SỬ DỤNG KỸ THUẬT RAPD KHẢO SÁT SỰ ĐA DẠNG DI TRUYỀN CỦA QUẦN THỂ NẤM Rhizotonia solani GÂY BỆNH KHÔ VẲN LÚA

Rhizoctonia solani Kühn là loài nấm quan trọng nhất của nấm Rhizoctonia và cũng là nguyên nhân gây ra bệnh khô vằn lúa. Hiện nay, nấm R. solani đang gây bệnh khô vằn lúa trên khắp lãnh thổ Việt Nam gây ra nhiều thiệt hại nghiêm trọng. Nấm R. solani không chỉ gây bệnh trên cây lúa mà còn gây nhiều bệnh trên các cây trồng khác như đậu xanh, đậu nành, mía, khoai tây, lúa miến và trên một số loài cây ăn quả. Không những thế, R. solani còn kí sinh được trên cả các loài cỏ như...
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
SỬ DỤNG KỸ THUẬT RAPD KHẢO SÁT SỰ ĐA DẠNG DI TRUYỀN CỦA QUẦN THỂ NẤM Rhizotonia solani GÂY BỆNH KHÔ VẲN LÚA BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƢỜNG ĐẠI HỌC NÔNG LÂM TP. HỒ CHÍ MINH BỘ MÔN CÔNG NGHỆ SINH HỌC ***000*** KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP SỬ DỤNG KỸ THUẬT RAPD KHẢO SÁT SỰ ĐA DẠNG DITRUYỀN CỦA QUẦN THỂ NẤM Rhizotonia solani GÂY BỆNH KHÔ VẲN LÚA Nghành học: CÔNG NGHỆ SINH HỌC Niên khóa: 2003-2007 Sinh viên thực hiện: NGUYỄN THỊ MINH THƢ Thành phố Hồ Chí Minh -2007- BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƢỜNG ĐẠI HỌC NÔNG LÂM TP. HỒ CHÍ MINH BỘ MÔN CÔNG NGHỆ SINH HỌC ***000*** KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP SỬ DỤNG KỸ THUẬT RAPD KHẢO SÁT SỰ ĐA DẠNG DI TRUYỀN CỦA QUẦN THỂ NẤM Rhizoctonia solani GÂY BỆNH KHÔ VẰN LÚAGVHD: Sinh viên thực hiện:ThS.TỪ THỊ MỸ THUẬN NGUYỄN THỊ MINH THƢ Thành phố Hồ Chí Minh 8 - 2007 LỜI CẢM TẠ Con xin thành kính ghi ơn Cha Mẹ đã sinh thành, dưỡng dục con nênngười. Con xin cảm ơn gia đình đã luôn là chỗ dựa vững chắc cho con bướcqua những khó khăn. Tôi xin chân thành cảm ơn: Ban Giám Hiệu trường Đại Học Nông Lâm Tp. Hồ Chí Minh, Ban Chủ Nhiệm Bộ Môn Công Nghệ Sinh Học, cùng tất cả quý Thầy - Cô đã truyền đạt những kiến thức quý báu cho tôi trong suốt thời gian học tại trường. ThS. Từ Thị Mỹ Thuận đã tận tình hướng dẫn, giúp đỡ tôi hoàn thành khóa luận. Các anh chị trực thuộc Trung Tâm Phân Tích – Thí Nghiệm Hóa Sinh Trường Đại Học Nông Lâm Thành Phố Hồ Chí Minh đã hướng dẫn và chia sẻ cùng tôi những khó khăn trong thời gian thực hiện khóa luận. Các bạn bè thân yêu lớp Công Nghệ Sinh Học 29 đã giúp đỡ và chia sẻ cùng tôi những vui buồn trong suốt những năm học cũng như thời gian thực tập tốt nghiệp. Thành Phố Hồ Chí Minh, ngày 15 tháng 8 năm 2007. Nguyễn Thị Minh Thư iii TÓM TẮT Nguyễn Thị Minh Thư, Đại học Nông Lâm Tp. Hồ Chí Minh. Tháng8/2007. “Sử dụng kỹ thuật RAPD khảo sát sự đa dạng di truyền của quần thể nấmRhizoctonia solani gây bệnh khô vằn lúa”. Bệnh khô vằn lúa gây ra bởi nấm R. solani được xem là bệnh gây ra nhiềuthiệt hại rất nghiêm trọng trên lúa. Sự đa dạng di truyền cùng với phổ kí chủ rộngcủa nấm gây khó khăn cho việc lựa chọn các dòng kháng cũng như việc xây dựngcác biện pháp phòng và trị nấm một cách hiệu quả và an toàn cho môi trường.Khảo sát sự đa dạng di truyền của nấm là một bước cần thiết nhằm hiểu rõ hơn vềdi truyền của quần thể nấm và cung cấp thêm thông tin cho việc xây dựng phươngpháp phòng và trị nấm. 17 dòng phân lập nấm R. solani thu thập từ nhiều tỉnh khác nhau được litrích DNA và thực hiện phản ứng RAPD với 3 primer OPL-05, OPL-08, OPM-13.Phân tích dữ liệu phản ứng RAPD bằng phần mềm NTYSYSpc đã chia 17 dòngnấm thành 2 dòng lớn. Sơ đồ phân nhóm có tỷ lệ tương đồng di truyền khoảng 53– 89 % và cho thấy sự đa dạng di truyền của 17 dòng phân lập nấm R. solani.Thông tin của nghiên cứu này có thể dùng để tăng thêm sự hiểu biết về di truyềncủa các dòng nấm R. solani và làm cơ sở để xây dựng phương pháp phòng và trịnấm một cách hiệu quả và an toàn cho môi trường. iv SUMMARYNguyen Thi Minh Thu, Nong Lam university, Ho Chi Minh city, 8/2007. “UseRAPD analysis study genetic diversity of Rhizoctonia solani populationpathogenic sheath blight in rice”. Sheath blight caused by R. solani is an important disease on rice. This diseaseis cause of serious damage in rice crop. Chosing assistant plant culture andbuilding strategy against this fungi is very difficult because of genetic diversity ofR. solani isolates. So, study genetic diversity is the fisrt step to know about thisfungi. Therefore, 17 R. solani isolates were recognized from several diffirentprovinces were extracted total DNA and realize RAPD reaction with three primerOPL-05, OPL-08, OPM-13. Analysis RAPD data by NTSYSpc software wasdivided 17 isolates place into two group. Rate genetic similarity of these analysisisolate was a range from 53 to 89% . Information of study could enhanceknowledge about genetic of R. solani isolates and to basis to build a methodagainst fungi effect and safe for environment. v MỤC LỤCCHƢƠNG TRANGTrang bìaTrang tựaLời cảm tạ ............................. ...