Tần suất một số gen độc lực đường ruột và tính kháng colistin của các chủng Escherichia Coli sinh β-lactamase phổ rộng (ESBL) phân lập từ thực phẩm, người khỏe mạnh và bệnh nhân tiêu chảy tại tp. Hồ Chí Minh

Khảo sát tần suất một số gen độc lực đường ruột và khả năng đề kháng colistin của 210 chủng E. coli sinh ESBL đã phân lập từ thực phẩm, người khỏe mạnh và bệnh nhân tiêu chảy tại thành phố Hồ Chí Minh.
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Tần suất một số gen độc lực đường ruột và tính kháng colistin của các chủng Escherichia Coli sinh β-lactamase phổ rộng (ESBL) phân lập từ thực phẩm, người khỏe mạnh và bệnh nhân tiêu chảy tại tp. Hồ Chí MinhNghiên cứu Y học Y Học TP. Hồ Chí Minh * Phụ Bản Tập 23 * Số 5 * 2019 TẦN SUẤT MỘT SỐ GEN ĐỘC LỰC ĐƯỜNG RUỘT VÀ TÍNH KHÁNG COLISTIN CỦA CÁC CHỦNG ESCHERICHIA COLI SINH -LACTAMASE PHỔ RỘNG (ESBL) PHÂN LẬP TỪ THỰC PHẨM,NGƯỜI KHỎE MẠNH VÀ BỆNH NHÂN TIÊU CHẢY TẠI TP. HỒ CHÍ MINHHoàng Hoài Phương*, Lê Thị Hiên*, Trần Nguyễn Minh Đoan*, Nguyễn Thị Anh Đào*, Nguyễn Đỗ Phúc*TÓM TẮT Đặt vấn đề: Một số nhóm Escherichia coli (E. coli) có khả năng gây bệnh trong và ngoài đường ruột dochúng mang các gen độc lực khác nhau. Hiện nay, E. coli có thể đề kháng với nhiều loại kháng sinh - đặc biệt làcephalosporin thế hệ thứ ba và colistin dẫn đến nguy cơ thất bại trong điều trị và làm tăng tỷ lệ tử vong. Mục tiêu: Khảo sát tần suất một số gen độc lực đường ruột và khả năng đề kháng colistin của 210 chủng E.coli sinh ESBL đã phân lập từ thực phẩm, người khỏe mạnh và bệnh nhân tiêu chảy tại thành phố Hồ Chí Minh. Phương pháp nghiên cứu: Xác định kiểu gen ESBL, khảo sát sự hiện diện của một số gen độc lực đườngruột và phân nhóm phát sinh loài của các chủng E. coli sinh ESBL bằng phương pháp PCR. Xác định giá trị MICđối với colistin của các chủng E. coli sinh ESBL và kiểm tra sự hiện diện của gen mcr-1. Kết quả: Kiểu gen ESBL chiếm ưu thế thuộc nhóm CTX-M (82,9%) – chủ yếu là blaCTX-M-1 (52,9%), blaCTX-M-9 (30,5%). Tỷ lệ chủng E. coli sinh ESBL mang gen độc lực đường ruột khá thấp: 7 chủng (3,4%) mang gendaaD, 1 chủng (0,5%) mang gen eagg đều được phân lập từ người khỏe mạnh và bệnh nhân tiêu chảy. Nhómphát sinh loài A và B1 chiếm ưu thế trong tổng số 210 chủng vi khuẩn E. coli sinh ESBL với tỷ lệ lần lượt là31,9% và 30%, trong khi nhóm B2, C, D, E, F và U chiếm tỷ lệ thấp hơn, lần lượt là 8,1%, 2,3%, 5,7%, 13,8%,6,2% và 1,4%. Có 7,1% chủng E. coli sinh ESBL phân lập từ thực phẩm và 4,9% chủng vi khuẩn từ bệnh nhântiêu chảy có khả năng đề kháng colistin do mang gen mcr-1. Kết luận: Vi khuẩn E. coli sinh ESBL mang gen độc lực đường ruột với tỷ lệ thấp. Một số chủng E. coli sinhESBL cũng đồng thời mang gen mcr-1 quy định khả năng đề kháng colistin. Vì colistin được xem là giải phápcuối cùng trong điều trị bệnh do vi khuẩn đa kháng, việc cấp thiết là phải tiến hành theo dõi và thực hiện các giảipháp can thiệp để ngăn chặn sự lan rộng của vi khuẩn mang gen kháng mcr. Từ khóa: gen độc lực, tính kháng colistinABSTRACT INTESTINAL VIRULENCE GENES AND COLISTIN RESISTANCE OF EXTENDED-SPECTRUM -LACTAMASE (ESBL) – PRODUCING ECHERICHIA COLI ISOLATED FROM FOOD, HEALTHY PEOPLE AND DIARRHEA PATIENTS IN HO CHI MINH CITYHoang Hoai Phuong, Le Thi Hien, Tran Nguyen Minh Doan, Nguyen Thi Anh Dao, Nguyen Do Phuc, * Ho Chi Minh City Journal of Medicine * Supplement of Vol. 23 – No. 5 - 2019: 388 - 395 Background: Some groups of Escherichia coli (E. coli) can cause intra- and extraintestinal disease becausethey carry different virulence genes. Nowadays, E. coli can be resistant to many antibiotics - especially third-generation cephalosporins and colistin, leading to a risk of treatment failure and increased mortality. Objectives: To evaluate of intestinal virulence and colistin resistance of 210 ESBL - E. coli isolates fromfood, healthy people and diarrhea patients in Ho Chi Minh City.*Viện Y Tế Công Cộng TP. Hồ Chí MinhTác giả liên lạc: ThS. Lê Thị Hiên ĐT: 0938640803 Email: lethihien@iph.org.vn388 Chuyên Đề Y Tế Công CộngY Học TP. Hồ Chí Minh * Phụ Bản Tập 23 * Số 5 * 2019 Nghiên cứu Y học Methods: ESBL genotypes, some intestinal virulence genes and phylogenetic group of 210 ESBL - E. colistrains were identified by PCR method. To determine the MIC value for colistin and check the presence of mcr-1gene in these strains. Results: The dominant ESBL genotype belongs to CTX-M group (82.9%) - including blaCTX-M-1 (52.9%),blaCTX-M-9 (30.5%). eagg and daaD were detected in 1 (0.5%) and 7 (3.4%) strains. The dominant phylogroupswere A (31.9%) and B1 (30%); phylogroup B2, C, D, E, F and U rates are lower, 8.1%, 2.3%, 5.7%, 13.8%,6.2% and 1.4%, respectively. 7.1% of ESBL - E. coli isolates from food and 4.9% from diarrhea patients hadcolistin MIC values of higher 2 µg/ml and were positive with mcr-1 gene. Conclusions: The frequency of intestinal virulence genes of ESBL - E. coli is low. Some ESBL - E. coliisolates also carry mcr-1 gene that encodes mobilized colistin resistance. As colistin is the last option againstmultidrug-resistant E. coli infection, careful monitoring of the evolution of colistin resistance and the sp ...