Nghiên cứu xác định các đoạn mã vạch ADN (DNA barcode) cho loài Áo cộc (Liriodendron chinense) phục vụ giám định loài

Đề tài này nghiên cứu về việc xác định các đoạn mã vạch ADN cho loài Áo cộc phục vụ giám định loài là cần thiết. ADN tổng số được phân lập từ lá cây Áo cộc. Các đoạn DNA barcode (rbcL, matK và trnH-psbA) được nhân bản từ ADN tổng số của cây bằng kỹ thuật PCR. Sản phẩm PCR chỉ ra rằng các băng thu được có kích thước giống với kích thước dự kiến, sau đó sản phẩm PCR được xác định trình tự nucleotide. Mời các bạn cùng tham khảo!
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Nghiên cứu xác định các đoạn mã vạch ADN (DNA barcode) cho loài Áo cộc (Liriodendron chinense) phục vụ giám định loài Công nghệ sinh học & Giống cây trồng NGHIÊN CỨU XÁC ĐỊNH CÁC ĐOẠN MÃ VẠCH ADN (DNA BARCODE) CHO LOÀI ÁO CỘC (Liriodendron chinense) PHỤC VỤ GIÁM ĐỊNH LOÀI Bùi Thị Mai Hương1, Nguyễn Văn Phong1 1 Trường Đại học Lâm nghiệp TÓM TẮT Áo cộc (Liriodendron chinense) là loài cây được đánh giá có giá trị kinh tế với cây làm cảnh, gỗ tốt. Hiện nay các loài này đang bị đe dọa và đã được liệt kê trong danh sách các loài thực vật có nguy cơ tuyệt chủng vì hiệu quả sinh sản thấp. Vì vậy, việc xác định các đoạn mã vạch ADN cho loài Áo cộc phục vụ giám định loài là cần thiết. ADN tổng số được phân lập từ lá cây Áo cộc. Các đoạn DNA barcode (rbcL, matK và trnH-psbA) được nhân bản từ ADN tổng số của cây bằng kỹ thuật PCR. Sản phẩm PCR chỉ ra rằng các băng thu được có kích thước giống với kích thước dự kiến, sau đó sản phẩm PCR được xác định trình tự nucleotide. Kết quả phân tích trình tự đã chỉ ra, đoạn rbcL có 658 nucleotide, đoạn matK có 543 nucleotide và đoạn trnH-psbA có 382 nucleotide. Các trình tự này sau đó được xử lý trên ngân hàng gen quốc tế NCBI đã tìm ra sự khác biệt với các loài Áo cộc khác: đoạn gen matK tương đồng 100% với loài Liriodendron chinense, đoạn gen rbcL tương đồng 99,1% với loài Liriodendron chinense, đoạn gen trnH-psbA tương đồng 92,4% với loài Liriodendron chinenses. Với 3 đoạn gen matK, rbcL, trnH-psbA, nghiên cứu cho thấy rằng sử dụng đoạn gen trnH-psbA làm mã vạch ADN để giám định loài Áo cộc ở Việt Nam là tốt nhất. Từ khóa: Áo cộc, cây phát sinh, giám định loài, mã vạch ADN. 1. ĐẶT VẤN ĐỀ phổ biến nhanh chóng của loài (Phan, K.L., Áo cộc (L. chinense) được phân bố ở vùng 2015). Do đó, việc nghiên cứu xác định các núi có độ cao 450 m đến 1800 m ở miền Nam đoạn mã vạch ADN cho loài Áo cộc phục vụ Trung Quốc và miền Bắc Việt Nam. Là một giám định loài là cần thiết và cấp bách cho việc trong số những cây có bóng mát lớn, lá cây có định danh và bảo tồn loài Áo cộc tại Việt Nam. hình dạng như những chiếc áo phông, trong Xác định các đoạn mã vạch ADN là một mùa thu sắc lá chuyển từ xanh sang vàng, hoa phương pháp định danh, sử dụng một đoạn màu vàng có hình dạng giống như hoa tulip. ADN chuẩn ngắn nằm trong hệ gen của sinh Áo cộc là một trong mười sáu kiểu che phủ vật đang nghiên cứu để phục vụ giám định rừng, mức độ thống trị của loài này đã tạo ra sự loài, mang lại hiệu quả cao trong thời gian khác biệt giữa các cộng đồng sinh thái không ngắn, góp phần không nhỏ vào sự định danh và những thế nó còn có giá trị như một nguồn mật bảo tồn các loài thực vật trên thế giới. Phương hoa để sản xuất mật ong, một nguồn thực phẩm pháp xác định các đoạn mã vạch ADN là một tự nhiên, một loài cây cảnh cho bóng mát lớn công cụ hữu hiệu bổ trợ cho phương pháp phân tại các đô thị (AGM Plants - Ornamental; Xia loại dựa vào hình thái (Aron J.F. et.al.,2008). Nianhe et.al., 2012). Gỗ của loài được sử dụng Ở động vật, đoạn mã vạch ADN được sử dụng trong một loạt sản phẩm thiết yếu như: nội cho phần lớn các loài là đoạn gen ở ty thể thất, pallet, khung xây dựng (Xia Nianhe et.al., cytochrome C oxidase (CO1) (Anders R., 2012). Ngoài ra, chiết xuất hóa học từ gỗ hoặc 2012; Alvarez I.W.J.F., 2003). Ở thực vật, tốc lá đã được chứng minh hữu ích có tác dụng độ tiến hóa của các đoạn gen ty thể không chống khối u, chống đông máu cho các loài nhanh như ở động vật do đó đoạn CO1 không động vật ăn cỏ và các alcaloid kháng khuẩn được sử dụng. Thay vào đó, một số gen lục lạp (Xia Nianhe et.al., 2012). Áo cộc đang bị đe như matK, rbcL; gen vùng nhân như ITS, ITS2; dọa và đã được liệt kê trong danh sách các loài vùng xen TrnH-psbA, psbK-psbI được sử dụng thực vật có nguy cơ tuyệt chủng vì hiệu quả kết hợp để giám định các loài thực vật (Chase sinh sản thấp, tỷ lệ nảy mầm của hạt thấp, điều M.W et al., 2005; Chen S.Y.H et al., 2010; này ảnh hưởng rất lớn tới việc nhân giống và Ford C.S et al., 2009; Kress J.W et al.,2005; 12 TẠP CHÍ KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ LÂM NGHIỆP SỐ 5 - 2020 Công nghệ sinh học & Giống cây trồng Von Crautlein M.K.H et al., 2011). loại, giám định và xác định mối quan hệ di Trong nghiên cứu này, tiến hành lựa chọn truyền, từ đó góp phần nâng cao hiệu quả bảo ba đoạn trình tự ADN để sử dụng làm mã vạch tồn và phát triển loài Áo cộ ...