Nghiên cứu sử dụng đĩa thạch Fucoidan để sàng lọc và xác định hoạt tính Fucoidanase từ vi sinh vật biển
Số trang: 6
Loại file: pdf
Dung lượng: 1.09 MB
Lượt xem: 7
Lượt tải: 0
Xem trước 2 trang đầu tiên của tài liệu này:
Thông tin tài liệu:
Bài viết này sử dụng phương pháp đĩa thạch fucoidan để sàng lọc hoạt tính fucoidanase của vi sinh vật. Vi sinh vật được nuôi cấy trên đĩa thạch chứa fucoidan, chủng vi khuẩn có hoạt tính là khi vùng nuôi cấy không bị nhuộm bởi hexadecyltrimethylammonium bromide (cetavlon) 1% (w/v) mà hình thành vùng trong suốt.
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Nghiên cứu sử dụng đĩa thạch Fucoidan để sàng lọc và xác định hoạt tính Fucoidanase từ vi sinh vật biểnTAP CHI SINH HOC2016,Thi38(2):186-191NguyenThuanet al.DOI:10.15625/0866-7160/v38n2.7112NGHIÊN CỨU SỬ DỤNG ĐĨA THẠCH FUCOIDAN ĐỂ SÀNG LỌCVÀ XÁC ĐỊNH HOẠT TÍNH FUCOIDANASE TỪ VI SINH VẬT BIỂNNguyễn Thị Thuận*, Cao Thị Thúy Hằng, Huỳnh Hoàng Như Khánh,Trương Hải Bằng, Phạm Đức Thịnh, Trần Thị Thanh Vân, Bùi Minh LýViện Nghiên cứu và Ứng dụng công nghệ Nha Trang, Viện Hàn lâm KH & CN Việt Nam,*nguyenthuan@nitra.vast.vnTÓM TẮT: Khả năng sinh enzyme phân cắt fucoidan của vi sinh vật biển được sàng lọc bởiphương pháp đĩa thạch fucoidan. Vi sinh vật được nuôi cấy trên đĩa thạch chứa fucoidan, chủng vikhuẩn có hoạt tính là khi vùng nuôi cấy không bị nhuộm bởi hexadecyltrimethylammoniumbromide (cetavlon) 1% (w/v) mà hình thành vùng trong suốt. Trong số 44 chủng vi sinh vật đượcphân lập từ hải sâm, sò ốc và cầu gai, 2 chủng có khả năng sinh enzyme phân cắt fucoidan từ cảhai loại rong Sargassum mcclurei và Sargassum polycystum, 4 chủng sinh enzyme chỉ phân cắtfucoidan của một loại rong biển. Tất cả các chủng vi khuẩn này đều sinh enzyme phân cắt fucoidannội bào.Từ khóa: Sargassum mcclurei, Sargassum polycystum, fucoidan, fucoidanase, vi sinh vật biển.MỞ ĐẦUFucoidan là nhóm sulphat polysacarit cóhoạt tính sinh học đa dạng: kháng virus [12],chống huyết khối [21], kháng viêm và khángung thư [1, 5] . Hoạt tính sinh học của fucoidanphụ thuộc vào nguồn phân lập. Fucoidan từrongnâuthuộchọhomovàheteropolysaccharide, có thành phần chính làcác gốc fucose được sulphat hóa tại vị trí C2 vàC4 và liên kết với nhau bởi các liên kết (1→3)và/hoặc (1→4). Ngoài ra trong phân tử fucoidancũng có mặt một lượng nhỏ galactose, mannose,xylose, glucose, glucuronic acid [3, 8].Fucoidan có hoạt tính dược học đa dạng, tuynhiên chúng vẫn chưa được sử dụng thành côngtrong việc chế tạo thuốc do khối lượng phân tửlớn và cấu trúc không rõ ràng [19]. Việc tạo racác oligosaccharide khối lượng phân tử thấp sẽgiúp giải quyết được vấn đề này. Gần đây, cũngđã có một số nghiên cứu về sử dụng enzymelàm công cụ bẻ ngắn mạch fucoidan thành