Một số thay đổi trong cấu trúc di truyền của virut sởi lưu hành ở miền Bắc Việt Nam trong giai đoạn 2006-2013

Mục tiêu nghiên cứu của bài viết nhằm tìm hiểu một số đặc điểm di truyền của virut sởi hiện đang lưu hành ở một số tỉnh miền Bắc Việt Nam giai đoạn 2006 - 2013. Mời các bạn cùng tham khảo nội dung chi tiết của tài liệu.
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Một số thay đổi trong cấu trúc di truyền của virut sởi lưu hành ở miền Bắc Việt Nam trong giai đoạn 2006-2013TẠP CHÍ Y - DƯỢC HỌC QUÂN SỰ SỐ 6-2014MỘT SỐ THAY ĐỔI TRONG CẤU TRÚC DI TRUYỀN CỦA VIRUT SỞILƢU HÀNH Ở MIỀN BẮC VIỆT NAM GIAI ĐOẠN 2006 - 2013Nguyễn Thái Sơn*; Nguyễn Thị Hồng Ngọc**Mai Thị Huyền Sâm***; Diêm Đăng Thanh****TÓM TẮTTrong những năm gần đây, mặc dù vắc xin sởi đã được đưa vào chương trình tiêm chủngmở rộng, bệnh sởi vẫn bùng phát và diễn biến phức tạp ở một số địa phương. Ngoài lý do tiêmchủng không đầy đủ, việc tìm hiểu những thay đổi trong cấu trúc di truyền ở các chủng virut sởiđang lưu hành là cần thiết. Phân tích gen N đặc hiệu ở các chủng virut sởi phân lập được tạimột số tỉnh miền Bắc Việt Nam trong giai đoạn 2006 - 2013 cho thấy các chủng virut sởi lưuhành tại Việt Nam có sự biến đổi về trình tự nucleotid, cũng như khác biệt về genotýp qua cácgiai đoạn và khu vực địa lý khác nhau.* Từ khóa: Virut sởi; Genotýp; Nucleotid.THE CHANGES OF GENETIC STRUCTURES GENOTYPE OFMEASLES VIRUS IN NORTHERN OF VIETNAMSUMMARYIn recent years, there has been routine measles vaccination for children, but measles stillbreaks out and develops complicatedly in some regions. Apart from reasons not fully immunized,the detection of changes in the genetic structure of measles virus strains in circulation is necessary.Analysis of N-specific genes in strains of measles virus isolated in some provinces in northernVietnam during the period 2006 - 2013 showed that measles virus strains circulating in Vietnamhave variations in nucleotide sequence, as well as there are differences in the genotype throughthe stages and different geographical areas.* Key words: Measles virus; Genotype; Nucleotide.ĐẶT VẤN ĐỀSởi là một bệnh nhiễm trùng đường hôhấp do virut sởi gây ra, thường gặp ở trẻem. Theo thống kê của Tổ chức Y tế Thếgiới (WHO), tình trạng tử vong do bệnhsởi đã giảm 78% và vắc xin đã cứu sống4,3 triệu người trong thập kỷ qua. Tuy nhiên,số liệu công bố của WHO cho thấy trungbình 330 người chết mỗi ngày, 14 trẻ chếtmỗi giờ vì căn bệnh này hiện vẫn là quálớn đối với một bệnh hoàn toàn có thểphòng ngừa được [8].