ÁP DỤNG KỸ THUẬT PCR ĐỂ XÁC ĐỊNH MỘT SỐ GEN ĐỘC LỰC CỦA E.COLI GÂY NHIỄM TRÙNG BỆNH VIÊN

Nhiễm trùng bệnh viện (NTBV) lμ bệnhnhiễm trùng mắc thêm sau khi vμo viện 48giờhoặc mắc phải bệnh nhiễm trùng do khám,chữa, chăm sóc bệnh nhân đang nằm viện, kháchoμn toμn với bệnh nhiễm trùng cộng đồng.Nguyên nhân gây NTBV do nhiều loμi visinh vật khác nhau, trong đó có một số loμi vikhuẩn th−ờng gặp nh− họ cầu khuẩn (chiếm tỷ lệcao nhất lμ Staphylococcus aureus), Pseudomonasaeruginosa vμ họ vi khuẩn đ−ờng ruột (đặc biệt lμEscherichia coli chiếm tỷ lệ đáng kể).E. coli bình th−ờng lμ vi khuẩn sống cộngsinh ở đại trμng của ng−ời vμ động vật chỉ...
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
ÁP DỤNG KỸ THUẬT PCR ĐỂ XÁC ĐỊNH MỘT SỐ GEN ĐỘC LỰC CỦA E.COLI GÂY NHIỄM TRÙNG BỆNH VIÊNTCNCYH phô b¶n 32 (6) - 2004 ¸p dông kü thuËt PCR ®Ó x¸c ®Þnh mét sè gen ®éc lùc cña E. coli g©y nhiÔm trïng bÖnh viÖn Bïi Kh¾c HËu, Lª V¨n Phñng, NguyÔn Vò Trung Nghiªn cøu 310 chñng E. coli ph©n lËp tõ 1348 bÖnh phÈm nhiÔm trïng bÖnh viÖn, thu kÕt qu¶ nh−sau: Kh«ng thÊy chñng nµo mang gen tiªu ch¶y; E. coli mang gen afa chiÕm tû lÖ 53,5%;mang gen papchiÕm tû lÖ 9,1% vµ mang gen sfa chiÕm tû lÖ 5,6%.E. coli ë dÞch mËt mang gen afa lµ 65,5%, ë mñ lµ54,7% vµ ë n−íc tiÓu lµ 42,4%.E. coli ë n−íc tiÓu mang gen pap lµ 20,4%, dÞch mËt lµ 6,3% vµ ë mñ lµ6,0%. E. coli ë mñ mang gen sfa lµ 11,1%, ë n−íc tiÓu lµ 3,9% vµ ë dÞch mËt lµ 3,3%. Cã 1 chñngmang gen afa, pap vµ sfa; cã 2 chñng mang gen sfa vµ pap; cã 1 chñng mang gen sfa vµ afa g©y ra. §©y lµ mét gi¶ thuyÕt. Gi¶ thuyÕt nµy i. §Æt VÊn ®Ò nªu lªn nÕu ph¸t hiÖn mét chñng E. coli cã mÆt NhiÔm trïng bÖnh viÖn (NTBV) lµ bÖnh mét hoÆc nhiÒu gen ®éc lùc cã thÓ kh¼ng ®ÞnhnhiÔm trïng m¾c thªm sau khi vµo viÖn 48giê ®ã lµ chñng g©y bÖnh thùc sù. Gi¶ thiÕt nµyhoÆc m¾c ph¶i bÖnh nhiÔm trïng do kh¸m, dùa vµo nh÷ng kÕt luËn ®−îc rót ra tõ mét sèch÷a, ch¨m sãc bÖnh nh©n ®ang n»m viÖn, kh¸c nghiªn cøu gen ®éc lùc cña E. coli dùa trªnhoµn toµn víi bÖnh nhiÔm trïng céng ®ång. nguyªn lý sinh häc ph©n tö. Nguyªn nh©n g©y NTBV do nhiÒu loµi vi ë ViÖt Nam nghiªn cøu vÒ gen ®éc lùc cñasinh vËt kh¸c nhau, trong ®ã cã mét sè loµi vi E. coli cßn ®−îc Ýt ®Ò cËp ®Õn, ®Ó hiÓu râ h¬nkhuÈn th−êng gÆp nh− hä cÇu khuÈn (chiÕm tû lÖ vÒ sù cã mÆt c¸c gen tiªu ch¶y, pap, afa vµ sfacao nhÊt lµ Staphylococcus aureus), Pseudomonas cña E. coli trong c¸c nhiÔm trïng bÖnh viÖn,aeruginosa vµ hä vi khuÈn ®−êng ruét (®Æc biÖt lµEscherichia coli chiÕm tû lÖ ®¸ng kÓ). chóng t«i tiÕn hµnh nghiªn cøu ®Ò tµi ¸p dông kü thuËt PCR ®Ó x¸c ®Þnh mét sè gen ®éc lùc E. coli b×nh th−êng lµ vi khuÈn sèng céng cña E. coli g©y nhiÔm trïng bÖnh viÖn” nh»msinh ë ®¹i trµng cña ng−êi vµ ®éng vËt chØ g©y 2 môc tiªu:bÖnh khi cã ®iÒu kiÖn thuËn lîi. Khi ng−êi m¾c 1. X¸c ®Þnh tû lÖ nhiÔm E. coli trong mét sèmét bÖnh nµo ®ã ph¶i nhËp viÖn ®Ó ®iÒu trÞ nhÊtlµ bÖnh ph¶i can thiÖp b»ng phÉu thuËt hoÆc c¸c bÖnh phÈm nhiÔm trïng bÖnh viÖnthñ thuËt ngo¹i khoa hoÆc ë ng−êi suy gi¶m 2. X¸c ®Þnh mét sè gen qui ®Þnh c¸c yÕu tèmiÔn dÞch do søc ®Ò kh¸ng bÞ suy gi¶m sÏ lµm ®éc lùc cña E. coli nh− gen tiªu ch¶y, afa, sfaph¸t sinh c¬ héi cho E. coli g©y bÖnh nhiÔm vµ pap b»ng kü thuËt PCRtrïng. Mét sè c¬ quan th−êng m¾c bÖnh nhiÔm ii. ®èi t−îng, vËt liÖu vµ ph−¬ngtrïng bÖnh viÖn lµ nhiÔm trïng vÕt mæ, nhiÔmtrïng ®−êng tiÕt niÖu, hÖ dÉn mËt, ®−êng h« ph¸p Nghiªn cøuhÊp, vµ mét sè g©y nhiÔm trïng huyÕt. 1. §èi t−îng Nghiªn cøu gen ®éc lùc cña E. coli trong - C¸c lo¹i bÖnh phÈm lÊy ë bÖnh nh©n ®−îc x¸cNTBV ®· ®−îc mét sè t¸c gi¶ trong vµ ngoµi ®Þnh lµ NTBV nh− dÞch vÕt mæ, vÕt th−¬ng tai n¹n;n−íc nghiªn cøu tõ n¨m 1990 do mét sè t¸c gi¶ c¸c dÞch dÉn l−u sau khi mæ; m¸u cña bÖnh nh©nnh− Bouguenic, Laurence (Ph¸p). C¸c t¸c gi¶ ®· nghi nhiÔm trïng huyÕt; n−íc tiÓu dÉn l−u sau mænghiªn cøu mét sè gen ®éc lùc cña E. coli nh− tiÕt niÖu; dÞch mËt dÉn l−u sau khi mæ gan - mËt;pap, afa, sfa vµ cho thÊy c¸c gen nµy liªn quan mñ ¸p xe; mñ, dÞch vÕt bángmËt thiÕt víi c¸c bÖnh c¶nh l©m sµng do chóng 87TCNCYH phô b¶n 32 (6) - 2004 - §Þa ®iÓm nghiªn cøu. cña ViÖn Karolinska - Stockholm - Thuþ §iÓn). §Þa ®iÓm thu thËp chñng: BÖnh viÖn ViÖt - §øc, - KiÓm tra c¸c chñng tr−íc khi lµm PCRHµ Néi; BÖnh viÖn Qu©n Y 103; BÖnh viÖn Qu©n Y 108 - TiÕn hµnh t¸ch chiÕt ADN (theo qui tr×nh cña TiÕn hµnh ph©n lËp, x¸c ®Þnh vi khuÈn vµ lµm viÖn Karolinska Thuþ §iÓn).kh¸ng sinh ®å t¹i c¸c khoa vi si ...