Đa hình gen GH, IGFBP, PIT1 ở giống gà liên minh

Mục tiêu của nghiên cứu này là phân tích các đa hình nucleotide đơn (SNPs) của các gen ứng viên, liên quan đến các đặc điểm sinh trưởng ở gà. 100 cá thể gà Liên Minh được đánh giá tần số alen/kiểu gen tại ba SNPs gồm: Gen mã hóa hormone sinh trưởng gà (GHi3), protein liên kết với yếu tố sinh trưởng giống Insulin (IGFBP2) và yếu tố phiên mã đặc hiệu tuyến yên (PIT1).
Nội dung trích xuất từ tài liệu:
Đa hình gen GH, IGFBP, PIT1 ở giống gà liên minh DI TRUYỀN - GIỐNG VẬT NUÔI ĐA HÌNH GEN GH, IGFBP, PIT1 Ở GIỐNG GÀ LIÊN MINH Trần Thị Bình Nguyên1*, Nguyễn Thị Thanh Trà1, Phạm Thu Giang1, Lê Công Toán1, 2 Nguyễn Hữu Đức, Nguyễn Thị Diệu Thúy2, Nguyễn Mạnh Linh3, Hoàng Thị Yến4, Vũ Công Quý4, Vũ Đức Quý5 và Nguyễn Thanh Huyền1 Ngày nhận bài báo: 28/09/2019 - Ngày nhận bài phản biện: 19/10/2019 Ngày bài báo được chấp nhận đăng: 04/12/2019 TÓM TẮT Gà Liên Minh là giống gà bản địa, mang nhiều đặc tính quý, thịt thơm ngon, gắn liền với sự phát triển kinh tế của người dân thôn Liên Minh, xã Trân Châu, huyện Cát Hải, thành phố Hải Phòng. Tuy nhiên khả năng sinh trưởng của gà Liên Minh hạn chế hơn so với các giống gà công nghiệp hướng thịt khác. Mục tiêu của nghiên cứu này là phân tích các đa hình nucleotide đơn (SNPs) của các gen ứng viên, liên quan đến các đặc điểm sinh trưởng ở gà. 100 cá thể gà Liên Minh được đánh giá tần số alen/kiểu gen tại ba SNPs gồm: Gen mã hóa hormone sinh trưởng gà (GHi3), protein liên kết với yếu tố sinh trưởng giống Insulin (IGFBP2) và yếu tố phiên mã đặc hiệu tuyến yên (PIT1). Các mẫu máu được sử dụng để chiết xuất ADN và xác định kiểu gen bằng phương pháp PCR-RFLP. Các tần số alen thu được như sau: 0,97 (alen A) và 0,03 (alen G) thuộc gen GHi3; 0,47 (alen A) và 0,53 (alen G) thuộc gen IGFBP2; và 100% xuất hiện alen B tại gen PIT1. Các kiểu gen tại ba vị trí được nghiên cứu (GHi3, PIT1 và IGFBP2) phân bố tuân theo định luật Hardy- Weinberg. Đây là những kết quả ban đầu nhằm phân tích mối tương quan giữa các chỉ thị ADN và đặc điểm sinh trưởng ở gà Liên Minh. Từ khóa: Đa hình nucleotide đơn, gen ứng viên, PCR-RFLP, gà Liên Minh. ABSTRACT Genetic Polymorphism in GH, IGFBP and PIT genes of indigenous Lien Minh chickens Lien Minh Chicken is an indigenous breed, with many good characteristics, the meat quality is excellent, and contributes to the economic development of rural citizens of Lien Minh Village, Tran Chau Commune, Cat Hai District (Cat Ba Island), Hai Phong City. However, the growth rate of Lien Minh chickens is slower than other high-yield industrial breeds. The objective of the current research was to investigate the single nucleotide polymorphisms (SNPs) of candidate genes, which might be associated with growing traits. 100 Lien Minh chicken individuals were genotyped for three SNPs of chicken Growth hormone (GHi3), Insulin-like growth factor-binding protein (IGFBP2) and Pituitary-specific transcription factor (PIT1) genes. Blood samples were used for DNA extraction and then for genotyping by the PCR-RFLP method. The allele frequencies obtained were as follows: 0.97 and 0.03 for alleles A and G (GHi3), respectively; in IGFBP2, 0.47 for the A allele and 0.53 for G; in PIT1, 100% for allele B. These polymorphic loci (GHi3, PIT1 and IGFBP2) were followed Hardy-Weinberg equilibrium in the Lien Minh chicken population. These were the initial results, which could be used to analyze the correlation of molecular markers and grow traits in Lien Minh chickens. Keywords: Single nucleotide polymorphisms, candidate genes, PCR-RFLP, Lien Minh chicken.1 Học viện Nông nghiệp Việt Nam2 Viện Công nghệ sinh học-Viện Hàn lâm KHCN Việt Nam3 Viện Tài nguyên và Môi trường Biển4 Sở Khoa học và Công nghệ Hải Phòng5 University of the Chinese Academy of Sciences* Tác giả liên hệ: ThS Trần Thị Bình Nguyên, Khoa Công nghệ sinh học, Học viện Nông nghiệp Việt Nam; ĐT: 0944661010;Email: binhnguyencnsh@gmail.com8 KHKT Chăn nuôi số 255 - tháng 3 năm 2020DI TRUYỀN - GIỐNG VẬT NUÔI1. ĐẶT VẤN ĐỀ suất và đặc điểm chất lượng thịt, mức tăng trung bình hàng ngày ở gà bản địa trên thế Gà Liên Minh là giống gà bản địa có đặc giới (Nie và ctv, 2005; Lei và ctv, 2007; Nie vàđiểm đẹp về ngoại hình và màu sắc lông, da ctv, 2008; Bhattacharya và ctv, 2012; Khoa vàvàng, phẩm chất thịt thơm ngon. Giống gà bản ctv, 2012; Mehdi và ctv, 2014; Nguyen và ctv,địa này đã được Viện Chăn nuôi đưa vào danh 2015; Kazemi và ctv, 2018). Để góp phần vàomục nghiên cứu, bảo tồn vật nuôi quý hiếm. ...