Nhận dạng và mô tả đặc điểm hệ Glycoprotein huyết thanh bệnh nhân hội chứng mạch vành cấp

Bài viết tập trung nghiên cứu nhận dạng hệ glycoprotein trong huyết thanh của bệnh nhân ACS và người bình thường khỏe mạnh bằng sắc ký ái lực Concanavalin A, điện di SDS-PAGE và xác định protein bằng hệ thống sắc ký lỏng nano đa chiều kết nối với khối phổ liên tiếp (2D-NanoLC-ESI-MS/MS). Ngoài ra, đặc điểm về chức năng sinh học của glycoprotein được phân loại dựa trên cơ sở dữ liệu PANTHER của Viện Tin sinh học châu Âu.
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Nhận dạng và mô tả đặc điểm hệ Glycoprotein huyết thanh bệnh nhân hội chứng mạch vành cấpTAPCHISINHHOC2015,37(1se):151157 DOI:10.15625/08667160/v37n1se. NHẬNDẠNGVÀMÔTẢĐẶCĐIỂMHỆGLYCOPROTEIN HUYẾTTHANHBỆNHNHÂNHỘICHỨNGMẠCHVÀNHCẤP ĐỗHữuChí1,NguyễnTiếnDũng1,PhạmĐứcĐan1,LêThịBíchThảo1, ĐỗDoãnLợi2,NguyễnBíchNhi1,PhanVănChi1* 1 ViệnCôngnghệsinhhọc,ViệnHànlâmKH&CNViệtNam,*chi@ibt.ac.vn 2 ViệnTimmạch,BệnhviệnBạchMai TÓMTẮT:Nhồimáucơ timcấpđượcxemlàbiếnchứngnguyhiểmsaucùngcủahộichứngmạch vànhcấpvàthườngxảyrađộtngột,nằmtrongnhữngtrườnghợpcấpcứutốikhẩn,cótỷlệ tửvong vàđểlạidichứngrấtcao.Vìvậy,nghiêncứutìmkiếmcácchỉthịphântửđặchiệuhơnchoACSđể ứngdụngrộngrãitrongchẩnđoánrấtcầnthiết.Tronghuyếtthanh,cácglycoproteinthamgiavào nhiềuquátrìnhsinhhọcvàcótiềmnănglàmchỉ thị chochẩnđoánvàđiềutrị.Trongnghiêncứunày, chúngtôitiếnhànhnhậndạnghệ glycoproteintronghuyếtthanhcủabệnhnhânACSvàngườibình thườngkhỏemạnhbằngcáckỹ thuậtproteomicsnhư sắckýáilựcConcanavalinA,điệndiSDS PAGEvà hệ thống sắc kýlỏng nano đa chiều kết nối với khối phổ liên tiếp(2DNanoLCESI MS/MS).Glycoproteinđượcphântíchbằngcáccôngcụ tinsinhhọcgồmphầnmềmPEAKv6.0và PANTHER.Kếtquả,133glycoprotein ởmẫunhồimáucơ timcấp,162glycoprotein ởmẫuđauthắt ngựckhông ổnđịnhvà195glycoprotein ở ngườibìnhthườngkhỏemạnhđãđượcnhậndiện.Chức năngsinhhọccủacácglycoproteincũngđượcphânloạithànhcácnhómnhưxúctác,điềuhoàenzyme, thụthể,cấutrúc,vậnchuyểnvàliênkết.Đángchúý,trongdữliệuphântíchphổ củachúngtôiphát hiệncả bachuỗicủaFibrinogen(alpha,beta,gamma)tronghuyếtthanhb ệnhnhânnhồimáucơ tim cấpvàđauthắtngựckhôngổnđịnhmàkhôngđượcpháthiệnởngườibìnhthườngkhỏemạnh. Từkhóa:Hộichứngmạchvànhcấp,glycoprotein,proteomics,NanoLCMS/MS.MỞĐẦU thư.Trongđó,mộtsốproteintrướcđâyđãmô tả như ứngviênchỉ thị tiềmnăngchobệnh Glycosylhóalàmtăngsự đadạngcủahệ ung thư phổi trong huyết thanh nhưproteintớimộtmứcđộ khôngmộtbiếnđổi haptoglobin (HP), interalphatrypsin inhibitorsaudịchmãnàosánhkịp.Vaitròquantrọng heavy chain 4 (ITIH4), complement C3củaglycosylhóađãđượcđềcậptừcácnghiên precursor và leucinerich alpha2glycoproteincứu về cấu trúc protein, vị trí glycosyl hóa, cũng được phát hiện [5]. Với phương pháptínhtanprotein,tínhkhángnguyênvàhoạttính tiếpcậntươngtự,hệglycoproteintrongnước chứcnăngcủaprotein,thờigianbánhủy(half tiểubệnhnhânungthư bàngquangcũngđãlife) của thuốc cũng như tương tác giữa tế đượcxácđịnh[18].Rõràng,việcxáclậpmốibàotế bào [11]. Trong huyết thanh, liênquangiữacấutrúcpolysaccharidevàchứcglycoproteinthamgiavàonhiềuquátrìnhsinh năngcủacácglycoprotein,tìmkiếmcácchỉthịhọcvàcógiátrịlâmsàngchobệnhnhântrong sinhhọc(biomarker)chochẩnđoánvàđiềutrịchuẩnđoánvàđiềutrị[5].Từlâu,ngườitađã vàcơ chế phântử màquátrìnhglycosylhóabiếtrằngsự thay đổicủaquátrìnhglycosyl protein ảnhhưởng đếncơ chế bệnhsinhlàhóatrongtế bàoliênquanđếncơ chế bệnh nhữnglĩnhvựcnghiêncứuquantrọng[3].Đểsinhvàquátrìnhtiếntriểntự nhiêncủaung đạtđượcnhữngmụctiêunày,sự pháttriển thư (oncogenesis)[1].Sử dụngphươngpháp củacáckỹthuậtcóđộnhạycaochophântíchtiếp cận bằng sắc ký ái lực và NanoLC glycoproteinlàhếtsứccầnthiết.MS/MS,Heo(2007)[5]đãnhậndạngvàchọnlọcđược38proteincóliênquanđếnbệnhung 151 DoHuuChietal. Hộichứngmạchvànhcấp(Acutecoronary điều kiện cho những nghiên cứu vềsyndrome, ACS) là một thuật ngữ được sử proteome/subproteome nhằm khai thác, tìmdụngkhixảyratrạngtháilưulượngmáucung ...