Tiềm năng sinh Alginate lyase của các chủng vi khuẩn phân lập ở vùng biển Việt Nam

Khả năng sinh enzyme alginate lyase của các chủng vi khuẩn biển được sàng lọc bằng phương pháp đĩa thạch alginate nhuộm bởi gram’s iodine. Trong số 197 chủng vi khuẩn phân lập từ bọt biển, san hô mềm và rong biển, 56% chủng thể hiện hoạt tính phân cắt alginate từ rong Sargassum mcclurei.
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Tiềm năng sinh Alginate lyase của các chủng vi khuẩn phân lập ở vùng biển Việt Nam TAP CHI SINH HOC 2019, 41(2se1&2se2): 273–279 DOI: 10.15625/0866-7160/v41n2se1&2se2.14135 POTENTAL PRODUCE ALGINATE LYASE BY BACTERIA STRAINS ISOLATED FROM COASTAL REGIONS IN VIETNAM Nguyen Thi Thuan*, Tran Nguyen Ha Vy, Vo Thi Dieu Trang, Cao Thi Thuy Hang, Vo Mai Nhu Hieu, Nguyen Ngoc Linh, Nguyen Dinh Thuat, Tran Thi Thanh Van Nha Trang Institute of Technology Research and Application, VAST, Vietnam Received 6 August 2019, accepted 29 September 2019ABSTRACT The ability to produce the alginate lyase enzyme of marine bacteria strains was screened by alginate agar plate stained with gram’s iodine. Among 197 strains of bacteria isolated from sponges, soft corals and seaweeds, 56% of strains showed alginate - cleavage activity on alginate from Sargassum mcclurei. Total of eleven active bacterial strains were selected to identify the characteristic of subspecies. The sequence comparision of 16S rRNA gene showed that nine strains belong to the genus Bacillus and two strains belong to the genus Fictibacillus. Keywords: Bacillus, alginate, alginate lyase, gram’s iodine, marine bacteria.Citation: Nguyen Thi Thuan, Tran Nguyen Ha Vy, Vo Thi Dieu Trang, Cao Thi Thuy Hang, Vo Mai Nhu Hieu,Nguyen Ngoc Linh, Nguyen Dinh Thuat, Tran Thi Thanh Van, 2019. Potental produce alginate lyase by bacteriastrains isolated from coastal regions in Vietnam. Tap chi Sinh hoc, 41(2se1&2se2): 273–279.https://doi.org/10.15625/0866-7160/v41n2se1&2se2.14135.* Corresponding author email: nguyenthuan@nitra.vast.vn©2019 Vietnam Academy of Science and Technology (VAST) 273 TAP CHI SINH HOC 2019, 41(2se1&2se2): 273–279 DOI: 10.15625/0866-7160/v41n2se1&2se2.14135 TIỀM NĂNG SINH ALGINATE LYASE CỦA CÁC CHỦNG VI KHUẨN PHÂN LẬP Ở VÙNG BIỂN VIỆT NAM Nguyễn Thị Thuận*, Trần Nguyễn Hà Vy, Võ Thị Diệu Trang, Cao Thị Thúy Hằng, Võ Mai Như Hiếu, Nguyễn Ngọc Linh, Nguyễn Đình Thuất, Trần Thị Thanh Vân Viện Nghiên cứu và Ứng dụng công nghệ Nha Trang, Viện Hàn lâm Khoa học và Công nghệ Việt Nam Ngày nhận bài 6-8-2019, ngày chấp nhận 29-9-2019TÓM TẮT Khả năng sinh enzyme alginate lyase của các chủng vi khuẩn biển được sàng lọc bằng phương pháp đĩa thạch alginate nhuộm bởi gram’s iodine. Trong số 197 chủng vi khuẩn phân lập từ bọt biển, san hô mềm và rong biển, 56% chủng thể hiện hoạt tính phân cắt alginate từ rong Sargassum mcclurei. 11 chủng vi khuẩn có hoạt tính cao nhất được chọn lọc để xác định đặc trưng phân loài. Kết quả so sánh trình tự gen 16S rRNA cho thấy có 9 chủng vi khuẩn biển thuộc chi Bacillus và 2 chủng vi khuẩn biển thuộc chi Fictibacillus. Từ khóa: Bacillus, alginate, alginate lyase, gram’s iodine, vi khuẩn biển.*Địa chỉ liên hệ email: nguyenthuan@nitra.vast.vnMỞ ĐẦU dược, nghiên cứu cấu trúc cũng như làm tăng Alginate là polysaccharide chủ yếu được hoạt tính sinh học của chúng (Chen et al.,chiết xuất từ rong nâu (chiếm đến 40% khối 2017; Zhu et al., 2016).lượng rong khô), được cấu tạo từ β-D- Alginate oligosaccharide được điều chếmannuronate (M) và α-L- guluronate (G). Các bằng các phương pháp vật lý, hóa học hoặcgốc uronate này sắp xếp thành các block khác enzyme. Trong đó phương pháp enzyme đượcnhau: poly β-D- mannuronate (poly M), poly ưu tiên sử dụng do tính đặc hiệu và hiệu suấtα-L- guluronate G (poly G) và heteropolymer cao, thân thiện với môi trường. Alginate lyase(polyMG) (Lee et al., 2013). Alginate đặc biệt được phân lập từ các nguồn khác nhau như vithu hút sự quan tâm của các nhà nghiên cứu khuẩn biển, động vật biển và một số loại đãtrong các lĩnh vực thực phẩm, hóa học, y được xác định đặc tính xúc tác (Chen et al.,dược, nông nghiệp bởi trữ lượng lớn (hơn 2018). Dựa trên tính đặc hiệu cơ chất alginate30.000 tấn/năm) (Hay et al., 2013) và các hoạt lyase được chia thành hai loại chính: enzymetính sinh học đa dạng của polymer cũng như đặc hiệu block G (polyG lyase EC 4.2.2.11)oligosaccharide như chống oxy hóa, kích thích và enzyme đặc hiệu block M (polyM lyase ECtăng trưởng, kháng viêm,… (Falkeborg et al., ...