Đặc điểm dịch tễ học phân tử của chủng vi khuẩn Acinetobacter baumanii được phân lập tại Bệnh viện Trung ương Huế và Bệnh viện Đại học Y Dược Huế

Acinetobacter baumannii đề kháng carbapenem là tác nhân phổ biến nhất gây nhiễm trùng bệnh viện, được ghi nhận như là một tác nhân đề kháng điều trị và khó kiểm soát. A. baumannii là thành viên quan trọng nhất của nhóm vi khuẩn A. calcoaceticus- A. baumannii (nhóm ACB), nhóm này có đặc điểm di truyền rất gần nhau và không thể phân biệt được bằng các phương pháp định danh dựa vào tính chất sinh hóa. Bài viết trình bày việc định danh loài Acinetobacter sp. từ các chủng thuộc nhóm ACB đã được phân lập và kiểu gen của A. baumannii.
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Đặc điểm dịch tễ học phân tử của chủng vi khuẩn Acinetobacter baumanii được phân lập tại Bệnh viện Trung ương Huế và Bệnh viện Đại học Y Dược HuếTạp chí Y Dược học - Trường Đại học Y Dược Huế - Tập 7, số 5 - tháng 11/2017 ĐẶC ĐIỂM DỊCH TỄ HỌC PHÂN TỬ CỦA CHỦNG VI KHUẨN ACINETOBACTER BAUMANII ĐƯỢC PHÂN LẬP TẠI BỆNH VIỆN TRUNG ƯƠNG HUẾ VÀ BỆNH VIỆN ĐẠI HỌC Y DƯỢC HUẾ Lê Thị Ánh Ngọc1, Lê Nữ Xuân Thanh1, Nguyễn Thị Nam Liên3, Ngô Viết Quỳnh Trâm1, Antonella Santon2, Pietro Cappuccinelli2 (1) Trường Đại học Y Dược - Đại học Huế (2) Trường Đại học Sassari, Ý; (3) Bệnh viện Trung ương Huế Tóm tắt Đặt vấn đề: Acinetobacter baumannii đề kháng carbapenem là tác nhân phổ biến nhất gây nhiễm trùngbệnh viện, được ghi nhận như là một tác nhân đề kháng điều trị và khó kiểm soát. A. baumannii là thànhviên quan trọng nhất của nhóm vi khuẩn A. calcoaceticus- A. baumannii (nhóm ACB), nhóm này có đặc điểmdi truyền rất gần nhau và không thể phân biệt được bằng các phương pháp định danh dựa vào tính chất sinhhóa. Mục tiêu: Định danh loài Acinetobacter sp. từ các chủng thuộc nhóm ACB đã được phân lập và kiểugen của A. baumannii. Phương pháp nghiên cứu: Nghiên cứu mô tả cắt ngang. Đối tượng nghiên cứu là 90chủng vi khuẩn thuộc nhóm ACB được phân lập tại Bệnh viện Đại học Y Dược Huế và Bệnh viện Trung ươngHuế. Thực hiện kỹ thuật PCR đa mồi trên đoạn gen gyrB và giải trình tự đoạn gen rpoB để định danh loài. Xácđịnh mức độ kháng kháng sinh bằng phương pháp Kirby- Bauer. Thực hiện kĩ thuật Multi Locus SequenceType (MLST) cho 24 chủng A. baumannii để xác định kiểu gen. Kết quả: Các loài Acinetobacter sp. được địnhdanh là: A.baumannii (85,6%), A. nosocomialis (11,11%) và A. pittii (3,33%). Tất cả vi khuẩn nhóm ACB nhạycảm với colistin và đề kháng với cefotaxim, amikacin. Hơn 90% các chủng A.baumannii đề kháng với nhómcarbapenem. Mười một kiểu gen của các chủng A.baumannii được xác định; trong số đó có hai kiểu gen mới(ST1463 và ST1464) và 7 kiểu gen thuộc phức hợp dòng vô tính 92 (Clonal Complex 92-CC92), đây là dòngđược phân bố rộng rãi nhất trên thế giới; cả hai bệnh viện đang lưu hành các chủng có kiểu gen tương tựnhau (ST795, ST797 và ST1463). Kết luận: Phối hợp kỹ thuật PCR đa mồi trên gen gyrB và giải trình tự genrpoB cho phép xác định được các loài Acinetobacter sp. Kỹ thuật MLST xác định được 11 kiểu gen từ 24 chủngA.baumannii ở hai bệnh viện ở Huế. Từ khóa: nhóm ACB, Acinetobacter baumannii; MLST. Abstract MOLECULAR CHARACTERIZATION OF ACINETOBACTER BAUMANNII ISOLATES IN HUE CENTRAL HOSPITAL AND HUE UNIVERSITY HOSPITAL Le Thi Anh Ngoc1, Le Nu Xuan Thanh1, Nguyen Thi Nam Lien3, Ngo Viet Quynh Tram1, Antonella Santon2, Pietro Cappuccinelli2 (1) Hue University of Medicine and Pharmacy - Hue University (2) Unversity of Sassari, Italia; (3) Hue Central Hospital Introduction: Acinetobacter baumannii resistant to carbapenem is the most common cause of nosoco-mial infection, they are recognized as one of the most difficult to control and treat resistant agents. A. bau-mannii is the most important member of A. calcoaceticus- A. baumannii complex (ACB complex), which areclosely related genetically then biochemical test systems are not able to identify unambiguously genomicspecies. Objective: To identify species of Acinetobacter sp. strains of ACB complex and sequence types of A.baumannii strains. Methods: Cross- sectional study. The subjects were 90 strains of ACB complex isolated andidentified by biochemical methods at Hue University Hospital (UH) and Hue Central Hospital (CH). Perform-ing the multiplex PCRs on the target gene gyrB and sequencing rpoB gene to identify species. Determining ofantibiotic resistance by Kirby-Bauer method. Multi Locus Sequence Type (MLST) method was performed for24 strains of A. baumannii to identify sequence types. Results: Acinetobacter sp. were identified as A.bau- - Địa chỉ liên hệ: Lê Thị Ánh Ngọc, email: thiensu21989@gmail.com DOI: 10.34071/jmp.2017.5.26 - Ngày nhận bài: 5/10/2017; Ngày đồng ý đăng: 9/11/2017; Ngày xuất bản: 16/11/2017 190 JOURNAL OF MEDICINE AND PHARMACY Tạp chí Y Dược học - Trường Đại học Y Dược Huế - Tập 7, số 5 - tháng 11/2017mannii (85.6%), A. nosocomialis (11.11%) and A. pittii (3.33%). All strains of ACB complex were sensitiveto colistin and resistant to cefotaxime, amikacin. More than 90% of A.baumannii strains were resistant tocarbapenem. Eleven sequence types (STs) of A.baumannii strains were identified; two of them were news(ST1463 and ST1464) and seven STs belonged to the Clonal Complex 92 (CC92), the most globally distributedclones; the ST795, ST797 and ST1463 are circulating in both of hospitals. Conclusion: Combining multiplexPCRs on the target gene gyrB and sequencing rpoB gene have shown to be adequate for Acinetobacter sp.identification. MLST identified 11 sequence types from 24 A.baumannii isolates at two hospital in Hue. Key words: ACB complex, Acinetobacter baumannii; MLST. 1. ĐẶT VẤN ĐỀ phục vụ công tác nghiên cứu, kiểm soát nhiễm trùng Trực khuẩn gram âm Acinetobacter baumannii và điều trị.là tác nhân gây nhiễm trùng bệnh viện quan trọng Để góp phần hiểu rõ hơn về dịch ...