Kỹ thuật định danh vi khuẩn

Phương pháp giải trình tự gen 16S rRNA: Nguyên tắc: gen 16S rRNA gồm khoảng 1542bp với nhiều trình tự bảo tồn. Trong đó có một đoạn trình tự #550bps đặc hiệu cho giống và loài của vi khuẩn; Giải trình tự đoạn đặc hiệu này giúp định danh xác định vi khuẩn.
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Kỹ thuật định danh vi khuẩn KYÕ THUAÄT ÑÒNH DANH VI KHUAÅN Phaïm Thaùi BìnhCaàu khuaån Gram (-) Tröïc khuaån Gram (-)Caàu khuaån Gram (+) Tröïc khuaån Gram (+) 1 PHÖÔNG PHAÙP SÖÛ DUÏNG THÖÛ NGHIEÄM SINH HOÙATRÖÏC KHUAÅN GRAM (-) Haemophillus HACEK(1) Tröïc khuaån Gram(-) Sphingomonas Moraxella (+) (-) Pasteurella Campylobacter Helicobacter Mac Conkey Agar Brucella BordetellaAcinetobacter(2) (-) (-) (+) Vibrio (+) BartonellaStenotrophomonas Aeromonas FrancisellaFlavimonas Oxidase Pleiosomonas LegionellaChryseomonas Glucose Glucose Chromobacterium (+) (-) PseudomonasEnterobacteriaceae: (+) Burkholderia(Citrobacter, Enterobacter,Escherichia, Klebsiella, Flavobacterium (1)HACEK: HaemophilusSerratia, Edwarsiella, aphrophilus, Actinobacillus actinomycetemcomitans,Proteus, Morganella, Alcaligenes Cardiobacterium hominis,Providencia, Salmonella, Eikenella corrodens,Shigella, Yersinia...) Achromobacter Kingella sp. (2)caàu tröïc khuaån Tröïc khuaån Gram (-) deã moïc Chryseobacterium Betty A. Forbes, et.al., 2002, Bailey & Scott’s, Diagnostic Microbiology, 7th edition, Mosby 2 Enterobacteriaceaeð Enterobacteriaceae bao goàm 120 loaøi khaùc nhau.ð Caùc hoï phuï chính: Escherichia, Enterobacter, Klebsiella, Citrobacter, Hafnia, Edwardsiella, Serratia, Shigella, Salmonella, Proteus, Providencia, Morganella, Yersinia.ð Ñeå ñònh danh ñeán loaøi coù theå thöïc hieän ñeán 40 phaûn öùng sinh hoùa. Patrick R. Murray, 1995, Manual of Clinical Microbiology, 6th edition, American Society for Microbiology. Nonfermentative Gram negative bacilli Sphigobacterium (-) (-) (+) (-) Acinetobacter Flavobacterium Oxidase Chryseobacterium Di ñoäng Di ñoäng (+) (+) Stenotrophomonas Pseudomonas Chryseomonas Burkholderia Flavimomas Alcaligenes Sphigomonas Comamonas Burkholderia cepacia Burkholderia gladioli 3 ...