cácoligosaccharide theo định hướng sử dụng trongdược học [2, 9]. Enzyme phân cắt fucoidan baogồm 2 nhóm: fucoidanase và α-L-fucoidanase.Các enzyme này cắt các liên kết glycosidic đặchiệu trong chuỗi polysaccharide, do đó bảo tồnđược các nhóm sulphate, là nhóm có vai tròquan trọng đối với hoạt tính sinh học củafucoidan [15].186Cho đến nay, enzyme phân cắt fucoidan đãđược tìm thấy ở một số sinh vật biển: vi khuẩn[7, 10, 19], nấm [16, 20] và động vật thân mềm[6, 18]. Tuy nhiên, fucoidanase từ các sinh vậtnày có hoạt tính thấp. Việc tìm kiếm cácfucoidanase mới và nghiên cứu các đặc điểmđộng học của chúng sẽ giúp làm rõ mối quan hệgiữa cấu trúc và hoạt tính sinh học của fucoidancũng như phát triển công nghệ sản xuất cácfuco-oligosaccharide có hoạt tính sinh học quantrọng. Một trong những khó khăn chính trongnghiên cứu fucoidanase hiện nay là chưa cóphương pháp đơn giản và nhạy để xác định hoạttính xúc tác của chúng. Tất cả các phương phápnghiên cứu hoạt tính thủy phân của enzymehiện nay đều chưa phù hợp với fucoidanase[17]. Hoạt tính fucoidanase có thể được xácđịnh bằng phương pháp đo độ nhớt đặc hiệu chocác enzyme phân cắt nội phân tử [11], phươngpháp đo sự gia tăng hàm lượng đường khử theoNelson et al. (1962) [14] hoặc sử dụng 3,5dinitrosalicylic acid (DNS) 13] hoặc phươngpháp pháp điện di (C-PAGE) [4].Phân lập và sàng lọc vi sinh vật có khả năngsinh enzyme phân cắt fucoidan là bài toán quantrọng trong quá trình tìm kiếm các enzyme mới.Để sàng lọc hoạt tính fucoidanase trên mộtlượng lớn vi sinh vật, cần phát triển phươngpháp đơn giản, có khả năng sàng lọc mẫu trongthời gian ngắn, chi phí thấp và phù hợp với điềuNghiên cứu sử dụng đĩa thạch fucoidan để sàng lọc và xác định hoạt tính fucoidanasekiện phòng thí nghiệm. Do đó, trong nghiên cứunày, chúng tôi đã sử dụng phương pháp đĩathạch fucoidan để sàng lọc hoạt tínhfucoidanase của vi sinh vật.VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨUCác chủng vi sinh vật biển được phân lập từcác nguồn sinh học khác nhau được sử dụng đểsàng lọc hoạt tính bẻ ngắn mạch fucoidan từ cảhai loại rong Sargassum mcclurei và Sargassumpolycystum.Phân lập vi sinh vật biểnVi sinh vật từ các nguồn sinh học khácnhau: cầu gai, ruột hải sâm, sò và ốc biển đượcphân lập trên 3 loại môi trường: (1) có thànhphần nước biển 500 ml, nước cất 500 ml,K2HPO40,2 g, MgSO4 0,05 g, glucose 1g, pepton 5 g, cao nấm men 1 g, agar 20 g, điềuchỉnh pH 7-7,2); (2) môi trường 1 bổ sungfucoidan 0,1% và (3) chỉ chứa fucoidan(1g/100ml nước biển) và agar (2 g/100ml). Cácmẫu được ủ ở 30oC cho đến khi thấy xuất hiệnkhuẩn lạc vi sinh vật thì tiến hành làm thuầntrên môi trường (1). Các chủng sạch được giữtrong môi trường bán rắn có thành phần tươngtự như môi trường (1) với agar 0,3%.Sàng lọc ...
