Bài giảng Thực hành dịch tễ học thú y - ThS. Lê Thanh Hiền

Mục tiêu của bài giảng "Thực hành dịch tễ học thú y" là giới thiệu chung một số phần mềm sử dụng trong dịch tễ, sử dụng các phần mềm trong phân tích dịch tễ cơ bản, làm quen với phần mềm R. Hi vọng đây sẽ là một tài liệu hữu ích dành cho những ai quan tâm và muốn tìm hiểu về lĩnh vực này.
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Bài giảng Thực hành dịch tễ học thú y - ThS. Lê Thanh Hiền 8/25/2009 Thӵc hành dӏch tӉ hӑc thú y dŚƐ͘>ġdŚĂŶŚ,ŝӅŶ Mөc Tiêu• Giӟi thiӋu chung mӝt sӕ phҫn mӅm sӱ dөng trong dӏch tӉ » Phҫn mӅm quҧn lý sӕ liӋu » Phҫn mӅm thӕng kê• Sӱ dөng các phҫn mӅm trong phân tích dӏch tӉ hӑc cѫ bҧn » Phân tích ÿѫn biӃn » Phân tích ÿa biӃn• Làm quen vӟi phҫn mӅm R 1 8/25/2009 Chѭѫng trìnhy Ngày 1 y Giӟi thiӋu y Quҧn lý sӕ liӋu bҵng EpiData y Giӟi thiӋu phҫn mӅm thӕng kê STATAy Ngày 2 y Các nghiên cӭu dӏch tӉ y Các ÿҥi lѭӧng sӱ dөng trong nghiên cӭu dӏch tӉ y Dùng STATA ÿӇ tính các ÿҥi lѭӧng dung trong nghiên cӭu dӏch tӉ y Phân tích ÿa biӃn bҵng Logistic y Bài tұpy Ngày 3 y Thҧo luұn vӅ bài tұp y Giӟi thiӋu phҫn mӅm R y ThiӃt lұp bҧn ÿӗ nguy cѫ bҵng R y SaTScan ÿӇ xác ÿӏnh cluster trên bҧn ÿӗ dӏch tӉ ŚƚƚƉ͗ͬͬĚŝĐŚƚĞ͘ũŝŵĚŽ͘ĐŽŵͬ 2 8/25/2009 EŐăLJ ϭQuҧn lý sӕ liӋu ÿiӅu tra dӏch tӉ 3 8/25/2009 Sѫ ÿӗ nghiên cӭu Ĉһt giҧ thiӃtThiӃt kӃ khҧo sát, thí nghiӋm KiӇm chӭng Thu thұp, quҧn lý sӕ liӋu Ӭng dөng thӵc tiӉn Xӱ lý sӕ liӋu KӃt luұn DөĐƚŝġƵ^ĂƵŬŚŝŚŽăŶƚŚăŶŚƉŚҫŶƚŚӵĐƚұƉŶăLJ͕ĐĄĐƐӁ͗ϭ͘ ,ŝӇƵÿѭӧc ĐĄĐƚŚăŶŚƉŚҫŶĐӫĂĚĂƚĂďĂƐĞϮ͘ ŝӃƚĐĄĐŚƚŚŝӃƚŬӃ ĨůĂƚͲĨŝůĞĚĂƚĂďĂƐĞďҵŶŐĐĄĐŚƐӱ ĚөŶŐ ƉŝĂƚĂϯ͘ ,ŝӇƵÿѭӧc ĐĄĐŶŐƵLJġŶƚҳĐĐӫĂĚĂƚĂďĂƐĞƐϰ͘ ŝӃƚÿѭӧc ĐĄĐƉŚѭѫnŐƉŚĄƉŬŚĄĐŶŚĂƵÿӇ ŝŵƉŽƌƚ ĚĂƚĂǀăŽĐĄĐƉŚҫŶŵӅŵƚŚӕŶŐŬġ 4 8/25/2009 ӏŶŚŶŐŚšĂ • ,Ӌ ƚŚӕŶŐƋƵҧŶůljĂƚĂďĂƐĞ – ĂƚĂďĂƐĞƐŽĨƚǁĂƌĞ • ĂƚĂďĂƐĞ – ͞ŽůůĞĐƚŝŽŶŽĨĚĂƚĂƐƚŽƌĞĚŝŶƐŽŵĞŽƌŐĂŶŝnjĞĚ ĨĂƐŚŝŽŶ͟с͞ƚұƉŚӧƉĐĄĐĚӳ ůŝӋƵĐŚӭĂƚƌŽŶŐ ŶŚӳŶŐĚҥŶŐĐſƚә ĐŚӭĐ͟ ĄĐŚŞŶŚƚŚӭĐůѭƵƚƌӳ ĚĂƚĂ BiӃn (Variables = Fields) Mã xác ÿӏnh (Unique identifier = primary key, id)Dӳ liӋu quan sát(Records) 5 8/25/2009 ĄĐďѭӟc ƚƌŽŶŐƋƵҧŶůljĚӳ ůŝӋƵϭ͘ ӏŶŚŶŐŚšĂďŝӃŶϮ͘ dҥŽĐҩƵƚƌƷĐĚĂƚĂďĂƐĞǀăĚĂƚĂĚŝĐƚŝŽŶĂƌLJϯ͘ 8/25/2009 ӏŶŚŶŐŚšĂďŝӃŶ͗ӏŶŚĚҥŶŐǀăŐŝӟŝ ŚҥŶĐŚŽƉŚĠƉ• ĂƚĂĚŝĐƚŝŽŶĂƌLJ 9DULDEOH ([DPSOH 9DULDEOH VWRUDJHWSH• ӕŝ ǀӟŝ ŵӛŝ ďŝӃŶ &RQWLQXRXV :HLJKW 1XPHULFDOPDQ – dLJƉĞ – &ŽƌŵĂƚ &RQWLQXRXV 7LPH 1XPHULFDO • &ƌĞĞƚĞdžƚ;ŵĞĚŝĐĂƚŝŽŶ ,QWHUYDO %RGFRQGLWLRQ 1XPHULFDO6WULQJ Ϳ • ŝŶĂƌLJǀĂƌŝĂďůĞ %LQDU 3RV1HJ 1XPHULFDO ;ŵĞĚŝĐĂƚŝŽŶLJĞƐŽƌ 1RPLQDO (HFRORU 1XPHULFDO6WULQJ ŶŽͿ – WĞƌŵŝƐƐŝďůĞǀĂůƵĞƐ )UHHWH[W 2SHQHQGHG 6WULQJ TXHVWLRQ1DPHVͻ EŐƵLJġŶ ƚҳĐ $OWKRXJKHQWHUHGDVQXPHULFDOZLOOEHDQDO]HGDV Ͳ ͘Ő͘ϬсŶĞŐĂƚŝǀĞ FDWHJRULFDO• DŝƐƐŝŶŐǀĂůƵĞ DӝƚƐӕ ĚҥŶŐĚĂƚĂďĂƐĞ DWDVHWIRUPDW DWDEDVHFUHDWHGE $OOGDWDLQRQHVSUHDGVKHHW 5HVHDUFKHU $OOGDWDLQRQHWDEOHRIDGDWDEDVHFUHDWHG 5HVHDUFKHU EGDWDPDQDJHPHQWVVWHP $OOGDWDLQPXOWLSOHWDEOHVRIDGDWDEDVH 5HVHDUFKHU UHODWLRQDORUQRW $OOGDWDLQPXOWLSOHWDEOHVRIDUHODWLRQDO DWDEDVHSURIHVVLRQDOV GDWDEDVH 4XHULHG)LOWHUHGGDWDIURPPXOWLSOHWDEOHV DWDEDVHSURIHVVLRQDOV RIDUHODWLRQDOGDWDEDVH DWDIURPPXOWLSOHWDEOHVDQGPXOWLSOH LIIHUHQW VRXUFHVZLWKRUZLWKRXWUHIHUHQWLDO LQWHJULW 7 ...