Xây dựng ngân hàng vi khuẩn với các dữ liệu về nguồn gốc chủng, tính chất vi thể, sinh hóa học, trình tự 16SrDNA, và tính chất đề kháng kháng sinh

Nghiên cứu được tiến hành với mục tiêu nhằm xây dựng ngân hàng vi khuẩn đã được định danh rõ ràng cùng với các dữ liệu về nguồn gốc chủng, tính chất vi thể, tính chất sinh hoá, kiểu đề kháng kháng sinh và trình tự của gene 16SrDNA. Mời các bạn cùng tham khảo đề tài qua bài viết này.
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Xây dựng ngân hàng vi khuẩn với các dữ liệu về nguồn gốc chủng, tính chất vi thể, sinh hóa học, trình tự 16SrDNA, và tính chất đề kháng kháng sinhXÂY DỰNG NGÂN HÀNG VI KHUẨN VỚI CÁC DỮ LIỆU VỀ NGUỒN GỐCCHỦNG, TÍNH CHẤT VI THỂ, SINH HÓA HỌC, TRÌNH TỰ 16SrDNA, VÀTÍNH CHẤT ĐỀ KHÁNG KHÁNG SINHPhạm Thái Bình(1,2), Lưu Ly Bích Ngân(2),Ngô Thị Hồng Thủy(2), Phạm Hùng Vân(1,2)TÓM TẮTĐặt vấn ñề: Ngân hàng các chủng vi khuẩn thuộc nhiều giống, loài khác nhau là phươngtiện rất hữu dụng dùng ñể huấn luyện và ñào tạo về vi sinh, ñể kiểm tra chất lượng của các phòngthí nghiệm, và ñể hổ trợ nhiều nghiên cứu khác.Mục tiêu nghiên cứu: Xây dựng ngân hàng vi khuẩn ñã ñược ñịnh danh rõ ràng cùng vớicác dữ liệu về nguồn gốc chủng, tính chất vi thể, tính chất sinh hoá, kiểu ñề kháng kháng sinh vàtrình tự của gene 16SrDNA.Đối tượng và phương pháp nghiên cứu: Thu nhận các chủng vi khuẩn từ những nguồn gốckhác nhau, ñịnh danh chính xác ñến loài dựa vào tính chất về vi thể, ñặc ñiểm khúm khuẩn, tínhchất sinh hóa cơ bản, trình tự gene 16rSDNA và tính chất ñề kháng kháng sinh. Các chủng vi khuẩnsau khi ñã xác ñịnh ñầy ñủ các tính chất ñã nêu sẽ ñược lưu giữ với bản ñồ vị trí lưu trữ trong hộplưu trữ và vị trí ñể hộp lưu trữ. Tạo một phần mềm quản lý hồ sơ lưu trữ.Kết quả nghiên cứu: Bước ñầu xây dựng ñược ngân hàng vi khuẩn với 155 chủng vi khuẩnthuộc152 loài khác nhau. Các chủng vi khuẩn này bao gồm Bacillus (14 chủng); Corynebacterium(5 chủng); Listeria (03 chủng); Lactobacillus (07 chủng); Enterobacteriaceae (30 chủng); trựckhuẩn Gram âm khác (30 chủng); Staphylococcus (07 chủng); Streptococcus (09 chủng);Enterococcus (04 chủng); cầu khuẩn Gram dương khác (02 chủng); Morexella (02 chủng);Neisseria (04 chủng); vi khuẩn kỵ khí (11 chủng) và các dòng vi khuẩn khác (27 chủng). Các chủngvi khuẩn này có nguồn gốc phân lập từ môi trường (74 chủng), từ chế phẩm men vi sinh (11 chủng),từ thực phẩm (07 chủng) và từ các nhiễm trùng trên người (65 chủng). Riêng những vi khuẩn phânlập từ nhiễm trùng ñược xác ñịnh thêm tính chất ñề kháng kháng sinh. Mỗi chủng có một hồ sơ lưutrên giấy và trong hồ sơ cơ sở dữ liệu. Đã lưu trữ các chủng ở hai ñiều kiện là -70oC và ñông khôñóng nút dưới áp lực 0.03-0.04 asmosphere, và các chủng lưu ñược cho vào các hộp giữ chủng cóbản ñồ xác ñịnh vị trí dễ dàng tìm thấy khi truy cập cơ sở dữ liệu trong hồ sơ và trong phần mềm.Một kết quả ñáng nói trong công trình này là ñã xây dựng ñược một phần mềm quản lý cơ sở dữliệu của ngân hàng chủng.Kết luận: Đây là ngân hàng vi khuẩn sống ñông khô giữ ở 4oC và ñông lạnh giữ ở -70oCñược quản lý ñầy ñủ các chi tiết có liên quan về nguồn gốc và tính chất vi sinh học. Ngân hàng vikhuẩn này sẽ ñược bổ sung liên tục ñể ngày càng phong phú và ña dạng giúp cho việc giảng dạy vànghiên cứu vi sinh học tại Việt Nam.Từ khóa: ngân hàng vi khuẩn, ngân hàng vi khuẩn ở Việt Nam.ESTABLISH THE BACTERIAL BANK WITH THE DATA RELATED TOSOURCE, 16SRDNA SEQUENCE, BIOCHEMICAL CHARACTERS AND ANTIBIOTICRESISTANT PATTERNSPhạm Thái Bình(2,2), Lưu Ly Bích Ngân(2),Ngô Thị Hồng Thủy(2), Phạm Hùng Vân(1,2)*ABTRACTBackground: A bacterial bank with various genus and species is very useful for training,quality control of the clinical laboratory of microbiology, and also supports variousmicrobiological researches.Objectives: Establish the bacterial bank containing the well identification strain, withsource, 16SrDNA sequence, biochemical characters and antibiotic resistant patterns.1Đại Học Y Dược TP. HCM, 2Phòng thí nghiệm NK-BiotekĐại Học Y Dược TP. HCM, 2Phòng thí nghiệm NK-BiotekLiên Hệ: Phạm Thái Bình – ĐT : 0903866915 – Email: xetnghiemvisinh@gmail.com2Materials and method: Collect the bacterial strains from various sources, identify tospecies based on the bacterial characters including microscopic/colony appearance, biochemicalcharacters, 16SrDNA sequence, and the antibiotic resistant pattern. The collected strains will bestored and kept in suitable boxes with located schema. The data related to the collected strains arekept in the stored files either hard copies and digital copies managed by a created specific software.Result: Until now, the bacterial bank of 155 strains of 152 species are built. These strainsinclude Bacillus (14 strains); Corynebacterium (5 strains); Listeria (03 strains); Lactobacillus (07strains); Enterobacteriaceae (30 strains); others Gram negative rods (30 strains); Staphylococcus(07 strains); Streptococcus (09 strains); Enterococcus (04 strains); others Gram positive cocci (02strains); Morexella (02 strains); Neisseria (04 strains); anaerobic bacteria (11 strains) và othersbacteria (27 strains). These strains are isolated from the environments (74), probiotic products(11), foods (7) and clinical specimens (65). The strains isolated from the clinical specimens wereparticularly determined antibiotic resistanct patterns. Each collected strain in the bacterial bankhad one form ...