Luận văn Thạc sĩ Công nghệ Sinh học: Nghiên cứu đặc điểm đa hình nucleotide đơn ở hai vùng siêu biến HVS-I và HVS-II trên D-loop ty thể của một số dân tộc Việt Nam

Đề tài “Nghiên cứu đặc điểm đa hình nucleotide đơn ở hai vùng siêu biến HVS-I và HVS-II trên D-loop ty thể của một số dân tộc Việt Nam” được tiến hành với mục đích khai thác nguồn dữ liệu di truyền ty thể ở 3 dân tộc Cờ Lao, Phù Lá và Kinh đồng thời đánh giá làm rõ sự tương đồng và khác biệt di truyền giữa 3 dân tộc.
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Luận văn Thạc sĩ Công nghệ Sinh học: Nghiên cứu đặc điểm đa hình nucleotide đơn ở hai vùng siêu biến HVS-I và HVS-II trên D-loop ty thể của một số dân tộc Việt Nam BỘ GIÁO DỤC VIỆN HÀN LÂM KHOA HỌC VÀ ĐÀO TẠO VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM HỌC VIỆN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ ----------------------------- Nguyễn Doãn TìnhNGHIÊN CỨU ĐẶC ĐIỂM ĐA HÌNH NUCLEOTIDE ĐƠN Ở HAI VÙNG SIÊU BIẾN HVS-I VÀ HVS-II TRÊN D-LOOP TY THỂ CỦA MỘT SỐ DÂN TỘC VIỆT NAM LUẬN VĂN THẠC SĨ : CÔNG NGHỆ SINH HỌC Hà Nội, 2020 BỘ GIÁO DỤC VIỆN HÀN LÂM KHOA HỌC VÀ ĐÀO TẠO VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM HỌC VIỆN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ ----------------------------- Nguyễn Doãn TìnhNGHIÊN CỨU ĐẶC ĐIỂM ĐA HÌNH NUCLEOTIDE ĐƠN Ở HAI VÙNG SIÊU BIẾN HVS-I VÀ HVS-II TRÊN D-LOOP TY THỂ CỦA MỘT SỐ DÂN TỘC VIỆT NAM Chuyên ngành: Sinh học thực nghiệm Mã số: 8420114 LUẬN VĂN THẠC SĨ CÔNG NGHỆ SINH HỌC NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC: Hướng dẫn 1: TS. Nguyễn Thùy Dương Hà Nội, 2020 i Lời cam đoan Tôi xin cam đoan: Đây là công trình nghiên cứu của tôi và một số kết quả cùng cộng tácvới các cộng sự khác; Các số liệu và kết quả trình bày trong luận văn là trung thực, một phầnđã được công bố tại hội nghị khoa học chuyên ngành với sự đồng ý và chophép của các đồng tác giả; Phần còn lại chưa được ai công bố trong bất kỳ công trình nào khác. Tác giả Nguyễn Doãn Tình ii Lời cảm ơn Để thực hiện thành công luận văn thạc sĩ này, tôi xin gửi lời cảm ơnsâu sắc và chân thành đến TS. Nguyễn Thùy Dương (Trưởng phòng Hệ genhọc người - Viện Nghiên cứu hệ gen, Viện Hàn lâm Khoa học và Công nghệViệt Nam), người đã trực tiếp hướng dẫn, chỉ bảo tận tình trong suốt thời giantôi thực hiện đề tài. Cô là người đã tạo điều kiện cũng như truyền cho tôinhững kinh nghiệm quý báu trong nghiên cứu khoa học. Tôi cũng xin được bày tỏ lòng biết ơn của mình đến PGS. TS. Nông VănHải (Chủ tịch Hội đồng Khoa học, Viện Nghiên cứu hệ gen), tập thể cán bộPhòng Hệ gen học người và các cán bộ Viện Nghiên cứu hệ gen, Viện Hànlâm Khoa học và Công nghệ Việt Nam đã tạo điều kiện thuận lợi và tận tìnhhướng dẫn, trợ giúp tôi thực hiện tốt đề tài nghiên cứu này. Tôi xin chân thành cảm ơn các thầy cô thuộc Khoa Công nghệ sinh học,Học viện Khoa học và Công nghệ đã tạo điều kiện tốt nhất cho tôi để hoànthành luận văn này. Luận văn được thực hiện trong khuôn khổ của đề tài “Xây dựng cơ sở dữliệu hệ gen biên thể ty thể và nhiễm sắc thể Y của một số dân tộc người ViệtNam” mã số ĐTĐL.CN-60/19 thuộc Bộ Khoa học và Công nghệ. Tác giả Nguyễn Doãn Tình iii Danh mục các ký hiệu và chữ viết tắtChữ viết tắt Tên đầy đủ Tên tiếng việtbp Base pair Cặp bazơDNA Deoxyribonucleic acid Axit DeoxyribonucleicddNTP Dideoxynucleoside Dideoxynucleoside triphosphate triphosphatedNTP Deoxynucleoside Deoxynucleoside triphosphate triphosphateEDTA Ethylene diamine tetra-acetic Axit ethylene diamine tetra- acid aceticEtOH Ethanol EtanolHVS-I Hypervariable segment 1 Đoạn siêu biến 1HVS-II Hypervariable segment 2 Đoạn siêu biến 2PCR Polymerase chain reaction Phản ứng chuỗi polymeraseRNA Ribonucleic acid Axit ribonucleicRFLP Restriction Fragment Length Đa hình chiều dài đoạn cắt giới Polymorphism hạnTAE Tris – acetate – EDTA Tris – acetate – EDTASNP Single nucleotide Đa hình nucleotide đơn polymorphism iv Danh mục các bảngBảng 2.1. Danh sách mẫu nghiên cứu của mỗi dân tộc Kinh ......................... 19Bảng 3.1. Thống kê các đa hình xuất hiện ở 2 vùng trình tự HVS-I và HVS-IIở 120 mẫu nghiên cứu ..................................................................................... 47Bảng 3.2. Số lượng các đa hình trung bình phát hi ...