Phân loại vi khuẩn gây bệnh hại thực vật

Thông tin chung Phân loại vi khuẩn gây bệnh thực vật là một vấn đề rất phức tạp, còn chưa hoàn chỉnh và thống nhất. Từ cuối thế kỷ 19 đến nay, nhiều hệ thống phân loại vi khuẩn bệnh cây đã được xây dựng như hệ thống phân loại Migula, Smith, Bergey, Crassinicop, Dowson, Tesic, Gorlenco...
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Phân loại vi khuẩn gây bệnh hại thực vật Phân loại vi khuẩn gây bệnh hại thực vậtThông tin chungPhân loại vi khuẩn gây bệnh thực vật là một vấn đề rất phức tạp, còn chưa hoànchỉnh và thống nhất. Từ cuối thế kỷ 19 đến nay, nhiều hệ thống phân loại vi khuẩnbệnh cây đã được xây dựng như hệ thống phân loại Migula, Smith, Bergey,Crassinicop, Dowson, Tesic, Gorlenco...Người ta đã áp dụng tương đối rộng rãi bảng phân loại vi khuẩn Bergey. Nhưngtrong bảng phân loại vẫn thiếu một sự thống nhất trong nguyên tắc xếp loại. ChiCorynebacterium gồm các vi khuẩn thuộc nhóm Gram dương, không có lông roi(không chuyển động). Chi này cũng tương tự như chi Aplanobacter của bảng phânloại Smith. Chi Pseudomonas gồm các vi khuẩn hình gậy, chuyển động, hình thànhcác khuẩn lạc không màu. Chi Xanthomonas cũng gồm các vi khuẩn có hình dạngnhư trên nhưng hình thành các khuẩn lạc màu vàng. Chi Erwinia gồm các loài vikhuẩn không hình thành bào tử và có lông roi toàn thân. Chi Bacillus cũng gồmcác vi khuẩn như chi trên chỉ khác là có hình thành bào tử. Ngoài 5 chi trên đâycòn một chi đặc biệt gồm các vi khuẩn gây hiện tượng u sưng, có bướu trên cây làchi Agrobacterium. Việc tách riêng chi này dựa trên một nguyên tắc hoàn toànkhác (triệu chứng bệnh) và cơ sở không được thống nhất. Một số loài bắt nguồn từRhizobium, một số loài bắt nguồn từ loài vi khuẩn Pseudomonas fluorescens.Chi Erwinia theo sắp xếp của Bergey, là một chi không đồng nhất. Vì vậy năm1945 một tác giả khác đã chia chi này ra làm hai chi: Erwinia gồm các vi khuẩngây bệnh có lông roi toàn thân, không có enzyme pectinase và protopectinase. ChiPectobacterium cũng gồm các vi khuẩn hình gậy có lông roi toàn thân, nhưng cócác loại enzymee nói trên. Tóm lại, các cơ sở phân loại rất khác nhau tùy theo quanđiểm phân loại của các nhà nghiên cứu và hầu hết các chỉ tiêu phân loại chưa đượcnghiên cứu đầy đủ nên các bảng phân loại đó có vấn đề chưa thống nhất còn thiếucơ sở cụ thể trong việc phân loại một số loài (species).Song nhìn chung để phân loại vi khuẩn gây bệnh cây, người ta đã dựa vào nhiềuchỉ tiêu phân loại, chủ yếu dựa vào các đặc điểm hình thái, sinh trưởng (hình dạng,kích thước tế bào, đặc điểm khuẩn lạc, đặc điểm lông roi, tính chuyển động, khảnăng nhuộm Gram...), đồng thời dựa vào đặc tính sinh lý sinh hoá (quan hệ vớiôxy, nhiệt độ, sắc tố, thủy phân gelatin, tinh bột, khả năng phân giải protein tạothành indole, H2S, NH3, khả năng khử nitrate (NO3) thành nitrite (NO2) hoặc Ntự do, khả năng phân giải nguồn carbon, đặc biệt là các loại đường... và dựa vàotính gây bệnh, tính kháng nguyên, tính chuyên hóa ký chủ, đặc điểm triệu chứngbệnh... Gần đây còn dựa vào đặc điểm thành phần cấu trúc DNA của vi khuẩn,phân tích trên cơ sở sinh học phân tử để xác định, phân loại loài vi khuẩn.Trong những năm gần đây, phân loại vi khuẩn hiện đại nghiên cứu trên cơ sở sinhhọc phân tử phân tích cấu trúc DNA của loài. DNA của các cá thể, các isolate củacùng một loài đều có một mã di truyền tương tự nhau nghĩa là thành phầnnucleotide giống nhau, hàm lượng guanine và cytosine (GC) tương tự nhau. Nhữngnghiên cứu khẳng định hàm lượng GC của các loài trong chi Erwinia là 50-54%,Corynebacterium 54-55%, Pseudomonas 58-63%, Xanthomonas 64-69%.