Đa dạng di truyền đoạn siêu biến 1 và đoạn siêu biến 2 trên DNA ty thể của dân tộc Mường ở Việt Nam

Bài viết nghiên cứu đa dạng di truyền đoạn siêu biến 1 và đoạn siêu biến 2 trên DNA ty thể của dân tộc Mường ở Việt Nam thông qua khuếch đại vùng gen HVS-I và HVS-II; phân tích trình tự vùng gen HVS-I và HVS-II. Mời các bạn cùng tham khảo.
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Đa dạng di truyền đoạn siêu biến 1 và đoạn siêu biến 2 trên DNA ty thể của dân tộc Mường ở Việt Nam TCNCYH Phụ trương 91 (5) - 2014 ĐA DẠNG DI TRUYỀN ĐOẠN SIÊU BIẾN 1 VÀ ĐOẠN SIÊU BIẾN 2 TRÊN DNA TY THỂ CỦA DÂN TỘC MƯỜNG Ở VIỆT NAM Nguyễn Thu Thúy, Trần Thúy Hằng, Tạ Thành Văn, Nguyễn Đức Hinh, Trần Vân Khánh Trư ng h YH N ngtr n n n 1 (H r r g nt 1 - H - ) n n 2 (H r r g- nt 2 - H - ) g n t th ư t tr ng ngh n ng ụng tr ng nh g ng tr n t n h n th ngư h n n nh t th g nh g n nh h t th ng Tr ng ngh n n h ng t nh t nh h nh ng g n H - H - tr n 100 ngư nt ư ng ng hương h g tr nh t g n t ngh n t th 22 h gr h gr 1 t nh t 1 h gr 1 10 5 2 9 5 4 4 4 4 2 10 N9 2 H gr 5 1 2 t th nh t h 1 T NP 2 100 15 n C 92 09 n C 59 09 n CC 12 T1 1 9C 2 t n nh g ư ng tr n ng g nH - H - tr n 100 ngư nt ư ng t n h n h nh ng tr nh t ng g n H - H - nt ư ng ư ng n Từ khóa: DNA ty thể, vùng gen HVS - I, vùng gen HVS - II, dân tộc Mường I. ĐẶT VẤN ĐỀ trình tự hoàn chỉnh của bộ gen ty thể đã được công bố không chỉ có các tộc người ở châu Âu và châu Phi mà Bộ gen ty thể của người đã được nghiên cứu từ còn có các tộc người ở khu vực châu Á như Nhật Bản, cách đây hơn 30 năm và được công bố lần đầu tiên vào Trung Quốc, Hàn Quốc, Philippin, Mã Lai và Thái Lan là năm 1981 [1], sau đó được chỉnh sửa lại vào năm 1999 những tộc người có quan hệ chủng tộc và địa lý gần gũi [2]. Đây là bộ gen ty thể của đại diện người da trắng và với người Việt Nam [4 - 8]. được coi là trình tự chuẩn đối chứng. Cho đến nay đã Đề tài được tiến hành với mục tiêu: xác định đa dạng có hàng trăm công trình nghiên cứu về của bộ gen ty thể di truyền của đoạn siêu biến 1 và đoạn siêu biến 2 trên người thuộc các chủng tộc khác nhau đã được công bố. DNA ty thể của dân tộc Mường ở Việt Nam. Bộ gen ty thể người là phân tử DNA có cấu trúc dạng mạch vòng, bao gồm 37 gen với 16 569 bp mã hóa cho II. NGUYÊN LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP 13 polypeptide tham gia vào chuỗi hô hấp tế bào, 22 tRNA và 2 rRNA. Trong đó vùng siêu biến 1 và 2 (HVS - 1. Nguyên liệu I và HVS - II) có trình tự thay đổi theo thời gian và khác - 100 mẫu máu của 100 người dân tộc Mường, sống tại nhau giữa các vùng địa lý [3]. Sự khác biệt về trình tự tỉnh Hòa Bình. của bộ gen ty thể có ý nghĩa quan trọng không chỉ trong - Các hóa chất sử dụng trong nghiên cứu được mua nghiên cứu lịch sử mẫu hệ của con người hiện đại mà của các hãng QIAGEN, Sigma, ABI. còn trong việc xác định các mối quan hệ về chủng tộc 2. Phương pháp và các vùng địa lý khác nhau. Những khác biệt về trình tự mtDNA ở những vùng mã hóa còn cho biết quá trình - 100 mẫu DNA được tách chiết từ các mẫu máu theo chọn lọc tự nhiên có ảnh hưởng quyết định đến quá phương pháp sử dụng enzym protease K và phenol: trình tiến hóa của bộ gen ty thể [3,4]. Các nghiên cứu chloroform: isoamyl alcohol. này cho thấy trình tự DNA ty thể của các chủng tộc - Hai vùng gen HVS - I và HVS - II được khuếch đại khác nhau có những khác biệt nhất định. Trong số các bằng phương pháp PCR, sử dụng các cặp mồi đặc hiệu: HVSI-F: 5’- CTC CAC CAT TAG CAC CCA AAG C -3’ h n h Tr n n h nh Tr ng t Ngh n n- HVSI-R: 5’- CCT GAA GTA GGA ACC AGA TG -3’ Pr t n trư ng h YH N HVSII-F: 5’- GGT CTA TCA CCC TAT TAA CCA C -3’ n h nh h HVSII-R: 5’- CTG TTA AAA GTG CAT ACC GCC A -3’ Ng nh n 2 2014 Thành phần phản ứng PCR (thể tích 20µl) gồm: Ng h th n 1 11 2014 24  TCNCYH Phụ trư ...