Tài liệu: Các nhóm vi khuẩn chủ yếu

Các nhóm vi khuẩn chủ yếu Theo quan điểm hiện đại (NCBI- National Center for Biotechnology Information, 2005) thì vi khuẩn bao gồm các ngành sau đây :Aquificae -Thermotogae -Thermodesulfobacteria -Deinococcus-Thermus -Chrysiogenetes -Chloroflexi -Nitrospirae -Defferribacteres -Cyanobacteria -Proteobacteria -Firmicutes -Actinobacteria -Planctomycetes -Chlamydiae/Nhóm Verrucomicrobia -Spirochaetes -Fibrobacteres /Nhóm Acidobacteria -Bacteroidetes/Nhóm Chlorobia -Fusobacteria -Dictyoglomi...
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Tài liệu: Các nhóm vi khuẩn chủ yếu SÁCHCác nhóm vi khuẩn chủ yếuCác nhóm vi khuẩn chủ yếuTheo quan điểm hiện đại (NCBI- National Center for Biotechnology Information, 2005)thì vi khuẩn bao gồm các ngành sau đây : 1. -Aquificae 2. -Thermotogae 3. -Thermodesulfobacteria 4. -Deinococcus-Thermus 5. -Chrysiogenetes 6. -Chloroflexi 7. -Nitrospirae 8. -Defferribacteres 9. -Cyanobacteria 10. -Proteobacteria 11. -Firmicutes 12. -Actinobacteria 13. -Planctomycetes 14. -Chlamydiae/Nhóm Verrucomicrobia 15. -Spirochaetes 16. -Fibrobacteres /Nhóm Acidobacteria 17. -Bacteroidetes/Nhóm Chlorobia 18. -Fusobacteria 19. -DictyoglomiViệc phân ngành dựa trên các đặc điểm hình thái, sinh lý, sinh hóa, sinh thái... Căn cứ vào tỷ lệ G + C trong ADN người ta xây dựng được cây phát sinh chủngloại (Phylogenetic tree) và chia vi khuẩn thành 11 nhóm sau đây : 1. -Nhóm Oxy hoá Hydrogen 2. -Nhóm Chịu nhiệt 3. -Nhóm Vi khuẩn không lưu huỳnh màu lục 4. -Nhóm Deinococcus 5. -Nhóm Vi khuẩn lam 6. -Nhóm Proteobacteria 7. -Nhóm Chlamydia 8. -Nhóm Planctomyces 9. -Nhóm Spirochaetes (Xoắn thể) 10. -Nhóm Vi khuẩn lưu huỳnh màu lục 11. -Nhóm Cytophaga 12. --Nhóm Vi khuẩn Gram dương Sơ đồ về các loài điển hìnhĐể có khái niệm về các chi vi khuẩn thường gặp chúng ta làm quen với một số khoá phânloại đơn giản, dựa trên các đặc điểm về hình thái, sinh lý , sinh hoá. Trong thực tiễn vớicác loài vi khuẩn gây bệnh người ta thường chẩn đoán thêm bằng phản ứng huyết thanh(với các kháng thể đặc hiệu)1.Vi khuẩn quang hợp (Phototrophic bacteria) :1.1.Vi khuẩn lưu huỳnh màu tía (Purple sulfur bacteria):Thuộc nhóm này là các vi khuẩn kỵ khí bắt buộc, có khả năng quang tự dưỡng vô cơ(photolithoautotroph), tế bào có chứa chlorophyll a hoặc b , hệ thống quang hợp chứa cácmàng hình cầu hay hình phiến (lamellar) gắn với màng sinh chất. Để dùng làm nguồn chođiện tử (electron donors) trong quang hợp thường sử dụng H2, H2S hay S. Có khả năng diđộng với tiên mao mọc ở cực, có loài chu mao, tỷ lệ G+C là 45-70%.a- Họ Chromatiaceae: 1.1.1- Chi Thiospirium 1.1.2. Chi Chromatium 1.1.3. Chi Thiocapsa 1.1.4. Chi Thiocystis 1.1.5. Chi Thiospirillum 1.1.6. Chi Thiorhodovibrio 1.1.7. Chi Amoebobacter 1.1.8. Chi Lamprobacter 1.1.9. Chi Lamprocystis 1.1.10.Chi Thiodyction 