Luận văn tốt nghiệp: BƯỚC ĐẦU ĐÁNH GIÁ MỨC ĐỘ ĐA DẠNG DI TRUYỀN CỦA QUẦN THỂ ĐIỀU (Anacardium occidental L.) TẠI TỈNH BÀ RỊA – VŨNG TÀU BẰNG KỸ THUẬT RAPD VÀ AFLP (part 6)

Nhận xét: Băng điện di của DNA chạy trên máy chế tạo cho kết quả rõ hơn band điện di chạy trên máy eppendorf. Máy chế tạo sau khi điện di cho ra 3 băng DNA, còn máy đối chứng cho ra 2 băng. Giải thích kết quả: Băng của máy chế tạo cho kết quả rõ hơn, vì trong quá trình hạ nhiệt độ để primer bắt cặp với DNA khuôn, thì tốc độ hạ nhiệt của máy chế tạo chậm hơn máy eppendorf vì vậy số lượng primer bắt cặp với DNA khuôn cao hơn. ...
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Luận văn tốt nghiệp: BƯỚC ĐẦU ĐÁNH GIÁ MỨC ĐỘ ĐA DẠNG DI TRUYỀN CỦA QUẦN THỂ ĐIỀU (Anacardium occidental L.) TẠI TỈNH BÀ RỊA – VŨNG TÀU BẰNG KỸ THUẬT RAPD VÀ AFLP (part 6) 46 Bảng 4.6 Chu kỳ nhiệt chạy PCR Nhiệt độ (0C) Số chu kỳ Thời gian (phút) 1 94 4 94 1 37 33 1 72 2 1 72 10 Hold 40 CKết quả điện di sau khi đã chạy PCR Chạy trên máy Chạy đối chứng trên máy Eppendorf PCR Thùy Dương Nhận xét: Băng điện di của DNA chạy trên máy chế tạo cho kết quả rõ hơn band điện dichạy trên máy eppendorf. Máy chế tạo sau khi điện di cho ra 3 băng DNA , còn máyđối chứng cho ra 2 băng. Giải thích kết quả: Băng của máy chế tạo cho kết quả rõ hơn, vì trong quá trình hạ nhiệt độ để primerbắt cặp với DNA khuôn, thì tốc độ hạ nhiệt của máy chế tạo chậm hơn máy eppendorfvì vậy số lượng primer bắt cặp với DNA khuôn cao hơn. 47 Hơn nữa, ở giai đoạn duy trì nhiệt độ, nhiệt độ của máy eppendof rất ổn định xemnhư không đổi. Trong khi máy chế tạo, sự biến thiên so với nhiệt độ duy trì:  Thấp hơn nhiệt độ duy trì lớn nhất: 0,80C  Cao hơn nhiệt độ duy trì lớn nhất: 1,10C Do sự biến thiên nhiệt này làm cho hóa chất trong ống eppendorf có sự đối lưu tốthơn, hay nói cách khác sự chuyển động hỗn độn của các phần tử nhanh hơn. Do vậyhóa chất được phân bố đều trong toàn thể tích làm cho phản ứng xảy ra tốt hơn. 48 Phần 5. Kết luận và đề nghị5.1. Kết luận Bước đầu máy hoạt động cơ bản theo ý muốn, chạy đúng theo chương trình cài từbàn phím, tốc độ biến thiên nhiệt chấp nhận được (1oC/s ± 0,3), các bộ phận bên trongmáy hoạt động bình thường, nhiệt độ duy trì sai số ± 0,5oC. Đây là máy lần đầu chế tạovà cũng là máy chế tạo đầu tiên trong nước, khó tránh khỏi những hạn chế này. Bước đầu chạy PCR đã cho kết quả tốt.5.2. Đề nghị5.2.1. Về chạy mẫu Cần chạy thêm nhiều mẫu với nhiều kỹ thuật khác nhau để xác định tốc độ tănggiảm nhiệt tối ưu và nhiệt độ biến thiên (trong giai đoạn duy trì) tối ưu nhằm rút ngắnthời gian chạy mẫu và nâng cao độ tin cậy.5.2.2. Bộ phận khuyếch đại Thay IRF2807 bằng IRF khác công suất lớn hơn và điện trở nhỏ hơn vì IRF2807(3Ω) còn sinh nhiệt lớn.5.2.3. Bộ phận vi xử lý Mở rộng thêm bộ nhớ ngoài giúp người sử dụng tiện dùng hơn, khi máy đangchạy bị cúp điện chỉ cần gọi chương trình lưu ra không cần phải nhập lại chu trìnhchạy mẫu.5.2.4. Mạch khuếch đại Pt Tìm mạch tối ưu hơn, có hệ số tuyến tính cao, giảm sai số, ổn định cao.5.2.5. Nguồn điện Trọng lượng của máy sẽ giảm xuống 7 kg nếu ta thay đổi biến áp chuyển sangdùng nguồn xung tương tự như nguồn máy tính. 495.2.6. Bàn phím Thiết kế phím cao su chìm làm tăng tính thẩm mỹ độ bền và thao tác dễ dàng.5.2.7. Vỏ và khung Chuyển sang đúc bằng nhựa chịu nhiệt giúp giảm trọng lượng và chống nhiễu,tăng thẩm mỹ.5.2.8. Chương trình Viết thêm phần trợ giúp, phần hạn chế nhiệt độ quá cao và phần báo lỗi khi hoạtđộng gặp sự cố. Linh hoạt nhiệt độ tấm tản nhiệt hơn trong quá trình chạy máy, sẽ rút ngắn thờigian chạy mẫu và tốc độ thay đổi nhiệt độ ổn định hơn. Chương trình viết đã điều khiển 2 yếu tố nhiệt độ và thời gian, yếu tố thứ 3 cũngkhá quan trọng là tốc độ thay đổi nhiệt độ. Cần khảo sát kỹ tốc độ biến thiên nhiệt, tốcđộ thay đổi nhiệt ảnh hưởng đển phản ứng PCR như thế nào nhằm rút ngắn thời gianchạy mẫu và nâng cao độ tin cậy. Khi cả 3 yếu tố là nhiệt độ, thời gian và tốc độ thayđổi nhiệt độ được kiểm soát tốt máy sẽ có độ tin cậy như máy nhập ngoại hiện đại.5.2.9. Thermoelectric module Cần thay thế loại công suất lớn hơn, quan tâm nhất ở đây là dòng điện qua tối đa(IMax), nên chọn loại IMax nhỏ nhất nhằm hạ giá thành chế tạo và tăng độ bền. Đối vớimáy PCR loại 25 giếng nên chọn loại Thermoelectric 25 V - 35V, 5 A5.2.10 Tản nhiệt Tản nhiệt chỉ dùng nhôm đen vì nhôm này độ đặc gần 100%. Điều quan tâm ở đâylà bề dày của tản nhiệt và độ dài của cánh tản nhiệt. Bề dày tối thiểu là 5 mm, cánh tảnnhiệt khoảng 5 - 8 cm. Ta quan tâm đến tản nhiệt vì liên q ...