBIKAFONTS_ZIPFILE_DIR=http://bioinf.scri.ac.uk/lp/downloads/programs/genomediagram/BIKAFONTS_ZIPFILE=linfonts.zipBIKAFONTS_DIR=linfontsBIKAFONTS_WGET_ADDRESS=$BIKAFONTS_ZIPFILE_DIR/$BIKAFONTS_ZIPFILECài ñ t nh ng trình biên d ch c n thi t:sudo apt-get install gccsudo apt-get install g++T o thư m c ñ download:mkdir $BUILDS_DIR $DOWNLOAD_DIR $MY_PRODUCTS_DIRCài ñ t python:sudo apt-get install python2.4sudo apt-get install python2.4-devsudo apt-get install python2.4-elementtree“Cách ly” Zope kh i Internet và cài ñ t:sudo wget $ZOPE_WGET_ADDRESS -P $DOWNLOAD_DIRsudo tar -xzf $DOWNLOAD_DIR/$ZOPE_TARBALL -C $BUILDS_DIRcd $ZOPE_BUILDDIR./configure --prefix=$SOFTWARE_HOMECác b n có th xem cách s d ng cú pháp ./ như trên t i ñây.Biên d ch Zope:sudo apt-get install makemakemake installChu n b cho zope:$SOFTWARE_HOME/bin/mkzopeinstance.py -d $INSTANCE_HOME -u$ROOT_LOGIN:$ROOT_PASSWORDT i và cài ñ t Plone:sudo wget $PLONE_WGET_ADDRESS -P $DOWNLOAD_DIRsudo tar -xzf $DOWNLOAD_DIR/$PLONE_TARBALL -C $MY_PRODUCTS_DIRTi p theo, t o bi n plone ñ c l p:for i in $MY_PRODUCTS_DIR/$PLONE_VERSION/*;do echo $i; ln -s $i $INSTANCE_HOME/Products/;doneð i v i 1 s phiên b n plone không ñ y ñ , chúng ta c n cài ñ t thêm gói h tr plone:sudo apt-get install plone-siteT i th i ñi m này, các trang Plone ñã ñư c cài ñ t và ho t ñ ng mà không c n t i zope.Bư c ti p theo, t i, cài ñ t BIKA LIMS và reportlab:sudo wget $BIKA_WGET_ADDRESS -P $DOWNLOAD_DIRsudo tar -xzf $DOWNLOAD_DIR/$BIKA_TARBALL -C $MY_PRODUCTS_DIRsudo wget $REPORTLAB_WGET_ADDRESS -P $DOWNLOAD_DIRsudo tar -xzvf $DOWNLOAD_DIR/$REPORTLAB_TARBALL -C $MY_PRODUCTS_DIRB n nh chú ý phiên b n reportlab thích h p v i Hardy Heron và tương thích t t v i Ubuntu:sudo apt-get install python-reportlabChu n b thư m c ñ t i font BIKA và gi i nén chúng vào nơi phù h p:sudo mkdir $MY_PRODUCTS_DIR/$BIKAFONTS_DIRsudo wget $BIKAFONTS_WGET_ADDRESS -P $DOWNLOAD_DIRsudo cp $DOWNLOAD_DIR/$BIKAFONTS_ZIPFILE$MY_PRODUCTS_DIR/$BIKAFONTS_DIR/$BIKAFONTS_ZIPFILEsudo apt-get install unzipcd $MY_PRODUCTS_DIR/$BIKAFONTS_DIRsudo unzip -j $MY_PRODUCTS_DIR/$BIKAFONTS_DIR/$BIKAFONTS_ZIPFILEXác ñ nh thư m c cài ñ t report lab:REPORTLAB_INSTALL_LOCATION=`sudo find / -name reportlab -print | grep python2.4`T o thư m c ñ ch a font c a bika:INSTALLED_FONTS_DIR=$REPORTLAB_INSTALL_LOCATION/fontssudo mkdir $INSTALLED_FONTS_DIRsudo cp $MY_PRODUCTS_DIR/$BIKAFONTS_DIR/* $INSTALLED_FONTS_DIRTr t i ñư ng d n thư m c cài ñ t font bika và copy chúng vào ñây:$INSTALLED_FONTS_DIRNhư trong ví d này:usr/lib/python2.4/site-packages/reportlab/fontsBư c ti p theo là ñi u ch nh file c u hình c a reportlab ñ ch ñư ng d n t i b font bika:sudo n ...