1.1.11.Chi Thiopedia 1.1.12. Chi Rhabdochromatium 1.1.13. Chi ThiorhodococcusChromatium Thiocapsa Thiocystis Thiospirillum Lamprocystis Thiopediab- Họ Ectothiorhodospiraceae: 1.1.14- Chi Ectothiorhodospirace 1.1.15- Chi Halorhodospira1.2-Vi khuẩn không lưu huỳnh màu tía (Nonsulfure purple bacteria) Vi khuẩn không lưu huỳnh màu tía là nhóm vi khuẩn quang dị dưỡng hữu cơ(photoorganoheterotrophs) thường kỵ khí bắt buộc, một số loài là quang tự dưỡng vô cơkhông bắt buộc (trong tối là hoá dị dưỡng hữu cơ- chemoorganoheterotrophs). Tế bàochứa chlorophyl a hoặc b, hệ thống quang hợp chứa các màng hình cầu hay hình phiến(lamellar) gắn với màng sinh chất. Để dùng làm nguồn cho điện tử (electron donors)trong quang hợp thường sử dụng chất hữu cơ, đôi khi sử dụng hợp chất lưu huỳnh dạngkhử hoặc H2. Có khả năng di động với tiên mao mọc ở cực, hoặc không di động, một sốloài có túi khí (gas vesicles), tỷ lệ G+C là 61-72%. 1.2.1- Chi Blastochloris 1.2.2- Chi Phaeospirillum 1.2.3- Chi Rhodobacter 1.2.4- Chi Rhodobium 1.2.5- Chi Rhodocista1.2.6- Chi Rhodocyclus1.2.7- Chi Rhooferax1.2.8- Chi Rhodomicrobium1.2.9- Chi Rhodoplanes1.2.10-Chi Rhodopila1.2.11- Chi Rhodopseudomonas1.2.12- Chi Rhodospira1.2.13- Chi Rhodospirillum1.2.14- Chi Rhodothalassium1.2.15- Chi Rhodovibrio1.2.16-Chi Rhodovulum1.2.17- Chi Rosespira1.2.18- Chi Rubiviva Rhodospirillum Rhodospirillum dưới KHV điệntửRhodopseudomonas Rhodopseudomonas dưới KHV điện tử Rhodobacter Rhodopila Rhodocyclus purpureus Rhomicrobium1.3.Vi khuẩn lưu huỳnh màu lục (Green sulfure bacteria) Thuộc nhóm này là các vi khuẩn kỵ khí bắt buộc, có khả năng quang tự dưỡng vôcơ (photolithoautotroph), tế bào có chứa chlorophyll a cùng với b , c hoặc e, chứa carotennhóm 5, hệ thống quang hợp liên quan đến các lục thể (chlorosom) và độc lập đối vớimàng sinh chất. Để dùng làm nguồn cho điện tử (electron donors) trong quang hợpthường sử dụng H2, H2S hay S . Hạt lưu huỳnh tích luỹ bên ngoài tế bào Không có khảnăng di động , một số loài có túi khí; tỷ lệ G+C là 48-58%. 1.3.1- Chi Chlorobium 1.3.2- Chi Prosthecochloris 1.3.3- Chi Pelodictyon 1.3.4- Chi Ancalichliris 1.3.5- Chi Chloroherpeton Chlorobium Pelodictyon Prosthecochloris1.4.Vi khuẩn không lưu huỳnh màu lục (Green nonsulfur bacteria) Thuộc nhóm này là các vi khuẩn đa bào, dạng sợi,thường kỵ khí không bắt buộc,thường là quang dị dưỡng (photoheterotroph), có loài quang tự dưỡng hoặc hoá dịdưỡng. Tế bào có chứa chlorophyll a và c, trong điều kiện kỵ khí thấy có chlorosom. Đểdùng làm nguồn cho điện tử (electron donors) trong quang dị dưỡng là glucose, axitamin, axit hữu cơ; trong quang tự dưỡng là H2, H2S. Di động bằng phương thức trườn(gliding) , tỷ lệ G+C là 53-55%. Chi điển hình là Chloroflexus., Chloronema Chloronema Chloroflexus1.5- Vi khuẩn lam (Ngành Cyanobacteria) Trước đây thường nhầm lẫn ...