Trình tự genome plastid Emiliania huxleyi (p-3)

Phân tích các cụm gene So sánh trật tự gene trong số các plastid đã được đọc trình tự đầy đủ cho phép tạo nên một công cụ rất có giá trị để tìm hiểu các sự kiện diễn ra trong suốt quá trình tiến hóa của plastid cũng như quan hệ tiếnhóa giữa các nhóm tảo. Nằm trong mục đích này, nhóm tác giả đã nghiên cứu sự tổ chức các gene trong nhiều plastid thông qua sự phân tích các cụm gene.
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Trình tự genome plastid Emiliania huxleyi (p-3) Trình tự genome plastid Emiliania huxleyi (p-3)Phân tích các cụm geneSo sánh trật tự gene trong số cácplastid đã được đọc trình tự đầy đủcho phép tạo nên một công cụ rấtcó giá trị để tìm hiểu các sự kiệndiễn ra trong suốt quá trình tiến hóacủa plastid cũng như quan hệ tiếnhóa giữa các nhóm tảo. Nằm trongmục đích này, nhóm tác giả đãnghiên cứu sự tổ chức các genetrong nhiều plastid thông qua sựphân tích các cụm gene.Bộ gene plastid của các tảo chứachl-c thật sự đã trãi qua nhiều lầntái sắp xếp kể từ khi chúng thuđược thể cộng sinh thứ cấp từ dòngtảo đỏ.Xuyên suốt các bộ gene plastid,người ta nhận thấy có 2 cụm genebảo tồn; nhưng ở E. huxleyi thìngười ta chỉ tìm thấy 1. Cụm genechứa các gene trong operonribosome cũng như trật tự gene đãquan sát được ởcyanobacteria Synechocystissp PCC 6803 được cho là hai đặctính bảo tồn nhất trong tất cả cácplastid đã được đọc trình tự từtrước đến nay.Sự sắp xếp này phù hợp với lýthuyết cho rằng tất cả plastid đềucó nguồn gốc xuất xứ từ mộtcyanobacteria bị bắt làm thể cộngsinh và tất cả các plastid đều làcùng một tổ tiên (đơn nguồn gốc).Tất cả các gene trong cụm này đềunằm trên cùng một sợi DNA. Ở G.theta, người ta nhận thấy tất cả bọnchúng đều được phiên mã cùng mộtlúc. Tuy nhiên 4gene rps12, rps7, tufA và rps10 chỉtham gia vào cụm gene này trongtrường hợp plastid dòng đỏ. Ởcyanobacteria Synechocystis, 4gene này nằm cạnh một gene thứ15 (gene fus) nhưng lại không liênkết với cụm ribosome. Tương tự, ởplastid tảo xanh và glaucophytes,cụm này cũng không liên đới vớioperon ribosome và có vẻ nhưchúng đã trãi qua quá trình mấtgene. Người ta giả định rằng sựđịnh vị của cụm 5 gene diễn ra thờikỳ đầu ngay sau khi có sự phân lycủa dòng tảo đỏ khỏi dòng tảo xanhvà glaucophytes. Chính sự tái sắpxếp này ủng hộ quan hệ giữa cácplastid chứa chl-c với các plastidnằm trong dòng tảo đỏ.Cụm gene thứ hai cũng rất đángđược quan tâm liên quan đến cácchức năng đa dạng trong tế bào nhưsinh tổng hợp ATP (AtpA-1), kéodài RNA (rpoB-C2) và vận chuyểnđiện tử (petA). Các gene này,ngược lại với cụm gene ở trên, lạimã hóa trong các sợi DNA khácnhau. Ở tảo xanh và glaucophyta,nhiều gene trong cụm này lại pháttán xuyên khắp bộ gene. Nhưng ởplastid dòng đỏ nhưcryptophytes G. theta và khuêtảo O. sinensis trật tự gene (ngay cảkhi tính luôn các gene đã bị mất) lạicho thấy có tính bảo tồn nghiêmngặc. Điều này một lần nữa ủng hộquan điểm các plastid dòng đỏ coquan hệ gần với nhau. Thế nhưngquan sát trên plastid E. huxleyi thìngười ta lại thấy tất cả các genetrong cụm gene thứ 2 này lại phânbố trong 6 vùng độc lập.Tổng quát lại, mặc dù bộ geneplastid E. huxlyei nhỏ hơn và có sựtái sắp xếp không như mong đợinhưng kết quả phân tích thành phầngene, trật tự gene và chức nănggene cho thấy rằng thực sự tồn tạiquan hệ gần của plastid hatophytesvới plastid chứa chl-c từ heterokontvà cryptophytes. Các dữ liệu nàytương thích với lý thuyết cho rằngnguồn gốc của plastidchromophytebắt nguồn từ dòng tảođỏ. Nhưng dữ liệu phân tích lạikhông cho thấy quan hệ giữa cácdòng tế bào chủ, điều này cầnnghiên cứu nhiều hơn.