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Nghiên cứu sử dụng đĩa thạch Fucoidan để sàng lọc và xác định hoạt tính Fucoidanase từ vi sinh vật biểnTAP CHI SINH HOC2016,Thi38(2):186-191NguyenThuanet al.DOI:10.15625/0866-7160/v38n2.7112NGHIÊN CỨU SỬ DỤNG ĐĨA THẠCH FUCOIDAN ĐỂ SÀNG LỌCVÀ XÁC ĐỊNH HOẠT TÍNH FUCOIDANASE TỪ VI SINH VẬT BIỂNNguyễn Thị Thuận*, Cao Thị Thúy Hằng, Huỳnh Hoàng Như Khánh,Trương Hải Bằng, Phạm Đức Thịnh, Trần Thị Thanh Vân, Bùi Minh LýViện Nghiên cứu và Ứng dụng công nghệ Nha Trang, Viện Hàn lâm KH & CN Việt Nam,*nguyenthuan@nitra.vast.vnTÓM TẮT: Khả năng sinh enzyme phân cắt fucoidan của vi sinh vật biển được sàng lọc bởiphương pháp đĩa thạch fucoidan. Vi sinh vật được nuôi cấy trên đĩa thạch chứa fucoidan, chủng vikhuẩn có hoạt tính là khi vùng nuôi cấy không bị nhuộm bởi hexadecyltrimethylammoniumbromide (cetavlon) 1% (w/v) mà hình thành vùng trong suốt. Trong số 44 chủng vi sinh vật đượcphân lập từ hải sâm, sò ốc và cầu gai, 2 chủng có khả năng sinh enzyme phân cắt fucoidan từ cảhai loại rong Sargassum mcclurei và Sargassum polycystum, 4 chủng sinh enzyme chỉ phân cắtfucoidan của một loại rong biển. Tất cả các chủng vi khuẩn này đều sinh enzyme phân cắt fucoidannội bào.Từ khóa: Sargassum mcclurei, Sargassum polycystum, fucoidan, fucoidanase, vi sinh vật biển.MỞ ĐẦUFucoidan là nhóm sulphat polysacarit cóhoạt tính sinh học đa dạng: kháng virus [12],chống huyết khối [21], kháng viêm và khángung thư [1, 5] . Hoạt tính sinh học của fucoidanphụ thuộc vào nguồn phân lập. Fucoidan từrongnâuthuộchọhomovàheteropolysaccharide, có thành phần chính làcác gốc fucose được sulphat hóa tại vị trí C2 vàC4 và liên kết với nhau bởi các liên kết (1→3)và/hoặc (1→4). Ngoài ra trong phân tử fucoidancũng có mặt một lượng nhỏ galactose, mannose,xylose, glucose, glucuronic acid [3, 8].Fucoidan có hoạt tính dược học đa dạng, tuynhiên chúng vẫn chưa được sử dụng thành côngtrong việc chế tạo thuốc do khối lượng phân tửlớn và cấu trúc không rõ ràng [19]. Việc tạo racác oligosaccharide khối lượng phân tử thấp sẽgiúp giải quyết được vấn đề này. Gần đây, cũngđã có một số nghiên cứu về sử dụng enzymelàm công cụ bẻ ngắn mạch fucoidan thành cácoligosaccharide theo định hướng sử dụng trongdược học [2, 9]. Enzyme phân cắt fucoidan baogồm 2 nhóm: fucoidanase và α-L-fucoidanase.Các enzyme này cắt các liên kết glycosidic đặchiệu trong chuỗi polysaccharide, do đó bảo tồnđược các nhóm sulphate, là nhóm có vai tròquan trọng đối với hoạt tính sinh học củafucoidan [15].186Cho đến nay, enzyme phân cắt fucoidan đãđược tìm thấy ở một số sinh vật biển: vi khuẩn[7, 10, 19], nấm [16, 20] và động vật thân mềm[6, 18]. Tuy nhiên, fucoidanase từ các sinh vậtnày có hoạt tính thấp. Việc tìm kiếm cácfucoidanase mới và nghiên cứu các đặc điểmđộng học của chúng sẽ giúp làm rõ mối quan hệgiữa cấu trúc và hoạt tính sinh học của fucoidancũng như phát triển công nghệ sản xuất cácfuco-oligosaccharide có hoạt