Nghiên cứu cấu trúc và đánh giá in silico biểu hiện của họ gen mã hóa tiểu phần Nuclear factor-YB ở cây rau dền

Trong nghiên cứu này, thông tin về tiểu phần Nuclear factor-YB (NF-YB) ở cây rau dền (Amaranthus hypochondriacus) đã được phân tích một cách toàn diện thông qua các công cụ tin sinh học. Kết quả đã xác định được tổng số 16 thành viên trong họ NF-YB ở A. hypochondriacus. Phân tích cấu trúc cho thấy họ NF-YB có kích thước dao động từ 51 đến 328 axit amin, tương ứng với trọng lượng từ 5,58 đến 35,88 kilo Dalton. Giá trị điểm đẳng điện của NF-YB ở rau dền nằm trong khoảng từ axit (4,09) đến bazơ (9,95). Mời các bạn tham khảo!
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Nghiên cứu cấu trúc và đánh giá in silico biểu hiện của họ gen mã hóa tiểu phần Nuclear factor-YB ở cây rau dền Tạp chí Khoa học Công nghệ Nông nghiệp Việt Nam - Số 2(111)/2020 IV. KẾT LUẬN trình nhân giống in vitro một số giống khoai sọ. Môi trường MS bổ sung 2,0 mg/l BAP và 0,5 mg/l Tạp chí Khoa học, Đại học Huế, (67): 44-50. NAA (TC2) ảnh hưởng tốt tới các chỉ tiêu theo dõi Ding M., Tang D., & Hang D., 2009. Study on in vitro trong quá trình tái sinh chồi trực tiếp từ đỉnh sinh tuberization of Colocasia esculenta var. antiuorum cv. trưởng và mầm ngủ của cây khoai sọ Cụ Cang, tỷ lệ ‘Xiang-su-yu’ and related factors. Journal of Shanghai Jiaotong University - Agricultural Science,  27(4): mẫu sạch tạo chồi đạt 77,36%, số chồi trung bình/ 389-393. mẫu đạt 1,07 chồi/mẫu. Murashige T., Skoog F., 1962. A revised medium Môi trường MS bổ sung 2,0 mg/l BAP và 0,2 mg/l for rapid growth and bioassay with tobaco tissue NAA (NN2) hoặc 0,4mg/l NAA (NN3) ảnh hưởng cultures. Physiol Plant, (15): 473-497. tốt các chỉ tiêu theo dõi trong quá trình nhân nhanh Miao J., Bai X., Jiang X., & Zhao J., 2004. Effects of chồi khoai sọ Cụ Cang in vitro, tỷ lệ mẫu tạo chồi đạt growth regulators on rapid propagation of virus- 71,41% (NN2) và 70,38% (NN3), số chồi/mẫu đạt free plantlets of taro.  Journal of Anhui Agricultural 1,11 (NN2) và 1,00 (NN3), hệ số nhân chồi đạt 4,45 University, 31(4): 466-468. (NN2) và 4,02 (NN3). Sant R., Taylor M., & Tyagi A., 2006. Cryopreservation Môi trường MS bổ sung 0,5 mg/l NAA và of in vitro-grown shoot-tips of tropical taro 0,3 mg/l IBA (RR3) ảnh hưởng tốt khả năng tạo rễ (Colocasia esculenta var. esculenta) by vitrification. cây khoai sọ Cụ Cang in vitro, tỷ lệ mẫu sạch tạo rễ CryoLetters, 27(3): 133-142. đạt 81,14%, số rễ trung bình/mẫu đạt 9,8. Tang Q., Niu Y., Wang Z., Wang X., Song M., & Li, Q., 2006. Study on effect of hormone, LH and carbon TÀI LIỆU THAM KHẢO source in taro buds subculture.  Southwest China Trần Thị Lệ, Trần Thị Triệu Hà, 2011. Nghiên cứu quy Journal of Agricultural Sciences, 19(5): 928-930. In vitro propagation of Cu Cang taro variety at Tay Bac University Doan Thi Thuy Linh Abstract This study aim to propagate Cu Cang taro variety from apical buds by in vitro. The results showed that MS medium supplemented with 2.0 mg/l BAP and 0.5 mg/l NAA was best for bud regeneration; the rate of samples generating bud reached 77.36%; the average number of buds/sample reached 1.07. MS medium supplemented with 2.0 mg/l BAP and 0.2 mg/l NAA (NN2) or 0.4 mg/l NAA (NN3) showed high efficiency of taro shoot propagation; the rate of samples generating bud reached 71.41% (NN2) and 70.38% (NN3), the number of buds/sample was 1.11 (NN2) and 1.00 (NN3), shoot multiplication coefficient reached 4.45 (NN2) and 4.02 (NN3). MS medium supplemented with 0.5 mg/l NAA and 0.3 mg/l IBA (RR3) was good for generating taro roots in vitro; the ratio of rooting clean samples reached 81.14% rooting, and the average number of roots/sample was 9.8. Keywords: Cu Cang taro variety (Colocassia essculenta L. Schott), in vitro propagation, Tay Bac University Ngày nhận bài: 15/02/2020 Người phản biện: TS. Nguyễn Thị Lan Hoa Ngày phản biện: 22/02/2020 Ngày duyệt đăng: 27/02/2020 NGHIÊN CỨU CẤU TRÚC VÀ ĐÁNH GIÁ IN SILICO BIỂU HIỆN CỦA HỌ GEN MÃ HÓA TIỂU PHẦN NUCLEAR FACTOR-YB Ở CÂY RAU DỀN Lê Thị Ngọc Quỳnh1, Chu Đức Hà2 TÓM TẮT Trong nghiên cứu này, thông tin về tiểu phần Nuclear factor-YB (NF-YB) ở cây rau dền (Amaranthus hypochondriacus) đã được phân tích một cách toàn diện thông qua các công cụ tin sinh học. Kết quả đã xác định được tổng số 16 thành viên trong họ NF-YB ở A. hypochondriacus. Phân tích cấu trúc cho thấy họ NF-YB có kích thước dao động từ 51 đến 328 axit amin, tương ứng với trọng lượng từ 5,58 đến 35,88 kilo Dalton. Giá trị điểm đẳng điện của NF-YB ở rau dền nằm trong khoảng từ axit (4,09) đến bazơ (9,95). Sơ đồ hình cây cho thấy NF-YB có sự tương đồng về cấu trúc vùng bảo thủ, với 3 miền chức năng riêng biệt. Đánh giá dữ liệu biểu hiện cho thấy họ gen mã 1 Bộ môn Công nghệ Sinh học, Khoa Hóa và Môi trường, Đại học Thủy lợi; 2 Viện Di truyền Nông nghiệp 31 Tạp chí Khoa học Công nghệ Nông nghiệp Việt Nam - Số 2(111)/2020 hóa NF-YB được tăng cường biểu hiện ở ít nhất 1 cơ quan trên cây rau dền. Trong đó, 4 gen, AHYPO_001076-RA, AHYPO_003409-RA, AHYPO_013452-RA và AHYPO_014999-RA biểu hiê ...