NGHIÊN CỨU GIẢI MÃ VÙNG GEN VP1 CỦA MỘT SỐ MẪU VACXIN VIÊM GAN VỊT HIỆN ĐANG SỬ DỤNG TẠI VIỆT NAM

Viêm gan vịt là một bệnh truyền nhiễm xảy ra ở thể cấp tính đối với vịt con. Trong hệ gen của virus viêm gan vịt, gen kháng nguyên VP1 - vừa quyết định tính kháng nguyên, vừa quyết tính độc lực của virus. Trong đề tài này, toàn bộ gen VP1 có độ dài 714 bp đã được thu nhận từ hai chủng
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
NGHIÊN CỨU GIẢI MÃ VÙNG GEN VP1 CỦA MỘT SỐ MẪU VACXIN VIÊM GAN VỊT HIỆN ĐANG SỬ DỤNG TẠI VIỆT NAMTuyển tập Báo cáo “Hội nghị Sinh viên Nghiên cứu Khoa học” lần thứ 6 Đại học Đà Nẵng - 2008 NGHIÊN CỨU GIẢI MÃ VÙNG GEN VP1 CỦA MỘT SỐ MẪU VACXIN VIÊM GAN VỊT HIỆN ĐANG SỬ DỤNG TẠI VIỆT NAM STUDY ON GENETIC PROPERTIES OF THE ANTIGENIC VP1 GENE OF THE TWO ATTENUATED VACCINE VIRUS SAMPLES OF DUCK HEPATITIS CURRENTLY USED IN VIETNAM SVTH: NGUYỄN THỊ DIỄM QUỲNH Lớp: 03 SH, Trường Đại học Bách khoa GVHD: PGS. TS. LÊ THANH HÒA Phòng Miễn dịch học-Viện Công nghệ Sinh học-Viện Khoa học và Công nghệ Việt Nam TÓM TẮT Viêm gan vịt là một bệnh truyền nhiễm xảy ra ở thể cấp tính đối với vịt con. Trong hệ gen của virus viêm gan vịt, gen kháng nguyên VP1 - vừa quyết định tính kháng nguyên, vừa quyết tính độc lực của virus. Trong đề tài này, toàn bộ gen VP1 có độ dài 714 bp đã được thu nhận từ hai chủng vacxin nghiên cứu: i) chủng vacxin xưởng thuốc (kí hiệu là Vx XT), ii) chủng vacxin Ai Cập (kí hiệu là VxAC). Với chương trình BLAST, tiến hành truy cập Ngân hàng gen sử dụng chuỗi gen kháng nguyên VP1 của hai mẫu nghiên cứu trên, chúng tôi nhận thấy rằng gen VP1 của mẫu VxAC có độ tương đồng cao với các chủng virus viêm gan vịt type 1 (DHV1) của thế giới. Bằng phương pháp phân tích phả hệ cho thấy: Chủng vacxin Ai Cập có thể có nguồn gốc từ Trung Quốc, còn chủng vacxin xưởng thuốc mặc dù vẫn nằm trong nhánh các chủng của Trung Quốc nhưng có quan hệ xa hơn so với chủn g vacxin Ai Câp, và có thể có nguồn gốc từ một chủng cổ điển của Hàn Quốc. ABSTRACT Duck hepatitis virus (DHV) is an acute and fatal disease of young ducklings characterized by its rapid transmission. In the genome of Duck hepatitis virus type 1 (DHV1), the VP1 antigenic gene affects to the antigenic and virulent of hepatitis virus. The complete 714 bp VP1 sequence was obtained from the two samples of attenuated vaccine: i) a vaccine strain from VETVACO (designated as VxXT); ii) a vaccine strain from Egypt (designated as VxAC) strains (Egyptian vaccine). Using the VP1 sequence of each strain as an entry to search at BLAST, it revealed that our VP1 of VxAC has high identity to DHV1 of world strains. Phylogenetic analysis confirmed the Chinese origin of VxAC and Korean origin of VxXT. The VxXT strain, although belongs to the group of other Chinese strains, has more distant relation than the Egyptian vaccine (VxAC) strain, possibly it has been originated from a classical strain of Korea.1. ĐẶT VẤN ĐỀ Bệnh viêm gan vịt do virus (duck hepatitis virus-DHV) là một bệnh truyền nhiễm xảy ra ởthể cấp tính với vịt con 1-6 tuần tuổi (Woolcock, 2003) [5], bệnh lây lan nhanh và gây tỉ lệchết rất cao, có khi lên đến 100% trên toàn đàn. Hệ gen của virus viêm gan vịt chứa axitribonucleic (ARN). Trong hệ gen của virus viêm gan vịt, thì vùng được quan tâm nhiều nhất làvùng gen mã hoá cho protein cấu trúc VP1. Vùng gen này đã được chứng minh là gen khángnguyên, nó vừa quyết định tính kháng nguyên vừa quyết định tính gây bệnh của virus (Muldervà cs, 2000), (Oberste và cs, 1999), (Santti và cs, 2000) [1], [2], [3]. Để phòng và trị bệnhviêm gan vịt, ở nước ta đang sử dụng một số loại vacxin nhược độc và vô hoạt, nhưng hiệuquả vẫn còn nhiều hạn chế. Mặc khác, hiện nay ở nước ta vẫn chưa có một nghiên cứu nào vềsinh học phân tử gen kháng nguyên VP1 và hệ gen virus viêm gan vịt. Từ thực tế đó, để cungcấp nguồn gen virus viêm gan vịt trong ngân hàng gen của nước ta, đồng thời góp phần xácđịnh chính xác khả năng bảo hộ của vacxin đang sử dụng hiện nay, chúng tôi tiến hành thựchiện đề tài: “Nghiên cứu giải mã vùng gen VP1 của một số mẫu vacxin viêm gan vịt hiện đangđược sử dụng tại Việt Nam”. 242Tuyển tập Báo cáo “Hội nghị Sinh viên Nghiên cứu Khoa học” lần thứ 6 Đại học Đà Nẵng - 20082. TỔNG QUAN Hệ gen của virus viêm gan vịt bao gồm khoảng 7690 nucleotit, chứa duy nhất mộtkhung đọc mở, mã hoá cho một chuỗi protein duy nhất, chuỗi protein này sau khi được tạo ra,sẽ trải qua nhiều lần phân cắt để tạo các protein sản phẩm độc lập (Tseng và cs., 2007) [4].Nằm ở đầu 5’ có vùng gen không mã hoá gọi là 5’UTR, nằm ở đầu 3’ cũng có vùng gen khôngmã hoá gọi là 3’UTR, và đuôi poly (A) ở cuối. Giữa hai vùng không mã hoá 5’UTR và 3’UTRlà vùng gen mã hoá tổng hợp protein. Vùng này bao gồm ba tổ hợp gen: tổ hợp gen P1 mã hoácho ba loại protein cấu trúc là VP0, VP3 và VP1; tiếp theo là tổ hợp gen P2 mã hoá cho cácprotein không cấu ...