Xác định đa hình đơn nucleotide (SNP) của gen APC ở bệnh nhân mắc bệnh đa polyp tuyến gia đình

Hội chứng đa polyp tuyến gia đình (Familial adenomatous polyposis-FAP) là bệnh di truyền đặc trưng bởi sự hiện diện rất nhiều polyp tuyến ở đại tràng, thường trên 100 polyp. Ứng dụng kỹ thuật giải trình tự xác định các SNP ở gen APC trên bệnh nhân FAP.
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Xác định đa hình đơn nucleotide (SNP) của gen APC ở bệnh nhân mắc bệnh đa polyp tuyến gia đìnhY Học TP. Hồ Chí Minh * Tập 21 * Số 3 * 2017 Nghiên cứu Y học XÁC ĐỊNH ĐA HÌNH ĐƠN NUCLEOTIDE (SNP) CỦA GEN APC Ở BỆNH NHÂN MẮC BỆNH ĐA POLYP TUYẾN GIA ĐÌNH Nguyễn Thị Băng Sương*,**, Nguyễn Hữu Huy**, Lê Minh Khôi *,**, Nguyễn Trung Tín*,**, Nguyễn Hoàng Bắc*,**TÓM TẮT Mở đầu: Hội chứng đa polyp tuyến gia đình (Familial adenomatous polyposis-FAP) là bệnh di truyền đặctrưng bởi sự hiện diện rất nhiều polyp tuyến ở đại tràng, thường trên 100 polyp. Theo Sheng và cộng sự, 100%bệnh nhân FAP không được điều trị sẽ dẫn đến ung thư đại tràng ở tuổi 35-40. Nguyên nhân gây nên FAP đượcxác định là do đột biến gen APC. Các đa hình ở gen APC nhạy cảm với ung thu. Tuy nhiên mối liên hệ giữa cácđa hình gen APC và nguy cơ ung thư đại trực tràng vẫn chưa được biết rõ. Mục tiêu: Ứng dụng kỹ thuật giải trình tự xác định các SNP ở gen APC trên bệnh nhân FAP. Đối tượng - Phương pháp nghiên cứu: 63 bệnh nhân có triệu chứng đa polyp tham gia nghiên cứu. Chúngtôi sử dụng kỹ thuật giải trình tự để phát hiện SNP ở gen APC. Kết quả: Trong nghiên cứu này, chúng tôi đã tìm thấy 10 SNP ở gen APC. Trong đó 7/10 SNP không làmthay đổi acid amin nên các SNP này không làm thay đổi kiểu hình. Tuy nhiên, có 3 SNP có ảnh hưởng làm thayđổi acid amin đó là SNP rs201764637 (p.Arg106His), SNP rs459552 (p.Val1822Asp) và SNP rs534228737(p.Ile2231Phe). Trong số đó, SNP rs534228737 (p.Ile2231Phe) có nguy cơ cao gây ung thư đại trực tràng Kết luận: Chúng tôi phát hiện 3 SNP làm thay đổi acid amin đó là SNP rs201764637 (p.Arg106His), SNPrs459552 (p.Val1822Asp) và SNP rs534228737 (p.Ile2231Phe). Vai trò của các SNP này cần được làm rõ qua cácnghiên cứu tiếp theo Từ khoá: FAP, gen APC, SNP, giải trình tựABSTRACT MOLECULAR DIAGNOSIS OF FAMILIAL ADENOMATOUS POLYPOSIS (FAP) Nguyen Thi Bang Suong, Nguyen Huu Huy, Le Minh Khoi, Nguyen Trung Tin, Nguyen Hoang Bac * Y Hoc TP. Ho Chi Minh * Vol. 21 - No 3 - 2017: 115 - 119 Background: Familial adenomatous polyposis-FAP is an inherited disorder characterized by the presence lotof adenomatous polyps in the colon, usually over 100 polyps. According to Sheng et al, 100% of patients withuntreated FAP will lead to colon cancer at the age of 35-40. FAP is caused by germline mutations in APC genes.Adenomatous polyposis coli (APC) gene polymorphisms are believed to contribute to tumor susceptibility.However, the association between single-nucleotide polymorphisms (SNP) in the APC gene and colorectal cancer(CRC) susceptibility remains unknown Objective: Applying sequencing methods to detect SNPs of APC gene in FAP patients. Materials and Methods: 63 polyposis patients were recruited in the research. We use the sequencingmethod to detect SNPs in APC genes. Results: In this study, we found 10 SNPs in the APC gene. 7 of 10 SNPs do not change the amino acid * Đại học Y Dược TP.HCM, ** Bệnh viện Đại học Y Dược TPHCM Tác giả liên lạc: TS.BS. Nguyễn Thị Băng Sương ĐT:0914007038 Email: suongnguyenmd@gmail.com 115Nghiên cứu Y học Y Học TP. Hồ Chí Minh * Tập 21 * Số 3 * 2017sequence of a protein so there is no significant change in phenotype. However, there are 3 SNPs that change aminoacid: SNP rs201764637 (p.Arg106His), SNP rs459552 (p.Val1822Asp) and SNP rs534228737 (p.Ile2231Phe).Among them, SNP rs534228737 (p.Ile2231Phe) is associated with a high risk of colorectal cancer. Conclusion: We detected three SNPs that change amino acid: SNP rs201764637 (p.Arg106His), SNPrs459552 (p.Val1822Asp) and SNP rs534228737 (p.Ile2231Phe). Their role should be clarified throughfurther research. Key words: FAP, APC gene, SNP, sequencingĐẶT VẤN ĐỀ được báo cáo(3,2). Xuất phát từ thực tiễn đó, chúng tôi tiến hành đề tài này với mục tiêu: “Xác định Bệnh đa polyp tuyến gia đình (hereditary đa hình đơn nucleotide (SNP) gen APC ở bệnhfamilial adenomatous polyposis: FAP) là một nhân mắc bệnh đa polyp tuyến gia đình”bệnh rối loạn di truyền trội(6). Đa polyp tuyến giađình được đặc trưng bởi sự phát sinh hàng trăm ĐỐITƯỢNG-PHƯƠNGPHÁPNGHIÊNCỨUđến hàng ngàn polyp trong đại trực tràng, hầu Đối tượng nghiên cứuhết là ở tuổi vị thành niên(6,7). Triệu chứng đầu Đây là bệnh hiếm gặp, tỷ lệ mắc bệnhtiên của FAP là tiêu chảy và có máu trong khoảng 1/10.000-1/6000, trong thời gian 2 nămphâ ...