Tiểu luận: Các trình tự ADN không ghi mã lặp lại liên tiếp nhau

ADN không ghi mã lặp lại kế tiếp (tandem repeats non coding) là những trình tự ADN lặp đi lặp lại liên tiếp nhau và không mã hóa thông tin di truyềnĐoạn lặp đơn giản
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Tiểu luận: Các trình tự ADN không ghi mã lặp lại liên tiếp nhau5/11/2010 CÁC TRÌNH TỰ ADN KHÔNG GHI MÃ LẶP LẠI LIÊN TIẾP NHAU Giảng viên: TS. Đinh Đoàn Long Nhóm thực hiện: Trần Thị Thanh Huyền Lê Thanh Hương Nguyễn Thành Phương Đào Văn Quý K11 – CNKHTN Sinh họcNỘI DUNG Giới thiệu chung Phân loại Chức năng Đặc điểm Ứng dụngGIỚI THIỆU CHUNG − ADN không ghi mã lặp lại kế tiếp (tandem repeats non coding) là những trình tự ADN lặp đi lặp lại liên tiếp nhau và không mã hóa thông tin di truyền Đoạn lặp đơn giản Đoạn lặp phức tạp − Xuất hiện thành khối và thường nằm ở một số vị trí xác định trên nhiễm sắc thểGIỚI THIỆU CHUNGPHÂN LOẠI ADN ADN ADN satellite minisatellite microsatellite hay ADN vệ hay ADN hay ADN vi tinh tiểu vệ tinh vệ tinhPHÂN LOẠI 1. SatelliteĐặc điểm:− Đơn vị lặp 10 đến vài trăm nucleotide, kích thước khối satellite có thể lên đến vài Mb− Phân bố chủ yếu ở vùng dị nhiễm sắc gần tâm động của NST hoặc vùng đầu mút NSTPHÂN LOẠI 1. Satellite Type Size of repeat unit Location (bp) α (alphoid DNA) All chromosomes 171 β Centromeres of 68 chromosomes 1, 9, 13, 14, 15, 21, 22 and Y Centromeres and other regions in Satellite 1 25-48 heterochromatin of most chromosomes Satellite 2 5 Most chromosomes Satellite 3 5 Most chromosomesPHÂN LOẠI 1. Satellite Chức năng: - Chức năng cấu trúc: ví dụ như giúp khởi đầu sự bắt cặp của các NST tương đồng trong quá trình giảm phân.PHÂN LOẠI 2. Minisatellite Đặc điểm: − ADN lặp lại ngẫu nhiên đa hình (Variable Number Tandem Repeat- VNTR) − Trình tự lặp 10 đến 100bp, dài 1-5kb thậm chí lên tới 20 kb − Trình tự lặp đa dạng, phân bố tập trung thành cụm hoặc rải rác trong genome − Giàu G-C,PHÂN LOẠI 2. MinisatellitePHÂN LOẠI 2. Minisatellite ADN Minisatellite được chia làm 2 loại: − ADN tiểu vệ tinh đa vị trí (multi-locus minisatellite): Hiện diện rải rác tại nhiều vị trí trên bộ gen − ADN tiểu vệ tinh đơn vị trí (single-locus minisatelite): chỉ có tại một vị trí trên bộ gen Nhiều tiểu vệ tinh đơn vị trí có giá trị dấu ấn ADNPHÂN LOẠI 2. MinisatellitePHÂN LOẠI 2. MinisatellitePHÂN LOẠI 2. Microsatellite − Số lượng base trong một đơn vị lặp là rất ít 1-6 base, thường lặp lại thành đoạn 200 base − Chúng phân bố một cách rất rải rác trong genome, số lượng rất lớn, rất khác nhau giữa các cá thể − Về mặt thuật ngữ: Single Sepuence Repeat (SSRs) hay Short Tandem Repeat (STRs)PHÂN LOẠI 3. Microsatellite − Số lượng ADN microsatellite là rất lớn trong genome, rất khác nhau giữa các cá thể, có thể được nhân lên một cách nhanh chóng bằng phản ứng PCR − Một vài ví dụ:  Mononucleotide SSR (A)11: AAAAAAAAAAA  Dinucleotide SSR (GT)6: GTGTGTGTGTGT  Trinucleotide SSR (CTG)4: CTGCTGCTGCTG  Tetranucleotide SSR (ACTC)4: ACTCACTCACTCACTCPHÂN LOẠI 3. Microsatellite Chức năng của Mini và Microsatellite− Mini và Microsatellite phân bố một cách rải rác trong hệ gen, chúng có thể nằm trong gen. Do dó chúng ít nhiều ảnh hưởng tới hoạt động của gen− Một số trường hợp, sự mất hoặc thêm đơn vị đoạn lặp làm thay đổi hoạt động của PromotorCƠ CHẾ HÌNH THÀNH Trao đổi chéo không cânCƠ CHẾ HÌNH THÀNH Trượt lỗi của ADN polymeraseỨNG DỤNG Xác định mối quan hệ họ hàng Pháp Y: Truy tìm tội phạm, hài cốt liệt sĩ. Chẩn đoán & phát hiện bệnh. Xác định đặc trưng cá thể. ...