Phân lập và nhận diện một số dòng vi khuẩn khử đạm (Denitrifying bacteria) từ chất thải trại chăn nuôi

Bài viết nghiên cứu phân lập và nhận diện một số dòng vi khuẩn khử đạm (denitrifying bacteria) từ chất thải ở trại chăn nuôi bằng kỹ thuật PCR nhằm ứng dụng các dòng vi khuẩn này trong xử lý chất thải ở trại chăn nuôi. Để hiểu rõ hơn mời các bạn cùng tham khảo nội dung chi tiết của bài viết này.
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Phân lập và nhận diện một số dòng vi khuẩn khử đạm (Denitrifying bacteria) từ chất thải trại chăn nuôi Kỷ yếu Hội nghị khoa học PHÂN LẬP VÀ NHẬN DIỆN MỘT SỐ DÒNG VI KHUẨN KHỬ ĐẠM (DENITRIFYING BACTERIA) TỪ CHẤT THẢI TRẠI CHĂN NUÔI Nguyễn Thành Nhân* Trường Đại học Tiền Giang * Tác giả liên hệ: nguyenthanhnhan@tgu.edu.vn TÓM TẮT 30 dòng vi khuẩn khử đạm được phân lập từ chất thải trại chăn nuôi heo ở 2 huyện Châu Thành và Chợ Gạo, tỉnh Tiền Giang và xác định được 21 dòng vi khuẩn trong tổng số 30 dòng vi khuẩn bằng kỹ thuật PCR 16S-rDNA với cặp mồi tổng và xác định 17 dòng/21 dòng là vi khuẩn Pseudomonas stutzeri với cặp mồi đặc hiệu. Tiến hành giải trình tự 3 dòng vi khuẩn trong 17 dòng vi khuẩn và so sánh với ngân hàng dữ liệu bằng phần mềm BLASTN cho thấy cả 3 dòng vi khuẩn có mức độ đồng hình 99% với vi khuẩn Pseudomonas stutzeri chuẩn từ đó có thể phát triển thành chế phẩm sinh học xử lý môi trường. Từ khóa: Chất thải trại chăn nuôi heo, vi khuẩn khử đạm, PCR, giải trình tự, Pseudomonas stutzeri. DETERMINATION AND IDENTIFICATION OF A NUMBER OF (DENITRIFYING BACTERIA) FROM FARMING WASTE Nguyen Thanh Nhan* Tien Giang University *Corresponding Author: nguyenthanhnhan@tgu.edu.vn ABSTRACT Thirty denitrifying bacteria isolates were isolated from piggery farms wastes in Chau Thanh and Cho Gao district, Tien Giang province. Among 30 isolates, 21 isolates were identified with PCR 16S-rDNA technique with universal primers, and 17/21 isolates as Pseudomonas stutzeri with specific primers. 3/17 isolates were sequenced and compared with genebank data by BLAST N software, the result showed that three isolates have 99% homology with standard Pseudomonas stutzeri. Keywords: Piggery wastes, denitrifying bacteria, PCR, sequencing, Pseudomonas stutzeri. TỔNG QUAN năng khử đạm trong nước thải hoặc phân súc Tốc độ công nghiệp hóa và đô thị hóa khá vật, giúp giảm lượng nitrate, ammonium gây nhanh cùng với sự gia tăng dân số gây áp lực mùi hôi và làm ô nhiễm nguồn nước.Vì vậy ngày càng nặng nề đối với tài nguyên nước việc nghiên cứu phân lập và nhận diện một số trong vùng lãnh thổ. Môi trường nước ở nhiều dòng vi khuẩn khử đạm (denitrifying bacteria) đô thị, khu công nghiệp và làng nghề ngày từ chất thải ở trại chăn nuôi bằng kỹ thuật PCR càng bị ô nhiễm bởi nước thải, khí thải và chất nhằm ứng dụng các dòng vi khuẩn này trong thải rắn, các chỉ số BOD5, oxy hoà tan, các xử lý chất thải ở trại chăn nuôi. chất ammonium, nitrite, nitrate đang ở mức báo động. Trong đó sự ô nhiễm nitrate là một PHƯƠNG TIỆN VÀ PHƯƠNG PHÁP ưu tư rất lớn. Nitrate trong nguồn nước là một NGHIÊN CỨU nguy cơ ảnh hưởng đến sức khoẻ của con Phương tiện và mẫu nghiên cứu người và thú vật, nhất là trẻ con dưới sáu Cân điện tử, tủ cấy vi sinh vật, tủ ủ vi sinh vật, tháng, là mối nguy lớn cho ngành chăn nuôi tủ lạnh giữ mẫu, ống tube dùng để chạy PCR, thủy sản. đĩa petri, ống nghiệm, que cấy, que thủy tinh, Nhiều nghiên cứu cho thấy một số dòng vi bình tam giác, lam, lamen, bịch nylon và chai khuẩn tham gia trong chu trình nitơ (đặc biệt đựng mẫu bùn và mẫu nước... là những vi khuẩn có mang gen mã hóa Mẫu chất thải rắn và lỏng thu từ các trại chăn enzyme nitrite reductase- nirK & nirS và nuôi heo ở huyện Chợ Gạo và Châu Thành, enzyme nitrous oxide reductase-nosZ) có khả tỉnh Tiền Giang. 123 Kỷ yếu Hội nghị khoa học Phương pháp nghiên cứu hóa Ammonium của các dòng vi khuẩn Phân lập vi khuẩn Pseudomonas stutzeri Pseudomonas stutzeri. Nhận diện vi khuẩn Pseudomonas stutzeri Giải trình tự DNA của vi khuẩn Pseudomonas bằng phương pháp PCR. stutzeri. Kiểm tra khả năng khử Nitrate, Nitrite và oxid KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN Bảng 1. Đặc điểm hình thái của các dòng vi khuẩn phân lập STT Dòng Đặc điểm vi Đặc điểm khuẩn lạc vi khuẩn khuẩn Hình Chuyển Màu sắc Hình Dạng bìa Độ Kích dạng động dạng nổi thước (mm) 1 1RA Que ++ Trắng sữa Tròn Bìa nguyên Mô 0,6 ngắn 2 1RB Que ++ Trắng đục Tròn Bìa nguyên Mô 1 ngắn 3 1RC Que ++ Vàng nhạt Tròn Bìa nguyên Mô 0,2 ngắn 4 2RB Que ++ Vàng nhạt Tròn Bìa nguyên Mô 0,6 ngắn 5 2NA Que + Vàng Tròn Bìa nguyên Mô 0,6 ngắn 6 3NA Que ++ Trắng, tròn Tròn Bìa nguyên Mô 0,4 ngắn 7 3NC Que ++ Vàng nhạt Tròn Bìa nguyên Mô 0,4 ngắn 8 4RA Que ++ Trắng đục Tròn Bìa nguyên Mô 0,8 ngắn 9 4RB Que ++ Trắng đục Tròn Bìa nguyên Mô 0,6 ngắn 10 4RC Que ++ Trắng đục Tròn Bìa nguyên Mô 0,6 ngắn 11 5RA Que ++ Trắng đục Không Bìa răng Mô 1 ngắn đều ...