* Bệnh viện Quân y 103** Trường Cao đẳng Y tế Hà Nội*** Bệnh viện Quân y 110Người phản hồi (Corresponding): Nguyễn Thái Sơn (nts65@yahoo.com)Ngày nhận bài: 03/06/2014; Ngày phản biện đánh giá bài báo: 22/07/2014Ngày bài báo được đăng: 28/07/201466TẠP CHÍ Y - DƯỢC HỌC QUÂN SỰ SỐ 6-2014Tại Việt Nam, trong những năm gầnđây, dịch bệnh sởi lại bùng phát với diễnbiến phức tạp, bệnh gặp cả ở người lớn(18 - 40 tuổi) và trẻ em < 6 tháng tuổi,riêng từ cuối năm 2013 đến hết quý I/2014đã ghi nhận trên 5.000 trường hợp nghibệnh sởi [1]. Ngoài việc tiêm phòng vắcxin,việc tìm hiểu đặc điểm di truyền của cácchủng virut sởi đang lưu hành cũng cầnthiết [9]. Vì vậy, đề tài này được tiến hànhvới mục tiêu: Tìm hiểu một số đặc điểm ditruyền của virut sởi hiện đang lưu hành ởmột số tỉnh miền Bắc Việt Nam giai đoạn2006 - 2013.ĐỐI TƢỢNG VÀ PHƢƠNG PHÁPNGHIÊN CỨU1. Đối tượng nghiên cứu.- 46 chủng virut sởi thu được các vụdịch sởi từ 2006 - 2013 tại một số tỉnhmiền Bắc Việt Nam đang lưu giữ tại KhoaVirut, Viện Vệ sinh Dịch tễ TW được sửdụng để nghiên cứu đặc điểm phân tử.- Các chủng virut sởi phân lập từ 3 loạivắc xin sống giảm độc lực gồm: 6675/RouvaxAventis Pasteur (Pháp); AIK-C Vero vàMMR (Mỹ) được dùng như chủng chuẩntrong nghiên cứu virut sởi. Ngoài ra,nghiên cứu này còn dùng chủng virut sởiH1 là MVi/Hanam.VNM/6.09/9 (Genbank:JF824649) làm chủng đối chứng để sosánh và phân tích với các chủng phân lập(hoang dại) trong nghiên cứu.2. Phương pháp nghiên cứu.ARN của các chủng virut sau khi táchchiết được khuếch đại đoạn gen N đặchiệu tạo sản phẩm ADN có kích thước660 bp bằng phản ứng RT-PCR, sảnphẩm này sau đó được giải trình tự gentrên máy giải trình tự ABI avant 3100, xửlý kết quả bằng phần mềm BioEdit vàMEGA 4.0 [4, 5]. Phân tích, xác định67genotýp trình tự virut sởi để lập cây phátsinh chủng loại và tìm hiểu tỷ lệ sai khácso với chủng đối chứng H1 (Genbank:JF824649).TẠP CHÍ Y - DƯỢC HỌC QUÂN SỰ SỐ 6-2014KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU1. Kết quả phân tích trình tự gen N của virut sởi.Hình 1: Kết quả giải trình tự một số chủng virut sởi trong nghiên cứu.Xử lý và phân tích trình tự gen N của các chủng virut sởi trong nghiên cứu bằng phầnmềm BioEdit và MEGA 4.0 cho kết quả cây phát sinh chủng loại như sau:68TẠP CHÍ Y - DƯỢC HỌC QUÂN SỰ SỐ 6-2014MVi/BG.VN/58.09MVi/HN.VN/29.08MVi/NB.VN/4A.08MVi/NB.VN/8/09MVi/HN.VN/25.09MVi/BG.VN/17.09MVi/HN.VN/17.08MVi/HN.VN/25.08MVi/HN.VN/46.09MVi.HD.VN/13/0910MVi/BG.VN/43.09MVi/HN.VN/47.09MVi/NB.VN/3B.08JF824649.H1MVi/HB.VN/69.0910MVi/HD.VN/8.08MVi/NB.VN/3.08MVi/HN.VN/24.09MVi/HN.VN/50.0910MVi/HN.VN/52.09MVi/HN.VN/28.08MVi/Nghean.VN/106.0986410MVi/TH.VN/18.08MVi/TH.VN/19.08MVi/TH.VN/21.08MVi/HN.VN/16.082132MVi/HN.VN/15. ...