Xây dựng qui trình evagreen real‐time PCR phát hiện các gen blaoxa ở acinetobacter baumannii

Đề tài đặt vấn đề và đưa ra mục tiêu nghiên cứu sau: Acinetobacter baumannii là tác nhân gây nhiễm khuẩn bệnh viện nguy hiểm hàng đầu vì tính đa kháng thuốc của chúng. Đặc biệt, A. baumannii sở hữu gene blaOXA có khả năng tạo carbapenemase, giúpchúng kháng carbapenem. Xây dựng qui trình evagreen real‐time PCR phát hiện các gen blaoxa ở acinetobacter baumannii
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Xây dựng qui trình evagreen real‐time PCR phát hiện các gen blaoxa ở acinetobacter baumanniiYHọcTP.HồChíMinh*Tập18*Phụ bảncủaSố 5*2014NghiêncứuYhọcXÂYDỰNGQUITRÌNHEVAGREENREAL‐TIMEPCRPHÁTHIỆNCÁCGENblaOXAỞACINETOBACTERBAUMANNIINguyễnTuấnAnh*,HuỳnhMinhTuấn**,NguyễnVănVĩnhChâu***,HồHuỳnhThùyDương*,****TÓMTẮTĐặtvấnđề:Acinetobacterbaumanniilàtácnhângâynhiễmkhuẩnbệnhviệnnguyhiểmhàngđầuvìtínhđakhángthuốccủachúng.Đặcbiệt,A.baumanniisởhữugene blaOXAcókhảnăngtạocarbapenemase,giúpchúngkhángcarbapenem.Mụcđích:Nghiêncứunhằmxâydựngquitrìnhreal‐timePCRpháthiệncácgeneblaOXA‐23/‐51/‐58ởA.baumannii.Phương pháp:Quitrìnhđượcxâydựngtừkhâuthiếtkếvàkiểmtratínhđặchiệucủacácmồi,xácđịnhthànhphầnvàchươngtrìnhreal‐timePCRtốiưuchophảnứngnhânbảncácgeneblaOXA‐23/‐51/‐58.Kếtquả:KếtquảchothấyquitrìnhcókhảnăngpháthiệnchínhxáccácgeneblaOXA‐23/‐51/‐58đặctrưngcủaA.baumanniivớiđộnhạy(1,42x100‐1,42x101bảnsao/μl)vàđộđặchiệucao.Kếtluận:ChúngtôiđãxâydựngthànhcôngquitrìnhEvaGreenreal‐timePCRpháthiệncácnhómgeneOXA‐23/‐51/‐58ởA.baumannii.QuitrìnhcóthểđượcsửdụngđểpháthiệnnhanhcácchủngA.baumanniimangcácgenenàyvàtiềmnăngtrởthànhcôngcụnghiêncứudịchtễhọcphântửvềsựhiệndiệncácgeneblaOXAởA.baumanniitrongmôitrườngbệnhviện.blaTừkhóa:A.baumannii,β‐lactamase,carbapenemase,OXA,real‐timePCR,EvaGreenABSTRACTDEVELOPMENTOFANEVAGREENREAL‐TIMEPCRPROTOCOLFORTHEDETECTIONOFSEVERALblaOXAGENESINACINETOBACTERBAUMANNIINguyenTuanAnh,HuynhMinhTuan,NguyenVanVinhChau,HoHuynhThuyDuong*YHocTP.HoChiMinh*Vol.18‐SupplementofNo5‐2014:197‐201Backgrounds: Acinetobacter baumannii currently is the most leading and dangerous factor causingnosocomialinfectionsfortheirmultidrugresistanttraits.Aspecially,A.baumanniiharbours blaOXAgeneswithabilityofproducingcarbapenemase,helpingthemresisttocarbapenem,theso‐calledpresentstrongestantibiotic,commonlyusedinmultidrugresistantbacterialinfections.Objectives:TosetupandoptimizeanEvaGreenreal‐timePCRprotocolforthedetectionofblaOXA‐23,‐51,‐58genesinA.baumanniiMethods:Theprocesswasconstructedthroughbasicsteps:specificprimerdesignandexperimentalcheck,optimizationofreal‐timePCRcomponentsandtemperatureprogramusingtheintercalatingdye,EvaGreen,andfinallyevaluatingthespecificityandsensitivityofthesystem.Results: The results showed that the protocol could be used to detect correctly blaOXA‐23/‐51/‐58 genesspecifictoA.baumanniiwithhighspecificityandsensitivity.Conclusions:WebuiltupsuccessfullyanEvaGreenreal‐timePCRprotocolforthedetectionofblaOXA‐23/‐51/‐58 genes in A. baumannii. The protocol can also be used to identify rapidly strains of A. baumanniipossessing these genes and potentially becomes a tool to study blaOXA‐owning A. baumannii infection*CôngtyTNHHCNSHKhoaThương ***BệnhviệnBệnhNhiệtđớiTp.HCM.Tácgiảliênlạc:ThS.NguyễnTuấnAnh**KhoaKiểmsoátNhiễmkhuẩn,BVĐHYDượcTp.HCM****BộmônDitruyền,ĐạihọcKhoahọcTựnhiênTP.HồChíMinh,ĐT:0917429336,Email:ntanhbio@gmail.comChuyênĐềĐiềuDưỡngKỹThuậtYHọc197NghiêncứuYhọcYHọcTP.Hồ ChíMinh*Tập18*PhụbảncủaSố 5*2014epidemiologyindifferenthospitalsorgeographicalareas.Keywords:A.baumannii,β‐lactamase,carbapenemase,OXA,real‐timePCR,EvaGreenmột số enzyme trong nhóm này có hoạt tínhĐẶTVẤNĐỀthủy phân carbapenem(10). Các enzyme OXA cóAcinetobacterbaumannii(A.baumannii),trựckhả năng thủy phân carbapenem được chiakhuẩn Gram (‐) không lên men glucose, đangthành8nhómphụ,trongđócó4nhómđãđượctrở thành tác nhân nhiễm trùng bệnh việnphát hiện ở A. baumaniii là OXA‐23(9), OXA‐nguy hiểm nhất, đặc biệt ở những bệnh viện24(2),OXA‐51(11),OXA‐58(13).đôngbệnhnhân(2,1).VìsựxuấthiệnvàgiatăngDịch tễ phân tử cho thấy các nhóm gennhững chủng A. baumannii đa kháng thuốc,blaOXAhiệndiệntrênkhắpthếgiới(7).ChủngA.carbapenem được lựa chọn để điều trị khibaumanniimangnhómgene blaOXA‐23phổbiếnnhiễm những chủng này. Carbapenem, điểnở United Kingdom, Brazil, Argentina, China,hìnhlàimipenemvàmeropenem,cóphổhoạtKorea, Singapore, Vietnam, USA, Libya,tínhrấtrộng,khánglạivisinhvậtGram(+)vàPakistan, Australia và Columbia(7,15). Các chủngGram (‐), bao gồm cả vi khuẩn yếm khí. ĐặcA. baumannii với nhóm gene blaOXA‐58 đượcbiệt,carbapenemlàlựachọnđểđiềutrịnhữngphát hiện đầu ...