Xây dựng cây phát sinh chủng loại của loài tảo Pseudonitzschia sp. G3 được phân lập ở thành phố Hải Phòng dựa trên trình tự Nucleotit của đoạn gien ITS1-5,8 S-ITS2

Bài viết trình bày xây dựng cây phát sinh chủng loại của loài tảo Pseudonitzschia sp. G3 được phân lập ở thành phố Hải Phòng dựa tren tình tự Nucleotit của đoạn gien ITS1-5,8 S-ITS2 góp phần khẳng định vai trò của sinh học phân tử trong việc hỗ trợ phương pháp phân loại tảo truyền thống dựa vào hình thái.
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Xây dựng cây phát sinh chủng loại của loài tảo Pseudonitzschia sp. G3 được phân lập ở thành phố Hải Phòng dựa trên trình tự Nucleotit của đoạn gien ITS1-5,8 S-ITS228(4): 68-73 T¹p chÝ Sinh häc 12-2006 X©y dùng c©y ph¸t sinh chñng lo¹i cña loµi t¶oPseudonitzschia sp.G3 ®−îc ph©n lËp ë thµnh phè H¶i phßng dùa trªn tr×nh tù nucleotit cña ®o¹n gien ITS1- 5,8 S-ITS2 Hoµng ThÞ Lan Anh, §Æng DiÔm Hång ViÖn C«ng nghÖ sinh häc Chu V¨n Thuéc ViÖn Tµi nguyªn vµ M«i tr−êng biÓn HiÖn nay, t¶o ®éc ®ang lµ mèi quan t©m s¸nh tr×nh tù nucleotit cña ®o¹n gien ITS1-5,8S-hµng ®Çu cña ngµnh nu«i trång thñy h¶i s¶n bëi ITS2 ®ang ®−îc sö dông réng r·i trong viÖcnh÷ng thiÖt h¹i do chóng g©y ra −íc tÝnh lªn tíi nghiªn cøu ph¸t sinh chñng lo¹i cña t¶o nãihµng triÖu ®« la Mü mçi n¨m [3]. NhiÒu loµi chung vµ cña chi Pseudonitzschia nãi riªng, bëit¶o ®· ®−îc kh¼ng ®Þnh lµ nguån gèc sinh ra ®©y lµ vïng x¶y ra nhiÒu biÕn ®æi ®Æc tr−ng choc¸c ®éc tè ®e do¹ tµn ph¸ khu hÖ ®éng thùc vËt loµi trong qu¸ tr×nh tiÕn hãa [1, 3, 5, 6, 8]. Víivµ ¶nh h−ëng nghiªm träng tíi søc kháe cña mÉu nghiªn cøu lµ loµi Pseudonitzschia sp.G3con ng−êi. §Ó gi¶m thiÓu nh÷ng t¸c h¹i do t¶o ®−îc ph©n lËp ë §å S¬n thuéc thµnh phè H¶i®éc g©y ra, vÊn ®Ò gi¸m s¸t cÇn ®−îc tiÕn hµnh Phßng, chóng t«i ®· tiÕn hµnh ®Þnh tªn b»ngth−êng xuyªn vµ réng kh¾p. ë n−íc ta, viÖc ph−¬ng ph¸p quan s¸t h×nh th¸i vµ ph©n tÝchnghiªn cøu t¶o ®éc míi ®−îc tiÕn hµnh mét vµi tr×nh tù nucleotit cña ®o¹n gien ITS1-5,8S-ITS2.n¨m gÇn ®©y. Theo thèng kª cña Lasen vµ cs. Nh÷ng kÕt qu¶ thu ®−îc ®· gãp phÇn kh¼ng ®Þnh(2004), trong sè trªn 70 loµi t¶o cã kh¶ n¨ng vai trß cña sinh häc ph©n tö trong viÖc hç trîg©y ®éc ®−îc x¸c ®Þnh ph©n bè ë c¸c vïng ven ph−¬ng ph¸p ph©n lo¹i t¶o truyÒn thèng dùa vµobiÓn ViÖt Nam, cã 11 loµi t¶o silic thuéc chi h×nh th¸i.Pseudonitzschia ®· ®−îc m« t¶, trong ®ã 2 loµiPseudonitzschia pungens vµ P. calliantha ®−îc I. Ph−¬ng ph¸p nghiªn cøuxem lµ nh÷ng loµi chiÕm −u thÕ, cã sù tÝch tôtiÒm tµng ®éc tè axit domoic g©y héi chøng ngé 1. VËt liÖu®éc mÊt trÝ nhí t¹m thêi (ASP-amnesic shellfish - VËt mÉu cña loµi t¶o Pseudonitzschiapoisoning) trong c¸c loµi ®éng vËt th©n mÒm hai sp.G3 do ViÖn Tµi nguyªn vµ M«i tr−êng biÓnm¶nh vá [7]. Chi Pseudonitzschia b¾t ®Çu ®−îc H¶i Phßng ph©n lËp vµ cung cÊp, ®−îc nu«i cÊyquan t©m nhiÒu h¬n kÓ tõ khi ph¸t hiÖn ra axit trªn m«i tr−êng K cã nång ®é muèi 24‰, ëdomoic do loµi P. multiseries sinh ra lµm 153 nhiÖt ®é 25oC ®Ó thu sinh khèi cho b−íc t¸chng−êi trªn ®¶o Hoµng tö Edward (Canada) bÞ chiÕt ADN.ngé ®éc vµ theo con sè thèng kª gÇn ®©y, ®· - Tr×nh tù nucleotit cña ®o¹n gien ITS1-ph¸t hiÖn trªn thÕ giíi cã 10 loµi thuéc chi nµy 5,8S-ITS2 cña 12 loµi thuéc chi Pseudonitzschiacã kh¶ n¨ng sinh ra axit domoic, g©y ¶nh bao gåm: Pseudonitzschia pungens (Grunow exh−ëng tíi hÖ tiªu hãa, hÖ thÇn kinh vµ cã thÓ P. T. Cleve) Hasle 1993 cã sè ®¨ng ký t¹i Ng©ng©y tö vong cho ng−êi [2, 4, 7]. Do vËy, viÖc hµng gien quèc tÕ lµ AY544769, Pseudonitzschiaph¸t hiÖn sù cã mÆt cña c¸c loµi trong chi t¶onµy trong c¸c thñy vùc, ®Ó ®−a ra c¸c biÖn ph¸p sp..Hobart5 (AY257851), P. australis Frenguellinh»m gi¶m thiÓu t¸c h¹i cña chóng lµ rÊt quan (ay452528), P. calliantha Lundholm, Moestrupträng. et Hasle 2003 (AY257857), P. cf. australis HiÖn nay trªn thÕ giíi, trong ph©n lo¹i t¶o, Frenguelli (AY559850), P. cf. subpacifica (Hasle)c¸c kü thuËt sinh häc ph©n tö nh− ®äc vµ so Hasle (AY257860), P. cuspidata (Hasle) Hasle681993 (AY257853), P. delicatissima (P. T. Cleve) II. KÕt qu¶ vµ th¶o luËnHeiden 1928 (AY257849), P. fraudulenta (P. T. 1. M« t¶ h×nh th¸i cña loµi t¶o Pseudo-Cleve) Hasle (AY257840), P. galaxiae Lundholm nitzschia sp.G3 ®−îc ph©n lËp t¹i H¶iet Moestrup (AY257850), P. micropora Priisholm Phßnget Moestrup 2002 (AY257847) vµ P. multiseries(Hasle) Hasle (AY257844) ®−îc sö dông ®Ó x©ydùng c©y ph¸t sinh chñng lo¹i. - TOPO Kit của h·ng Invitrogen (Mỹ)dïng để t¸ch dßng gien.2. Ph−¬ng ph¸p - ADN tæng sè cña loµi Pseudonitzschiasp.G3 ®−îc t¸ch chiÕt theo ph−¬ng ph¸p cña Y.K. Hong cã c¶i tiÕn cho phï hîp víi ®iÒu kiÖncña ViÖt Nam [5]. - §o¹n gien ITS1-5,8S-ITS2 ®−îc nh©n b»ngkü thuËt PCR tõ ADN tæng sè v ...