Định típ phức hợp kháng nguyên bạch cầu người định típ phức hợp kháng nguyên bạch cầu người (HLA: human leukocyte antigen) bằng phương pháp giải trình tự thế hệ mới bằng phương pháp giải trình tự thế hệ mới

Phức hợp kháng nguyên bạch cầu người (HLA: human leukocyte antigen) là phức hợp các protein màng tế bào đóng vai trò quan trọng trong điều hòa miễn dịch. Định típ HLA rất cần thiết cho việc ghép tạng cũng như ghép tế bào gốc. Giải trình tự thế hệ mới là một công cụ hiện đại giúp định típ HLA dễ dàng, nhanh chóng và dần trở thành xu hướng trên toàn thế giới.
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Định típ phức hợp kháng nguyên bạch cầu người định típ phức hợp kháng nguyên bạch cầu người (HLA: human leukocyte antigen) bằng phương pháp giải trình tự thế hệ mới bằng phương pháp giải trình tự thế hệ mớiY Học TP. Hồ Chí Minh * Tập 23 * Số 3 * 2019 Nghiên cứu Y học ĐỊNH TÍP PHỨC HỢP KHÁNG NGUYÊN BẠCH CẦU NGƯỜI (HLA: HUMAN LEUKOCYTE ANTIGEN) BẰNG PHƯƠNG PHÁP GIẢI TRÌNH TỰ THẾ HỆ MỚI Mai Phương Thảo*, Lê Gia Hoàng Linh**, Nguyễn Thế Vinh**, Hoàng Anh Vũ**, Đỗ Đức Minh**TÓMTẮT Mục tiêu: Phức hợp kháng nguyên bạch cầu người (HLA: human leukocyte antigen) là phức hợp cácprotein màng tế bào đóng vai trò quan trọng trong điều hòa miễn dịch. Định típ HLA rất cần thiết cho việcghép tạng cũng như ghép tế bào gốc. Giải trình tự thế hệ mới là một công cụ hiện đại giúp định típ HLA dễdàng, nhanh chóng và dần trở thành xu hướng trên toàn thế giới. Đối tượng và phương pháp: 66 đối tượng tình nguyện tham gia nghiên cứu được định típ HLA bằngphương pháp giải trình tự thế hệ mới kết hợp với phân tích sinh tin học trên phần mềm Assign TrusightHLA v2,0. Kết quả: Chúng tôi đã định típ HLA lớp I và lớp II của 66 đối tương tham gia nghiên cứu bằng phươngpháp giải trình tự thế hệ mới và thu thập được phân bố các kiều gen HLA phổ biến ở người Việt Nam. Kết luận: Kỹ thuật giải trình tự thế hệ mới là một kỹ thuật định típ HLA chính xác, nhanh chóng, hiệu quảvà tiết kiệm chi phí. Từ khóa: phức hợp kháng nguyên bạch cầu người (HLA), giải trình tự thế hệ mới, phản ứng PCRABSTRACT HUMAN LEUKOCYTE ANTIGEN (HLA) TYPING BY NEXT GENERATION SEQUENCING Mai Phuong Thao, Le Gia Hoang Linh, Nguyen The Vinh, Hoang Anh Vu, Đo Đuc Minh * Ho Chi Minh City Journal of Medicine * Vol. 23 ‐ No 3‐ 2019: 111‐116 Objectives: Human leukocyte antigen (HLA), a cell-surface protein complex, is responsible for theregulation of the immune system. HLA typing is necessary step in stem cell and organ transplantation. Nextgeneration sequencing (NGS) is a modern tool that makes HLA typing fast, simple and becoming global trend. Material - Methods: HLA complex from 66 objects participated in the study were sequenced by nextgeneration sequencing. Data later were analyzed with Assign Trusight HLA v2.0 software. Results: HLA class I and II of 66 objects were typed and the distribution of common HLA variants in KinhVietnamese people were obtained. Conclusion: HLA typing by NGS is accurate, fast and cost-saving. Keywords: human leukocyte antigen (HLA), next generation sequencing (NGS), polymerase chain reaction (PCR)ĐẶT VẤN ĐỀ hiện diện trên bề mặt hầu hết các tế bào có nhân trong cơ thể với mức độ biểu hiện khác nhau có Các gen mã hóa cho hệ thống phức hợp nhiệm vụ chính là trình diện các peptide nội bàokháng nguyên bạch cầu người (HLA) được chia của các tế bào trong cơ thể bị nhiễm virus hoặcthành 3 lớp chính, trong đó chủ yếu là lớp I các tế bào khiếm khuyết, bất thường cho các tế(HLA‐A, HLA‐B và HLA‐C) và lớp II (HLA‐ bào lympho T CD8 thông qua thụ thể tế bào TDRB1 và HLA‐DQB1) tham gia vào quá trình (TCR: T cell receptor) dẫn đến hiệu quả cuối cùngtương tác giữa mảnh ghép và kí chủ. HLA lớp I là phá hủy tế bào này (thường thông qua cơ chế*Bộ môn Sinh lý học – Khoa Y – Đại học Y Dược TP. Hồ Chí Minh**Trung tâm Y sinh học phân tử ‐ Đại học Y Dược TP. Hồ Chí MinhTác giả liên lạc: TS.BS Đỗ Đức Minh ĐT: 0932999989 Email: ducminh@ump.edu.vn 111Nghiên cứu Y học Y Học TP. Hồ Chí Minh * Tập 23 * Số 3 * 2019gây độc tế bào). Trong khi đó, HLA lớp II thường hiếm, mới;biểu hiện giới hạn ở các tế bào đã được hoạt hóa Ngày càng có nhiều các alen HLA mới đượcmiễn dịch, bao gồm tế bào B và các tế bào trình phát hiện, do đó các bộ kit này cần được cậpdiện kháng nguyên khác (APC: antigen‐ nhật liên tục.presenting cells) với nhiệm vụ trình diện các Trong khi đó, trên thế giới, việc định típpeptide ngoại lai từ các tác nhân gây bệnh cho tế HLA dựa chủ yếu vào phương pháp xác địnhbào lympho T CD4 và sau đó các tế bào T này sẽ trình tự nucleotid bằng phương pháp Sangerhoạt hóa các tế bào B và sản sinh ra hàng loạt các hoặc giải trình tự thế hệ mới (SBT: sequencekh ...