Nghiên cứu đa dạng di truyền tập đoàn nhãn bản địa Việt Nam bằng kĩ thuật SSR (Microsatellite)

Nhãn là cây trồng quan trọng trong hệ thống nông nghiệp ở Việt Nam. Các thông tin trênmức độ đa dạng di truyền và nguồn gốc là rất quan trọng đối với nguồn gen bảo tồn,lựa chọn và phát triển các nhãn thương mại quan trọng. Trong nghiên cứu của chúng tôi, 10 SSRdấu hiệu có nguồn gốc từ vải-một quan hệ họ hàng gần gũi với nhãn-đã được sử dụng để đánh giá di truyềnsự đa dạng của các giống cây địa phương của nhãn. Gen D? A được chiết xuất từ ​​48 mẫu thuộcđến 22 giống địa phương...
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Nghiên cứu đa dạng di truyền tập đoàn nhãn bản địa Việt Nam bằng kĩ thuật SSR (Microsatellite) NGHIÊN C U ĐA D NG DI TRUY N T P ĐOÀN NHÃN B N Đ A VI T NAM B NG KĨ THU T SSR (MICROSATELLITE) Khu t H u Trung1, guy n Trư ng Khoa1, Tr n Minh Hoa1, gô H ng Bình2, Lê Th Tươi3, guy n Xuân Vi t3, ng Tr ng Lương1 SUMMARY Studying of genetics diversity of native longans in Vietnam utilizing SSR technique Longan is an important crop in agricultural systems in Vietnam. The information onlevel of genetic diversity and origin is very important for conservation gene resource,selection and development of commercially important longan. In our study, 10 SSRmarkers derived from lychee-a close kinship with longan- were used to evaluate geneticdiversity of local cultivars of longan. Genomic D A was extracted from 48 samples belongto 22 local cultivars for the PCR amplification of the SSR loci. The PCR products wereresolved on denaturing polycrylamide gel. A total of 27 alleles were detected with anaverage of 2.7 alleles per locus. Polymorphism information content (PIC) value rangesfrom 0.0 to 0.75, with an average of 0.24. Heterozygosity percentage ranges from 0% to30% data missing is 15%. Genetic similarity was determined using Jaccard’s similaritycoefficient and final dendrogram construction using a UPGMA clustering methods showedthat 48 samples were divided into 9 distinguished heterotic groups with genetic similarityfrom 0.22 to 1.0. All of the information has diversified application in longan study in thefuture. Keywords: Dimocarpus longan, native, genetic diversity, heterozygosity, SSR makers. ch n l c, nhân gi ng và b o t n m t cáchI. TV N t phát, các cá th có phNm ch t t t ư c Cây nhãn (Dimocapus longan Lour.) nhân lên, di th c và ư c t tên ch y uthu c h Sapindaceae là loài cây ăn qu d a vào m t s các c i m hình thái ho cnhi t i có giá tr kinh t cao. nư c ta, a i m phát sinh. Vì v y, ã gây ra snhãn ư c tr ng ph bi n và t p trung t i nh m l n và hi u sai v xu t x , ngu n g cm t s khu v c hình thành các vùng chuyên b n a và m i quan h di truy n gi a cáccanh v i nhi u gi ng nhãn n i ti ng như: gi ng. ây cũng chính là nguyên nhân làmNhãn l ng Hương Chi và nhãn ư ng Phèn thu h p a d ng di truy n và d n n tìnhc a Hưng Yên, nhãn cùi c a Lào Cai, nhãn tr ng xói mòn ngu n gen nhãn [2].tiêu Da Bò c a Bà R a-Vũng Tàu, nhãn Chi n lư c b o t n tài nguyên a d ngxu ng Cơm Vàng c a Ti n Giang... Các di truy n, nh n d ng chính xác các ngu ngi ng nhãn c a Vi t Nam ch y u ư c gen ph c v công tác lưu gi và ăng kí b n1 Vi n Di truy n N ông nghi p; 2 Vi n N ghiên c u Rau qu ; 3 i h c Sư ph m Hà N i.quy n nh ng cây tr ng b n a, c bi t là II. V T LI U VÀ PHƯƠN G PHÁPnh ng cây có giá tr kinh t cao là r t c n N GHIÊN C Uthi t. Tuy nhiên, Vi t N am các báo cáo v 1. V t li u nghiên c ucây nhãn m i ch t p trung ch y u vàonghiên c u các c tính nông h c và nghiên - V t li u s d ng bao g m 48 m uc u a d ng di truy n m c hình thái [3,4]. thu c 22 gi ng nhãn b n a c a Vi t NamTrong báo cáo này chúng tôi s d ng 12 m i ư c thu t i vư n t p oàn c a Vi n NghiênSSR ã ư c thi t k cho cây v i là m t cây c u Rau qu -Trâu Quỳ, Gia Lâm, Hà N i;ăn qu có quan h di truy n g n v i cây Vi n Cây ăn qu mi n Nam-Long nh,nhãn nghiên c u a d ng di truy n c a Ti n Giang; và t i các a phương angt p oàn nhãn b n a c a Vi t N am. tr ng ph bi n các gi ng nhãn này (b ng 1). B ng 1. Danh sách các gi ng nhãn nghiên c u TT Tên m u Ngu n g c Đ a đi m thu m u 1 Nhãn l ng (PH-S99-1.1) Hưng Yên Vi n Nghiên c u Rau qu 2 Nhãn l ng B14 Hưng Yên Vi n Nghiên c u Rau qu 3 Nhãn l ng (PH-M99-2.2) Hưng Yên Vi n Nghiên c u Rau qu 4 Nhãn cùi (YB-10) Yên Bái Vi n Nghiên c u Rau qu 5 Nhãn cùi (YB-28) Yên Bái Vi n Nghiên c u Rau qu 6 Nhãn cùi (LC-4) Lào Cai Vi n Nghiên c u Rau qu 7 Nhãn cùi (LC-9) Lào Cai Vi n Nghiên c u Ra ...