tính sinh học quantrọng. Một trong những khó khăn chính trongnghiên cứu fucoidanase hiện nay là chưa cóphương pháp đơn giản và nhạy để xác định hoạttính xúc tác của chúng. Tất cả các phương phápnghiên cứu hoạt tính thủy phân của enzymehiện nay đều chưa phù hợp với fucoidanase[17]. Hoạt tính fucoidanase có thể được xácđịnh bằng phương pháp đo độ nhớt đặc hiệu chocác enzyme phân cắt nội phân tử [11], phươngpháp đo sự gia tăng hàm lượng đường khử theoNelson et al. (1962) [14] hoặc sử dụng 3,5dinitrosalicylic acid (DNS) 13] hoặc phươngpháp pháp điện di (C-PAGE) [4].Phân lập và sàng lọc vi sinh vật có khả năngsinh enzyme phân cắt fucoidan là bài toán quantrọng trong quá trình tìm kiếm các enzyme mới.Để sàng lọc hoạt tính fucoidanase trên mộtlượng lớn vi sinh vật, cần phát triển phươngpháp đơn giản, có khả năng sàng lọc mẫu trongthời gian ngắn, chi phí thấp và phù hợp với điềuNghiên cứu sử dụng đĩa thạch fucoidan để sàng lọc và xác định hoạt tính fucoidanasekiện phòng thí nghiệm. Do đó, trong nghiên cứunày, chúng tôi đã sử dụng phương pháp đĩathạch fucoidan để sàng lọc hoạt tínhfucoidanase của vi sinh vật.VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨUCác chủng vi sinh vật biển được phân lập từcác nguồn sinh học khác nhau được sử dụng đểsàng lọc hoạt tính bẻ ngắn mạch fucoidan từ cảhai loại rong Sargassum mcclurei và Sargassumpolycystum.Phân lập vi sinh vật biểnVi sinh vật từ các nguồn sinh học khácnhau: cầu gai, ruột hải sâm, sò và ốc biển đượcphân lập trên 3 loại môi trường: (1) có thànhphần nước biển 500 ml, nước cất 500 ml,K2HPO40,2 g, MgSO4 0,05 g, glucose 1g, pepton 5 g, cao nấm men 1 g, agar 20 g, điềuchỉnh pH 7-7,2); (2) môi trường 1 bổ sungfucoidan 0,1% và (3) chỉ chứa fucoidan(1g/100ml nước biển) và agar (2 g/100ml). Cácmẫu được ủ ở 30oC cho đến khi thấy xuất hiệnkhuẩn lạc vi sinh vật thì tiến hành làm thuầntrên môi trường (1). Các chủng sạch được giữtrong môi trường bán rắn có thành phần tươngtự như môi trường (1) với agar 0,3%.Sàng lọc ...
Tìm kiếm theo từ khóa liên quan:
Tạp chí khoa học Tạp chí sinh học Vi sinh vật biển Hoạt tính Fucoidanase Phương pháp đĩa thạch fucoidanGợi ý tài liệu liên quan:
-
6 trang 300 0 0
-
Thống kê tiền tệ theo tiêu chuẩn quốc tế và thực trạng thống kê tiền tệ tại Việt Nam
7 trang 272 0 0 -
5 trang 234 0 0
-
10 trang 214 0 0
-
Khảo sát, đánh giá một số thuật toán xử lý tương tranh cập nhật dữ liệu trong các hệ phân tán
7 trang 209 0 0 -
8 trang 209 0 0
-
Quản lý tài sản cố định trong doanh nghiệp
7 trang 208 0 0 -
6 trang 205 0 0
-
Khách hàng và những vấn đề đặt ra trong câu chuyện số hóa doanh nghiệp
12 trang 203 0 0 -
9 trang 167 0 0
-
19 trang 166 0 0
-
8 trang 164 0 0
-
Quan niệm về tự do của con người trong triết lý giáo dục của chủ nghĩa hiện sinh
11 trang 155 0 0 -
8 trang 152 0 0
-
15 trang 148 0 0
-
15 trang 135 0 0
-
11 trang 131 0 0
-
Tái cơ cấu kinh tế - lý luận và thực tiễn
8 trang 130 0 0 -
8 trang 125 0 0
-
12 trang 122 0 0