Luận văn Thạc sĩ Sinh học thực nghiệm: Ứng dụng công nghệ giải trình tự thế mới Ion Torrent S5XLTM trong việc giám định hài cốt lâu năm

Đề tài nghiên cứu nhằm xây dựng quy trình chạy và bước đầu áp dụng phương pháp giải trình tự thế hệ mới (NGS) để giám định ADN hài cốt lâu năm; phân tích được dữ liệu vùng siêu biến ADN ty thể của các mẫu nghiên cứu từ các kết quả thu được thông qua hệ thống giải trình tự thế hệ mới (NGS). Mời các bạn cùng tham khảo.
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Luận văn Thạc sĩ Sinh học thực nghiệm: Ứng dụng công nghệ giải trình tự thế mới Ion Torrent S5XLTM trong việc giám định hài cốt lâu năm BỘ GIÁO DỤC VIỆN HÀN LÂM KHOA HỌC VÀ ĐÀO TẠO VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM HỌC VIỆN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ ----------------------------- Hoàng Thị ThúyỨNG DỤNG CÔNG NGHỆ GIẢI TRÌNH TỰ THẾ HỆ MỚI ION S5XLTM TRONG GIÁM ĐỊNH HÀI CỐT LÂU NĂM LUẬN VĂN THẠC SĨ: SINH HỌC THỰC NGHIỆM Hà Nội - tháng 10 năm 2020 BỘ GIÁO DỤC VIỆN HÀN LÂM KHOA HỌC VÀ ĐÀO TẠO VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM HỌC VIỆN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ ----------------------------- Hoàng Thị ThúyỨNG DỤNG CÔNG NGHỆ GIẢI TRÌNH TỰ THẾ HỆ MỚI ION S5XL TM TRONG GIÁM ĐỊNH HÀI CỐT LÂU NĂM Chuyên ngành: Sinh học thực nghiệm Mã số: 8420114 LUẬN VĂN THẠC SĨ: SINH HỌC THỰC NGHIỆM NGƢỜI HƢỚNG DẪN KHOA HỌC : PGS.TS Chu Hoàng Hà Hà Nội - tháng 10 năm 2020 LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan kết quả thể hiện trong bản luận văn này là công trìnhnghiên cứu thực tế. Toàn bộ số liệu, kết quả nghiên cứu trong luận văn là hoàn toàntrung thực, khách quan, chưa được công bố công khai bởi một ai khác. Học Viên Hoàng Thị Thúy LỜI CẢM ƠN Để có thể hoàn thành luận văn này, tôi xin bày tỏ lòng kính trọng, biếtơn sâu sắc tới PGS.TS. Chu Hoàng Hà – Viện trưởng Viện Công nghệ Sinhhọc, đã hướng dẫn, chỉ bảo tận tình trong suốt thời gian tôi thực hiện đề tài. Xin chân thành cảm ơn ThS. Hoàng Hà giám đốc Trung tâm Giám địnhADN, Viện Công nghệ Sinh học, Viện Hàn lâm Khoa học và Công nghệ ViệtNam đã luôn tạo điều kiện thuận lợi cho tôi trong suốt quá trình học tập vànghiên cứu.Tôi xin gửi lời cảm ơn sâu sắc tới TS. Trần Minh Đức và ThS. Lê Thị Dungcùng tập thể cán bộ trung tâm Giám định ADN, Viện Công nghệ Sinh học, đãnhiệt tình giúp đỡ, truyền đạt kinh nghiệm quý báu cho tôi trong suốt thờigian thực hiện luân văn. Tôi cũng xin gửi lời cảm ơn tới các thầy cô giáo và Ban đào tạo Họcviện Khoa học và Công nghệ đã hướng dẫn, truyền đạt kiến thức cho tôi trongsuốt thời gian học tập và nghiên cứu. Cuối cùng xin gửi lời cảm ơn đến bạn bè và gia đình đã giúp đỡ và chiasẻ, động viên trong suốt quá trình học tập cũng như thực hiện luận văn. Tôi xin chân thành cảm ơn! Hà Nội, ngày 08 tháng 10 năm 2020 Học Viên Hoàng Thị Thúy BẢNG KÍ HIỆU VÀ CHỮ VIẾT TẮTViết tắt Tên đầy đủ và ý nghĩabp Base pairCR Control regionD-loop Displacement DloopmtADN mitochondrial DNAHV Hypervariable regionPCR Polymerase chain reactionNGS Next-generation sequencingdNTP Deoxyribonucleotide triphosphatPGM Personal genome machineqPCR quantitative PCRSTR Short tandem repeat.SNP Single nucleotide polymorphismSDS Sodium dodecyl sulphateHA Hydroxyapatite MỤC LỤCLỜI CAM ĐOANLỜI CẢM ƠNBẢNG KÍ HIỆU VÀ CHỮ VIẾT TẮTDANH MỤC HÌNHDANH MỤC BẢNGĐẶT VẤN ĐỀ .................................................................................................. 1CHƢƠNG 1. TỔNG QUAN TÀI LIỆU ........................................................ 3 1.1 ĐẶC ĐIỂM GIẢI PHẪU VÀ MÔ HỌC XƢƠNG .............................. 3 1.1.1 Thành phần và cấu trúc của bộ xương ............................................... 3 1.1.2. Phân bố ADN trong xương ............................................................... 7 1.1.3. Các yếu tố ảnh hưởng đến cấu trúc và sự tồn tại của ADN hài cốt ........ 9 1.1.4. Cơ sở khoa học của phân tích ADN trong giám định nhận dạng cá thể .............................................................................................................. 11 1.2. PHÂN TÍCH ADN TY THỂ TRONG NHẬN DẠNG CÁ THỂ ...... 13 1.2.1 Cấu trúc hệ gen ty thể ...................................................................... 13 1.2.2 Vùng gen điều khiển CR (Control Region hay Displacement Dloop) . 14 1.2.3 Cơ sở khoa học đánh giá tính đa hình vùng D-loop ở người .......... 15 1.2.4 Đặc điểm trình tự ADN ty thể ứng dụng trong giám định .............. 17 1.2.4.1. Trình tự tham chiếu rCRS............................................................ 17 1.2.4.2. Sự biến đ i nucleotide ................................................................. 17 1.2.5 Ứng dụng phân tích ADN trong giám định nhận dạng cá th ...