Luận văn : THU THẬP VÀ TỔ CHỨC DỮ LIỆU GENE PHỤC VỤ NGHIÊN CỨU CÂY TRỒNG BIẾN ĐỔI DI TRUYỀN part 7

Hiện tại chúng tôi chưa đưa ra được phương án hoàn hảo cho việc chọn lọc thông tin, vì thế dữ liệu hiện nay của chúng tôi vừa thiếu vừa dư thừa không kiểm soát được. Hoàn thiện việc áp dụng công nghệ Hibernate để xây dựng cơ sở dữ liệu cho đề tài. 2. Cần có thời gian nữa để hoàn thiện sản phẩm
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Luận văn : THU THẬP VÀ TỔ CHỨC DỮ LIỆU GENE PHỤC VỤ NGHIÊN CỨU CÂY TRỒNG BIẾN ĐỔI DI TRUYỀN part 7PHẦN E: KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ 119II. ĐỀ NGHỊ 1. Có biện pháp lọc dữ liệu tốt hơn và tổ chức dữ liệu hợp lý hơn Hiện tại chúng tôi chưa đưa ra được phương án hoàn hảo cho việc chọn lọcthông tin, vì thế dữ liệu hiện nay của chúng tôi vừa thiếu vừa dư thừa không kiểm soátđược. Hoàn thiện việc áp dụng công nghệ Hibernate để xây dựng cơ sở dữ liệu cho đềtài. 2. Cần có thời gian nữa để hoàn thiện sản phẩm Do thời gian có hạn và kiến thức cần để hoàn thành đề tài còn nhiều, chủ yếu làcác kiến thức về công nghệ thông tin nên sản phẩm hiện này chỉ dừng ở mức tìm kiếmdữ liệu bằng keyword có thể chưa làm hài lòng người dùng. Trong tương lai có thểphát triển thêm các hình thức tìm kiếm khác như: o Tạo các chọn lựa theo qui định, giúp người dùng lấy được thông tin cần thiết một cách nhanh chóng nhất. o Tích hợp công cụ tìm kiếm trình tự như BLAST, giúp người dùng tìm được trình tự mong muốn thông qua trình tự mình đang có. Ngoài ra sẽ phát triển thêm các công cụ phân tích trình tự như Clustalw,Readseq…hỗ trợ thao tác đối với trình tự cho người dùng. Toàn bộ giao diện của chương trình đều sử dụng tiếng Anh. Để mở rộng phạmvi sử dụng sau này, chúng tôi sẽ phát triển phiên bản song ngữ Anh – Việt, trang sửdụng tiếng Việt sẽ giúp các nhà Sinh học trong nước dễ dàng sử dụng, trang tiếng Anhsẽ tạo tiền đề cho việc hợp tác quốc tế sau này trong lĩnh vực Bioinformatics. Đề tài sẽ còn phát triển xa hơn nữa nếu được đầu tư. Như ta có thể xây dựngthêm các cơ sở dữ liệu khác cũng liên quan đến cây trồng biến đổi di truyền như: o Cơ sở dữ liệu các vector dùng trong chuyển gene vào thực vật. o Cơ sở dữ liệu primer dùng trong chẩn đoán GMO. o Xây dựng cơ sở dữ liệu cho tất cả các gene chỉ thị (Marker Genes) dùng trong quá trình chuyển gene. 3. Vấn đề quan tâm khác Trong quá trình tìm hiểu các cơ sở dữ liệu trình tự GenBank/EMBL/DDBJ chúngtôi nhận thấy các cơ sở dữ liệu này tiến hành tổ chức lưu trữ trình tự của tất cả các nhàNGUYỄN KỲ TRUNG – LÊ THÀNH TRUNGPHẦN E: KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ 120nghiên cứu trên thế giới. Việc một trình tự được chấp nhận phải qua đánh giá rấtnghiêm ngặt của hội đồng thẩm định. Hiện nay trung tâm Phân Tích đã tiến hành giải trình tự các sản phẩm PCR củacác nghiên cứu sinh học phân tử. Việc giải trình tự này có thể hoàn hảo hay không, tuynhiên các kết quả này cần cho tham khảo so sánh giữa các lần thí nghiệm hay giữa thínghiệm của người này với người khác. Các trình tự này chưa thể được lưu giữ trong cơsở dữ liệu thế giới. Vì vậy cần có một nơi tổ chức lưu trữ các trình tự này, đồng thờicung cấp các công cụ cần thiết giúp các nhà nghiên cứu thuận lợi hơn trong việc thaotác với các trình tự này.NGUYỄN KỲ TRUNG – LÊ THÀNH TRUNGTài liệu tham khảo 121 TÀI LIỆU THAM KHẢOTIẾNG VIỆT 1. Cao Thị Ngọc Phượng, 2003. Tài liệu cơ sở dữ liệu. Đại học Khoa Học Tự Nhiên, 22 trang. 2. Bùi Trang Việt, 2002. Sinh học phân tử (Giáo trình cao học). ĐH Quốc gia TP HCM. 3. Nguyễn Hồng Minh Ngọc, 2004. Hoàn thiện phương pháp chẩn đoán nông sản chuyển gen dựa trên kỹ thuật PCR. Khóa luận tốt nghiệp Kỹ sư Nông học, Đại học Nông Lâm TpHCM, Việt Nam. 4. Nguyễn Hữu Hổ, 2004. Công nghệ gene thực vật. Viện sinh học nhiệt đới TP HCM. 5. Trần Hiếu Thuận, 2003. Tài liệu lập trình Perl. Đại Học Khoa Học Tự Nhiên, 22 trang. 6. Trần Linh Thước, 2002. Thực tập Bioinformatics. Đại Học Khoa Học Tự Nhiên, 64 trang. 7. Trần Văn Cách, 2005. Tin – Sinh Học. Nhà xuất bản Khoa Học Kỹ Thuật, 144 trang.TIẾNG NƢỚC NGOÀI 8. Baldi, Pierre and Brunak, Soren ., 2001. Bioinformatics. The Machine Learning Approach. A Bradford Book, The MIT Press, Cambridge, Massachusetts, London, England. 9. Barnes, R. Michael and Gray, C.Ian, 2003. Bioinformatics for Geneticists. John Wiley & Sons Ltd, (411 pages). 10. Baxevanis, D. Andreas., Francis Ouellette, B.F. Bioinformatics – A Practical Guide to the Analysis of Gene and Proteins. Wiley Publishing, Inc. 11. Blast-Helpgroup, 2004. NCBI User Service. BLAST Program Selection Guide. NCBI, NLM, NIH, 8600 Rockville Pike, Bethesda, MD 20894.NGUYỄN KỲ TRUNG – LÊ THÀNH TRUNGTài liệu tham khảo 122 12. Borém, Aluízio., Santos, R. Fabrício., Bowen, E.David., 2003. Understanding Biotechnology. Prentice Hall PTR, 240 pages. 13. Claverie, Jean-Michel., Notredame Cedric., 2003. Bioinformatics for Dummies. ...